突破!AI填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制,促进...
近日,来自哥本哈根大学、圣裘德儿童研究医院和伊利诺伊理工学院的研究团队,推出了一种设计具有特定结构性质的蛋白质变体的通用算法,将蛋白质的研究拓展到了固有无序蛋白(IDPs)领域。IDPs是一种无法折叠成稳定或有序三维结构的蛋白质,被认为在健康系统和各种疾病的病理生理学中都具有重要的生物学意义。与折叠的蛋白质...
弯道超车!师兄仅用 10 毫克样本发了篇癌症顶刊,蛋白组学还能这样做
具体包括小分子和蛋白质相互作用组学,新靶标发现及药物开发,蛋白质稳态和修饰,硒蛋白质组学,以及衰老和衰老相关疾病的重要生物学事件和机制。发表通信作者研究论文在CellChemicalBiology、NatureCommunications、JACSAu、MolecularCellularProteomics、AnalyticalChemistry等期刊,过去5年论文引用合计3400余次(G...
Cell Rep:揭示一种特殊蛋白在癌症疗法中的双重角色
研究人员发现,肿瘤细胞中IRF1的存在实际上能通过促进T细胞的耗竭和影响toll样受体和I型干扰素反应来削弱宿主机体的免疫反应,这一点之所以会发生,因为肿瘤细胞中的IRF1能增加多种免疫检查点的水平,包括IDO-1和PD-L1,这些蛋白质能抑制T细胞的活性,并能改变参与抗原呈递的蛋白质的表达。然而,IRF1对于免疫细胞的发育、招募...
关于内参蛋白Actin,那些你不知道的事儿
目前,关于肌动蛋白的翻译后修饰(PTM)研究也越来越多,PTM是高度动态且通常可逆的过程,其中蛋白质的功能特性能够通过在其氨基酸残基上添加化学基团或另一种蛋白质而改变。肌动蛋白是PTMs的主要底物,它可以经历至少17个PTMs,包括ADP-ribosylation、arginylation、dimethylation、phosphorylation、oxidation、nitration、O-GlcNAc...
北京大学深圳研究生院蛋白质组学和蛋白质翻译后修饰实验室招聘...
1)开发高灵敏度蛋白质组学鉴定和定量策略,并深入探索“蛋白质暗物质组学”;2)蛋白质翻译后修饰的调控机制和功能;3)基于活性天然产物的药物开发和肽段药物开发。课题组详细信息和研究方向请见课题组网站:httpsweb.pkusz.edu/jinjungaolab/
Nature子刊:黄硕团队首次通过纳米孔实现20种蛋白质氨基酸和翻译后...
该纳米孔传感器还可以在分辨20种氨基酸的同时直接分辨翻译后修饰(如磷酸化、甲基化、糖基化、乙酰化),对纳米孔蛋白质测序和翻译后修饰的测序检测具有里程碑意义(www.e993.com)2024年9月7日。图3:机器学习辅助20种天然氨基酸及4种修饰氨基酸的识别南京大学化学化工学院博士生王可凡、张善雨,南京大学物理学院博士生周骁为该论文共同第一作者,黄硕...
案例分享 | Monolith分子互作仪助力蛋白质脂化修饰研究
蛋白质脂化在几乎所有与膜相关的生物学途径中都起着核心作用,例如细胞信号传导、蛋白质分泌、细胞死亡和免疫。然而,由于脂化是高度可变的,可逆的,并且经常与其他蛋白质翻译后修饰相互交叉影响,大多数蛋白脂化的生理功能仍然不明确,常见的功能缺失诱变方法对于探索蛋白质脂化往往效果不佳。
...丁霖、谢然课题组工作:无痕蛋白质选择性聚糖编辑和化学修饰
图1LPG的构建以及无痕聚糖编辑和化学修饰为了证明LPG策略以蛋白选择性进行聚糖修饰,我们将靶蛋白阳性和阴性的两种细胞共培养,结果表明可以选择性标记阳性细胞。质谱结果也验证了该标记策略具有理想的蛋白选择性(图2)。图2RPG对靶蛋白进行选择性聚糖修饰...
国自然:热门的蛋白翻译后修饰(糖基化、SUMO化)标书撰写技巧教学
SENP1:是一种去SUMO化酶,负责SUMO(小分子泛素样修饰蛋白)修饰蛋白的去SUMO化作用,影响蛋白质的定位、稳定性和活性。MSH6:是错配修复(MMR)系统的一部分,参与DNA复制过程中错误碱基对的修复,维护基因组稳定性。分子修饰O-GlcNAc糖基化修饰:是一种动态可逆的糖基化修饰过程,涉及将N-乙酰葡萄糖胺...
国内Nature,Cell三连发:翻译后修饰研究如何花式发顶刊
单磷酸腺苷酸化修饰(AMPylation)是一种广泛存在于原核和真核生物中的蛋白质翻译后修饰,在腺苷酸化酶的催化下,使用单磷酸腺苷基团(AMP)修饰蛋白质的氨基酸侧链。本文报道了使用三磷酸腺苷(ATP)作为配体和宿主肌动蛋白作为激活剂,嗜肺军团杆菌的效应蛋白LnaB对PR-Ub上的磷酸核糖基的磷酰基进行AMPylation,从而生成ADPR-...