斯坦福伯克利重磅发现DNA Scaling Law,Evo荣登Science封面,AI设计...

如果能有一个模型,能在保持单核苷酸分辨率的同时,还能处理大型基因组序列,就可以帮助科学家提取出自然进化变异模式中蕴含的复杂分子相互作用功能信息了。而今Evo的出现,让这一切都可以实现了。Evo是一个包含70亿参数的基因组基础模型,可以学习从单个核苷酸到整个基因组的生物复杂性它预测、生成和设计整个基因组序列...

生物技术融合信息技术,释放生物计算设计新可能

据介绍,开发人员利用AmazonStepFunctions实现可视化的工作流管理,实现了编辑序列设计工作流的串联,从而实现应用的快速构建和更新,同时快速查询处理异常任务;利用AmazonLambda将不同的引物设计、同源臂设计等编辑序列设计模块封装打包,满足了具体功能的模块化开发要求,并方便地对功能模块进行管理和共享;利用AmazonDynamoDB...

CRISPR干预的CHO细胞系开发方法

本综述将概述CHO细胞系开发中最基本和最新的进展,例如不同的细胞系工程方法以及供体设计策略,用于将所需的构建体有针对性地整合到基因组热点中,这最终可能导致快速产品开发过程,具有一致的、提高的产品产量和质量。1.引言在工业生产重组治疗蛋白方面,哺乳动物细胞,特别是基于中国仓鼠卵巢(CHO)细胞的系统,发挥着最...

北京大学申请基于深度学习的16SrRNA基因测序引物设计方法及系统...

确定符合测序平台要求的候选扩增区域用于引物设计,针对每个候选扩增区域确定对应的正向引物结合区序列集和反向引物结合区序列集,基于两种序列集分别进行多序列比对得到候选特异性引物对,最后筛选得到目标细菌群落特异性引物对。

...天津中医大组学揭示金芪降糖片治疗2型糖尿病的作用及机制

方法:我们建立了T2DM小鼠模型,通过测定小鼠给药8周后血脂、空腹血糖(FBG)、胰岛素代谢和肝脏脂质蓄积水平,评估JQJT对T2DM的改善作用。我们采用超高效液相色谱/四极杆飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术检测血清代谢物,采用转录组技术检测小鼠肝脏差异基因;利用相关性分析提取具有相关性的代谢物和RNA,利用MetaboAnalyst...

谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...

在生物信息学中,深度学习主要应用于以下几个方面:1、基因表达谱分析:通过对基因表达谱数据进行深度学习,可以预测基因功能、发现新的生物标志物和生物路径径(www.e993.com)2024年11月19日。2、结构生物学预测:通过对结构生物学数据进行深度学习,可以预测蛋白质结构、功能和互动。3、生物信息学数据集预处理:通过对生物信息学数据集进行深度学习,...

基因检测在疾病确诊、家系遗传模式分析与再生育计划中的重要作用

当患者出现上述病症，在有疾病怀疑方向的情况下，同时临床检测了：血同型半胱氨酸、血氨、血气、血脂、肝功能、心脏酶谱、血乳酸、尿气相色谱、血串联质谱等，发现特殊的临床指证，例如：有患者检查血氨高，且血串联质谱的瓜氨酸低、尿气象色谱尿乳清酸与嘧啶高等特异性异常代谢指标，那么就能将疾病范围控制在尿素...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

先描述短读长测序的文库构建过程、实验设计注意事项和计算分析流程,探究其应用如此广泛的原因。然后描述单细胞转录组和空间转录组的发展和应用。我们会举例说明RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用,包括转录和翻译的动力学分析,RNA结构,RNA-RNA和RNA-蛋白质间相互作用等。最后我们小小地展望一下RNA-seq的未来,如单...

鹰谷InSequence序列编辑器新品发布,引物设计、序列比对软件,不止...

1、全新中文界面与更大操作空间:全中文简洁直观的操作界面,常用功能固定至工具栏,随心自定义更改工具栏,让科研人员能够更快速地上手,也支持英文模式的切换。2、兼容多格式导入:可与多种主流的生物信息学软件如SnapGene、GeneBank无缝对接,方便用户进行数据分析和整合。

本期荐读丨优秀教学设计:基于工程思维培养的“基因工程”单元教学...

通过与体内DNA复制进行比较,分析PCR体外复制需要的条件,模拟引物设计,理解PCR的原理及应用。在实验室完成PCR体系的混合操作及PCR仪的使用,通过各班级之间时间的统筹,对前一个班级的PCR产物进行电泳检测,可在1个课时高效进行实验。4.3学习活动3:提出通过基因工程大量生产人干扰素的思路...