NBT|任兵团队开发新型高通量单细胞染色质构象分析技术Droplet Hi...

为了测试DropletHi-C的性能,研究团队将其应用于人HeLaS3细胞系和小鼠胚胎干细胞(mESC)细胞系混合物、三种人类细胞系(K562、GM12878和HeLaS3)混合物、二倍体细胞(GM12878和WTC-11)混合物,结果显示DropletHi-C可以准确区分细胞类型特异性染色质结构域。图1.DropletHi-C的概述和性能。2.DropletHi-C揭...

一个新的高度近视候选致病基因被发现

LRR蛋白家族中多个成员是细胞外基质(extracellularmatrix,ECM)的重要组成成分,参与胶原纤维的合成。角膜与巩膜是眼内胶原纤维含量最多的组织,其胶原纤维的合成/排列被认为在近视发生发展中起着重要作用。该研究利用人眼单细胞数据集分析、组织切片染色定位和RT-PCR检测等多个技术手段,明确了LRRC46蛋白在角膜和巩膜均有...

北京林业大学林金星团队在植物细胞壁主要成分单细胞水平拉曼光谱...

图1植物细胞壁主要成分的拉曼光谱检测和单细胞水平的原位成像A:野生型和darx1水稻维管束细胞壁的拉曼光谱以及半纤维素乙酰化的CRM成像。B:野生型水稻维管束细胞壁成分分布的CRM成像。C:油松树干和根次生木质部细胞壁的平均拉曼光谱。D-E:油松次生木质部细胞壁成分分布的CRM和SRS成像。F-H:油松次生木质部的主成分...

打造解码单细胞蛋白质的“全自动流水线”

由于蛋白质无法在体外进行扩增,相较单细胞基因组学和转录组学技术而言,单细胞蛋白质组学技术发展相对滞后。在一个细胞中,蛋白质的总含量约为0.2纳克,质量仅相当于一只蚂蚁的千万分之一。而且组成这0.2纳克蛋白质的是近2万种不同种类的蛋白质,在单细胞水平上进行蛋白质组分析的难度可想而知。方群介绍,在单细胞...

??Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞...

图1.微生物组单细胞转录组研究流程基于MscT,研究团队构建了一个涵盖17,4531个微生物细胞和2,534个物种的瘤胃微生物单细胞转录组图谱,揭示了瘤胃微生物在单细胞水平上的功能分工;共鉴定出12个功能类群,每个类群由表达特定代表性功能基因的细胞组成。例如,功能类群“HSP90+HMACs”中的细胞特异性表达HSP90蛋白,这...

我国科学家绘制出世界上首张家蚕丝腺单细胞图谱

这次完成的丝腺单细胞图谱里面一个点就代表一个细胞,在筛选了15000个高质量单细胞后绘制的一张图谱(www.e993.com)2024年11月9日。通过分析,丝腺的细胞总共有10种类型,这10种类型分别执行着不同的作用,比如这种细胞是专门合成丝素蛋白的,这种细胞专门合成丝胶蛋白的,丝素蛋白和丝胶蛋白就是蚕丝的主要成分。

肠漏以及有助于治疗肠漏的成分

肠道屏障的组成部分肠道屏障从上到下依次是微生物屏障、化学屏障、物理屏障和免疫屏障。化学屏障包含微生物、免疫球蛋白A(IgA)、黏蛋白、单磷酸腺苷(AMPs)和抗菌肽;物理屏障包括肠上皮细胞、杯状细胞(合成和释放黏蛋白)、潘氏细胞(合成AMPs)和肠道干细胞;免疫屏障主要由T细胞、B细胞、巨噬细胞、树突状细胞和肥大细...

浙江大学方群团队打造解码单细胞蛋白质的“全自动流水线”

挑战单细胞组学研究的“硬骨头”人体内的各种细胞组成成分复杂,包含DNA、RNA、蛋白质、代谢物等。其中,蛋白质是细胞功能的直接执行者。细胞通过蛋白质及其翻译后修饰,可以感知并响应外在和内在刺激,从而影响整个生命体的功能和状态。“细胞具有异质性。比如同样是肿瘤细胞,个体间也有所不同,有的容易发生转移,有的对...

癌细胞复发转移的原因,可能和免疫系统的这些因素有关...

醋酸,又称乙酸,是短链脂肪酸的重要组成成分。人体血液循环中醋酸含量波动较大,约为50~800μM,醋酸含量主要受饮食成分影响(例如食醋、乳制品、加工的肉类和面包、酒精及不易消化的碳水化合物)。本项研究中,研究者们发现醋酸是非小细胞肺癌(NSCLC)中含量最高的短链脂肪酸,而且癌细胞摄取醋酸的能力明显增强,如...

中国科大研发单神经元质谱技术并在大脑神经元代谢研究中取得重要...

近日,中国科学技术大学化学与材料科学学院黄光明教授与生命科学学院熊伟教授开展紧密合作,基于自行开发的单细胞电生理与质谱联合检测平台,对小鼠大脑中单个神经元开展了多种化学成分的快速质谱检测,并且可以做到同步采集电生理信号,在单细胞层次上成功完成了对神经元功能、代谢物组成及其代谢通路的研究。相关研究成果以“Sing...