郑磊教授:基于细胞外囊泡的生物学技术及治疗方法研究前沿(二)

PDVLNs是一类从植物中提取的天然纳米载体,它们含有脂质、蛋白质、DNA和microRNA,能够进入哺乳动物细胞并调节细胞活性。这些纳米颗粒在免疫调节、肠道微生物调节以及抗氧化应激方面显示出显著的潜力,同时也有助于克服药物耐药性。由于免疫功能、肠道微生物和抗氧化应激是IBD和CAC治疗中的关键目标,PDVLNs的出现或为这些疾病...

神经耳朵聋治疗方法有哪些药

核心提示:神经耳朵聋的治疗方法包括甲钴胺、谷维素、维生素B1、银杏叶提取物、脑蛋白水解物等药物。由于神经性耳聋可能影响听力,建议及时就医以评估病情并接受专业治疗。1.甲钴胺甲钴胺适用于治疗周围神经病变引起的神经耳朵聋的治疗方法包括甲钴胺、谷维素、维生素B1、银杏叶提取物、脑蛋白水解物等药物。由于神经性耳聋...

从结构准确预测蛋白质功能,东北大学「CNN+GCN」统一框架

开发一种准确有效的蛋白质功能预测方法至关重要。当前预测蛋白质功能的方法主要集中在三个领域:蛋白质序列、蛋白质结构和蛋白质-蛋白质相互作用网络。当前针对蛋白质结构的方法很少,通常单独使用卷积神经网络(CNN)或图卷积网络(GCN)。单独使用CNN或GCN存在以下问题:使用CNN时可能会发生信息丢失,因为它们的...

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?

通过使用行为分析、遗传工具、神经成像和CRISPR基因编辑等技术,研究发现果蝇大脑中的关键神经节点在多个物种中是保守的,但这些节点能够灵活地响应不同的感官信号,例如D.melanogaster果蝇通过感知一种特定信息素,而D.yakuba果蝇则能在黑暗中通过7-三十碳烯(7-tricosene,一种化学信号)找到配偶。研究表明,外周神经回路...

清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法

基于结构的方法如GraphBind利用图神经网络(GNN)来提取蛋白的序列和结构特征,并以此来识别蛋白质分子中哪些氨基酸残基与核酸的结合位置。然而基于结构的方法需要准确的蛋白质结构作为模型的输入,因此,目前基于蛋白质序列的DNA结合位点的预测仍然是一个具有挑战性的问题。

精度媲美AlphaFold,EPFL的AI方法从序列中匹配蛋白质互作

基于这些,研究人员提出了使用基于对齐的语言模型(DiffPALM)的可微分配对,这是一种使用MLM预测同源词匹配的可微分方法(www.e993.com)2024年11月3日。图示:DiffPALM在小型HK-RRMSA上的性能。(来源:论文)在从普遍存在的原核生物蛋白质数据集中提取的浅层MSA的困难基准测试中,它的表现远胜于现有的协同进化方法。当提供已知的相互作用...

一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识

MALDI-TOFMS鉴定前处理的主要目的是灭活病原微生物、破坏其细胞壁及提取胞内蛋白质。不同类型微生物细胞壁的结构和成分不同,破壁难易程度有别,从而直接影响蛋白质释放。因此需要选择适当的前处理流程,主要包括:直接涂抹法、原位甲酸提取法、甲酸乙腈提取法、双甲酸法等多种方法[6],图1中总结了不同类型微...

IP与质谱方法比较:深度解读蛋白质组学样本

质谱是一种通过测量离子的质量和相对丰度来确定化合物的方法。在蛋白质组学研究中,质谱被广泛应用于蛋白质的鉴定和定量。质谱方法通常包括以下几个步骤:1.样品制备:将样品进行蛋白质提取和消化,得到蛋白质片段。2.质谱分析:将蛋白质片段通过质谱仪进行离子化,并测量离子的质量和相对丰度。

上海交大洪亮课题组发表基于微环境感知图神经网络构建指导蛋白质...

一种直接的方式是类似图片处理类任务中常用的预处理方法,对输入数据进行增强。对于结构数据来说,另一种方式是针对性地设计等变神经网络,把蛋白质图的节点特征、连接方式,以及三维坐标都输入进模型,通过一系列具有等变性的信息传导网络层,对数据特征进行提取与更新。

90%的肾友补充蛋白的方法都是错的

很多肾友一听到医生说营养不良,血清白蛋白低,首先就想到补充乳清蛋白,那到底什么是乳清蛋白?乳清蛋白是从鲜牛乳中提取的一种优质蛋白,所含必需氨基酸种类齐全、数量充足、比例合适,是营养价值最高的一种蛋白,堪称“蛋白之王”。相比较其他蛋白,乳清蛋白的生物利用率最高,更易被人体吸收和消化,具有很高的营养价...