Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

而以上这些方法都依赖于cDNA转换,这一过程抹去了有关RNA碱基修饰的信息,而且也只能粗略估计多聚腺苷酸(poly(A))尾巴的长度,而directRNA-seq可以直接分析全长转录本异构体、度量碱基修饰(比如N6-甲基腺苷(M6A))和检测poly(A)尾巴长度。RNA-seq技术的进步在NCBIShortReadArchive(SRA)数据共享平台中多于95%...

仇子龙/程田林团队成功利用全脑单碱基编辑技术,改善孤独症小鼠...

随后,为了修复小鼠大脑神经元中的L35P点突变,仇子龙和程田林团队合作开发了一种基于CRISPR/Cas9的新型胞嘧啶单碱基编辑系统(APOBEC3AembeddingCytosineBaseEditor,AeCBE,已申请相关发明专利),使其能够将小鼠Mef2c基因中特定位置上异常的C·G碱基对转换成正常的T·A碱基对。为了能够使得新型CBE系统成功地跨越小鼠...

新型降脂药物“崭露头角”:六大治疗靶点,十余种降脂药物,一文打尽!

Volanesorsen是第一种获批的靶向apoCIII的药物,可用于家族性乳糜微粒血症综合征的治疗。Volanesorsen是一种反义核苷酸药物,能够干扰mRNA到蛋白质的翻译,抑制ApoC-III的产生,调节甘油三酯水平(图2)。目前,三项III期试验已评估了volanesorsen降低甘油三酯的疗效。APPROACH随机试验显示,每1-2周用一次volanesorsen,即可使...

巴渝良种系列报道⑦|橘芯1号:全基因组解锁柑橘80多个性状

西南大学柑桔研究所、西部(重庆)科学城种质创制大科学中心柑桔团队历时7年,对300多个代表性柑橘种质资源进行深度重测序,筛选出4万余个核心SNP(单核苷酸多态性)位点,开发了柑橘全基因组40K液相育种芯片——橘芯1号。这是世界上柑橘领域第一个全基因组“液相芯片”。▲芯片中4万个SNP位点的分布图使用这个“芯片...

Nature子刊:仇子龙/程田林团队利用全脑单碱基编辑技术改善自闭症...

随后,为了修复小鼠大脑神经元中的L35P点突变,仇子龙和程田林团队合作开发了一种基于CRISPR-Cas9的新型胞嘧啶单碱基编辑系统(APOBEC3AembeddingCytosineBaseEditor,AeCBE),使其能够将小鼠Mef2c基因中特定位置上异常的C·G碱基对转换成正常的T·A碱基对。

两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命

马特伊要看的是哪一种放射性标记的氨基酸会被多聚(U)变成蛋白质链,并希望借此读出遗传密码的第一个“单词”(www.e993.com)2024年11月12日。无论一组密码用的是一个、两个、三个、四个还是更多的碱基都没关系:试管中“无细胞”(cell-free;编者注:指这个体系中没有完整的活细胞,只有细胞的一些组分)的蛋白质合成体系都能读取其中的信息。

盘点10余款迈入临床的CRISPR基因编辑疗法

BEAM-101是BeamTherapeutics公司在研的一种单碱基编辑疗法,后者由刘如谦博士、张锋博士、KeithJoung博士联合创建。BEAM-101通过在体外对患者的造血干细胞进行基因组改造,使其模仿遗传性持续性胎儿血红蛋白症个体中的单核苷酸多态性,来缓解导致镰刀状细胞贫血症的遗传突变的不良影响。该疗法整合了基因编辑和细胞疗法,在20...

精神分裂症30年研究徒劳无功?(下)

GWAS的实现得益于对人类基因组的测序工作，揭示了30亿核苷酸基因组中的超过100万个单核苷酸多态性（SNP）。SNP是DNA序列中的单个碱基对变异。要被认定为SNP，这种单个核苷酸的变异必须在超过1%的人群中出现，这使得它们相当普遍。研究者利用这些SNP作为生物标志，以定位与诸如精神分裂症等疾病相关的基因。但SNP标记本身...

人造合成DNA,离现实又近了一步

我们知道,地球生命虽然形态各异、多种多样,但所有自然生命的碱基都可以用4个字母来表示,它们是腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。在DNA中,这些碱基以特定的方式配对,A与T配对,C与G配对。这种独特的分子几何结构,被称为沃森和克里克几何。

2023年世界科技进展100项|粒子|科学|量子|光子|光量子|原子_网易...

16、从头合成生产出世界上最长的寡核苷酸美国生物科技公司宣布成功从头合成出世界上最长的DNA寡核苷酸,该序列长达1005个碱基,编码了可用于基因治疗的AAV载体的一部分。Ansa采用酶法DNA合成技术,技术由与单个脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)分子连接的独立于模板的末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)实现。TdT-dNTP偶联物允许快速可控地...