...Scaling Law,Evo荣登Science封面!AI设计DNA/RNA/蛋白质再突破

其次,很多蛋白质结构预测的可信度较低,偏向于进化上较简单的α-螺旋型二级结构,且与自然蛋白质代表性数据库中的任何条目的结构匹配度有限。目前能力有限,未来潜力无限一个能在基因组层面设计的模型,显然有潜力推进治疗发现,拓宽我们对基础生物学的理解。现在,球基因组与健康联盟(GA4GH)已制定了基因工程技术监管...

想改造蛋白质?交给人工智能吧

自然界中参与构成蛋白质的氨基酸有20种,一个蛋白质分子一般由几十个乃至数百个氨基酸组成,这些氨基酸按照一定序列连接肽链,一条或多条肽链遵循某些规律折叠才能得到蛋白质。不难发现,即使只改变序列中某一个特定的氨基酸,也有19种选择。而随着想改变的氨基酸数量增加,可选方案的数量指数级增长,找到理想方案无异于大海...

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?

研究团队利用大规模数据库中的脑结构和功能数据,对超过300种大脑功能和多个脑区的结构-功能关系进行了计算和分析。他们发现,结构-功能的对应性在不同脑区表现出显著差异。在初级感觉和运动皮层,结构与功能的耦合关系较为紧密,尤其是在处理感知和运动功能时;而在联合皮层,该对应性较弱,反映出复杂认知功能对直接神经连...

生成394,760种蛋白质表征,哈佛开发AI模型,全面理解蛋白质上下文

通过PINNACLE生成的394,760个情境化蛋白质表示,其中每个蛋白质表示都具有细胞类型特异性,研究人员证明了PINNACLE能够将蛋白质相互作用与156种细胞类型情境的底层蛋白质编码基因转录组相结合。PINNACLE的嵌入空间反映了细胞和组织结构,从而实现了组织层次结构的零样本检索。预训练的蛋白质表征可以适应下游任务:增...

中国成人肥胖指南_减肥知识库_39健康网

膳食中蛋白质、脂肪和碳水化合物摄入的比例合理,特别要减少脂肪摄入量,增加蔬菜和水果在食物中的比例。在工作和休闲时间,有意识地多进行中、低强度的体力活动。广为传播健康的生活方式,戒烟、限酒和限盐。经常注意自己的体重,预防体重增长过多、过快。成年后的体重增长最好控制在5公斤以内,超过10公斤则相关疾病危险...

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴

负责运送氧气的血红蛋白是蛋白质;帮助我们消化食物的消化酶是蛋白质;胰岛素、甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由20种氨基酸通过不同的排列组合而构成,譬如胰岛素就是由16种、...

又一突破性成果!人工智能大模型预测蛋白质结构速度再次提高数百倍!

人体内约有10万种以上的蛋白质,被科学家解析过三维结构的少之又少,为了对大量未知的蛋白质展开研究,必须发明全新的方法,比如,在搞清蛋白质的一级结构之后,就利用人工智能对它的二级、三级、四级结构进行预测。2018年,人工智能正式参与蛋白质三维结构的预测,在其中大显身手,它速度极快,能用几天甚至仅仅几分钟就...

新技术助力蛋白质二级结构测定领域拓展

蛋白质的结构可以分为四个层次,其中二级结构是指蛋白质中氨基酸残基之间的局部空间排列方式。准确测定蛋白质的二级结构对于理解蛋白质的功能和性质具有重要意义。近年来,随着科技的不断进步,新技术的应用为蛋白质二级结构的测定提供了更多的可能性。本文将介绍一些新技术在蛋白质二级结构测定领域的应用,并探讨其对该领域...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

蛋白质以氨基酸为基本组成单位,氨基酸的不同排列(即序列)以及在此基础上的卷曲折叠,形成了特定的三维立体结构,进而执行不同的功能。人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上可能存在的蛋白质数量会达到约10^1300,比整个宇宙中的原子数量还要多...

Nat. Methods. 速递:考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型

鉴于此,来自哈佛大学的MarinkaZitnik教授团队开发了一种考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型——PINNACLE,通过结合单细胞转录组数据、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、细胞相互作用和组织层次数据,为每个蛋白质生成细胞类型特异的低维表示,该模型生成的结果能够显著增强之前仅通过蛋白三维结构得到的通用表示,...