Nature Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互...
蛋白质结构预测方法(如AlphaFold、OpenFold和RoseTTAFold)以及蛋白质-DNA复合体模型(如RoseTTAFoldNA、RoseTTAFoldAll-Atom、MELD-DNA和AlphaFold3)的快速发展,导致可用于分析的结构数据呈指数增长。这种情况突显了需要一个通用的计算模型来分析蛋白质-DNA结构。该研究展示了DeepPBS如何与结构预测方法结合使用,以预...
「AlphaFold 3」要来了?DeepMind推出新一代蛋白质结构预测工具,已...
??考虑到比较系统使用已知的蛋白质结构作为基础,AlphaFold3在配体对接的准确性方面,优于开源分子建模模拟软件AutoDockVina等传统系统;??与AlphaFold2.3相比,AlphaFold3在预测蛋白质-蛋白质结构方面,抗体结合结构显著增强;??此在蛋白质-核酸相互作用方面,AlphaFold3优于其他竞争方法,如RoseTTA2FoldNA...
重大突破!谷歌AI模型登《自然》期刊
同时,研究人员表示,阿尔法折叠3在预测蛋白质及其结构方面远远优于现有的软件工具。例如,对寻找新药感兴趣的科学家通常使用一款名为docking的软件来模拟化学物质与蛋白质的结合程度,而阿尔法折叠3被证明优于这个软件,同时也被证明优于另一个名为RoseTTAFoldAll-Atom4的基于人工智能的工具。约翰·詹珀和他的同事在稍早...
欧盟提出战略举措,提升欧洲在先进材料领域的全球地位
德国科研团队开发新软件可快速模拟糖蛋白结构助力药物开发据phys网3月1日消息,德国马克斯·普朗克研究所开发出新算法GlycoSHIELD,为药物和疫苗开发提供了快速、高效、更低能耗的工具。该算法通过计算和预测蛋白质表面保护性聚糖的形式和排列,可了解糖的迁移率、可变性等动态信息,以及糖层对药物分子结合的影响。此外,该...
2024年六大猜想:科技群星闪耀时
猜想三:AIPC/AIPhone:凛冬已过,拥抱创新之春。PC及手机增长望迎复苏,Canalys预计2024年全球PC/手机出货量增长8%/4%。建议关注大盘复苏及技术创新带来的:1)AIPC投资机会,如算力、存储、散热、品牌等,2)手机创新机会,如折叠屏、AIPhone、光学升级等。
??整合结构质谱法和计算模拟法探究糖原磷酸化酶中磷酸化介导的...
质谱(MS)法具有快速、灵敏的特点,是蛋白质结构、动态性以及构象变化分析中强有力的一款技术(www.e993.com)2024年9月16日。氢氘交换质谱(HDX-MS)通过监测蛋白骨架酰胺氢原子与溶液中氘的交换来反映蛋白质构象动态性,因此适用于探究由配体、蛋白结合或共价修饰引起的蛋白质构象变化。同时,多个软件实现了由HDX-MS数据计算保护因子(PFs)和吉布斯自由...
海特生物:公司的蛋白质结构模拟平台可用于模拟、分析多种类型的...
海特生物:公司的蛋白质结构模拟平台可用于模拟、分析多种类型的融合蛋白,不仅限于三聚体化融合蛋白每经AI快讯,有投资者在投资者互动平台提问:公司的蛋白质结构模拟平台和三叶草公司的三聚体化的融合蛋白平台有什么区别?各自有什么优势吗?海特生物(300683.SZ)7月22日在投资者互动平台表示,感谢您对公司的关注。
投资者提问:公司的蛋白质结构模拟平台和三叶草公司的三聚体化的...
公司的蛋白质结构模拟平台和三叶草公司的三聚体化的融合蛋白平台有什么区别?各自有什么优势吗?董秘回答(海特生物(21.460,-0.01,-0.05%)SZ300683):感谢您对公司的关注。公司的蛋白质结构模拟平台可用于模拟、分析多种类型的融合蛋白,不仅限于三聚体化融合蛋白。谢谢。
《JACS》北卡罗来:蛋白质模拟物控制两亲高分子折叠超出一级结构
此外,提供氢键的亲水单体会破坏折叠组件内由FF形成的内部结构。总的来说,这些结果阐明了在折叠合成聚合物中轻松结合蛋白质模拟、高阶结构的多个方面的设计原则。相关论文以题为ControllingAmphiphilicPolymerFoldingbeyondthePrimaryStructurewithProtein-MimeticDi(Phenylalanine)发表在《J.Am.Chem.Soc...
用AI创造全新的蛋白质结构,这款软件与AlphaFold的区别在哪里?
第一种方法是“constrainedhallucination”(受限幻想),他们给软件指定一个蛋白质目标(如与金属结合),使它们的预测结构包含所需的功能位点。第二种方法是“inpainting”(修补),他们给AI一个功能性位点,以此为起点对蛋白质序列和结构进行补充。这种方法看起来就像是,你在手机上输入几个字母后,输入法会自动给...