...刘学军教授等:具有抑制酪氨酸酶活性乳酸菌的筛选及其成分分析
由图4可知,测序菌株MNJ-9的目的片段序列为1200bp。利用BLAST软件,从GenBank中选择10个菌株的16SrDNA基因序列,利用MEGA5软件构建系统发育树,结果见图5,菌株MNJ-9与NR114742.1EnterococcusfaeciumstrainDSM20477亲缘关系达100%。确定菌株MNJ-9为屎肠球菌(E.faecium)。03基于LC-MS鉴定乳酸菌发酵...
...市食药检院/美吉生物-??MIST: 可交互微生物鉴定和溯源分析平台
它利用扩增子测序数据有效地分析不可培养微生物,基于WGS数据可准确地进行基因分型并完成ARG和VFG注释,此外平台还实现了基于SNP的菌株溯源分析。结果系统概述该系统由三个分析流程组成:1.基于扩增子的微生物鉴定,如16SrDNA/18SrDNA/ITS基因,2.基于WGS的微生物鉴定,3.基于SNP的溯源分析。用户需选择Illumina测序...
iMeta | 徐健/姚粟/崔云龙-合作发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞...
然后对MPP-A产品进行检测,详细步骤如下所述,MPP-A在100%D2OMRS中厌氧孵育3小时,将孵育后的样品等分成三份,其中两个等分分别进行了基于16S-rDNA的扩增子测序和宏基因组测序作为对照实验,两者测序结果表明L.plantarum为MPP-A产品主要成分。另一份经过两次洗涤,进行单个细胞的SCRS鉴定,其中平均92.72%的SCRS被CNN模...
菌血症之带刺的玫瑰
Rudolph等[12]对VITEK2、质谱和16SrRNA测序三种方法对黏液玫瑰单胞菌的鉴定能力进行了比较,以全基因组测序为鉴定的金标准,研究发现VITEK2可能会将该菌错误鉴定为少动鞘氨单胞菌等菌种,而质谱和16SrRNA测序的鉴定能力更可靠。理论上来说,16SrRNA测序的鉴定能力优于质谱技术,但16SrRNA测序在国内实验室的开展并不十...
FSHW | 乳酸钾对如皋火腿感官特性、微生物群落演替及生物胺形成
结果表明,变形杆菌和厚壁菌在如皋火腿中起着重要作用,葡萄球菌是乳酸钾改善火腿品质的主要微生物。LDA效应大小(LefSe)分析进一步表明,乳酸钾对葡萄球菌的影响较大,葡萄球菌可能是影响如皋火腿品质的主要菌种。图2细菌在(A)门和(B)属水平的相对丰度,以及不同样品中(C)股二头肌和(D)半膜肌的进化分支图...
借助AI,实验室微生物偏差如何开展调查
生理生化特性测试:进行一系列生理生化特性测试,包括碳源利用、氧气需求、酸碱度耐受性、代谢产物等等,以进一步确定菌种的特征和类别(www.e993.com)2024年9月8日。分子生物学鉴定:可以采用PCR、DNA测序等分子生物学技术对菌种进行鉴定,通过比对菌株的16SrRNA序列和其他基因信息与数据库中的菌株进行比对,确定菌种的种属、亚属和菌株等信息。
肠道核心菌属——芽孢杆菌属,益生与病原双标签|枯草芽孢杆菌|蜡样...
这种对定义的破坏是因为16SrRNA基因序列分析允许识别属边界,而属之前是通过表型来定义的,作为共享关键(即诊断)特征的物种的实用集合。此外,在单一可用的盐芽孢杆菌菌株中仅观察到球状细胞,因此芽孢杆菌不再仅仅是杆状细胞属。??具有良好的适应能力该属的许多物种表现出广泛的生理能力,使它们能够生活在各种自然...
黄色脓液恶臭难闻,究竟是什么“感染”了她的宫腔……
对于临床微生物种属的鉴定,传统的方法是通过细菌形态、生化反应和免疫学特征进行分析,但该方法需先纯化菌种,耗时长且易受外界环境影响[7-8]。虽然分子生物学检测技术PCR、16SrRNA序列分析、高通量测序对细菌的鉴定从表型特征向基因特征深入,然而过程繁琐、价格高昂,不利临床常规使用[7,9]。质谱技术的应用,对于临床微...
通过国内外仪器的性能比对,竟能发高分SCI文章!
表2三种MALDI-TOF质谱系统的结果有效率除单一鉴定结果外,当多个结果中至少有一个种与16SrRNA基因测序结果一致时,MALDI-TOFMS结果也被认为是正确的。最终结果显示,有效检出中Biotyper、EXS2600、VitekMS三个系统与16SrRNA基因测序结果的一致性分别为98.9%,98.5%,99.7%。
云南“航天菌种”二飞冲天 开启民族种源新未来
经过多年的选育研究工作,来思尔乳业研究人员从1132份云南特色样品中筛选出11168株原生代优质菌株,并对9111株菌株进行16SrRNA测序鉴定,有50多株菌株具备开发潜质,通过自主创新选育的9株乳酸菌菌株已完成“第三代”全基因组测序、分析,并成功进行技术转换、稳定应用于生产,打破了进口菌种对我国发酵乳制品行业的...