Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

综合使用cDNA制备方法和直接RNA测序,结合多种平台的数据,LRGASP项目全面评估了各种实验方法和分析工具在不同挑战中的表现,提供了对当前实践的深入洞察和未来改进的建议。该研究的重要性在于它不仅为研究人员提供了长读长RNA测序技术在转录组分析中的实际应用指南,还为开发更高效的转录本检测和定量方法提供了有价值的参...

Nat Methods | 基于测序的11种空间转录组学方法的系统比较

整体来看,该研究全面比较了各方法从基本指标到下游分析的各个方面的数据,包括灵敏度、聚类性和标记基因检测等,并总结了每个评估步骤中使用的方法。分析结果表明,空间转录组学需要更多的测序数据才能达到饱和,而研究中所使用的数据远低于饱和水平。Stereo-seq、Slide-tag、Visium(基于探针)在原始测序深度下显示出更好的...

18 年四次诺奖,RNA 研究的浪潮何以席卷多年?

3)miRNA实验验证:通过双荧光素酶报告基因的实验验证miRNA与靶基因的靶向关系;4)研究miRNA的功能。miRNA研究策略基本思路导图高通量测序技术(NextGenerationSequencing,NGS)在miRNA的研究中扮演着至关重要的角色,可以帮助科学家深入分析样本中的miRNA,识别并定量已知的miRNA,发现新型有研究潜力的...

国产测序仪行业研究报告:近30款产品宣布商业化,市场重塑窗口期

这一技术突破使得个人全基因组测序成本从数十万美金降低至数百美金,有力推动了基因测序技术在各个领域的广泛应用。单分子测序技术可以细分为两种技术,分别是纳米孔测序和单分子荧光测序。单分子测序技术测序过程无需进行PCR扩增,实现了长读长和单分子级别的测序,一次可读取长达数万碱基的片段,大大降低了拼接难度,减...

深圳华大智造科技股份有限公司2023年年度报告摘要

公司基因测序仪业务板块产品主要包括基因测序仪及配套设备、测序配套试剂、数据处理系统,用于高通量测序中的文库制备、测序反应和数据分析等步骤,适用于全基因组测序、外显子组测序、靶向捕获测序、表观基因组测序、宏基因组测序、转录组测序、单细胞测序和时空组学测序等多种应用场景。

2024-2029年中国基因检测行业市场调研与发展前景预测报告

B、在达到一定程度规模效应后，对核酸提取、文库制备、数据分析的标准生产流程进行一体化整合，进一步降低测序的实验成本，缩短实验和数据分析周期，提升整体生产效率，降低下游的应用门槛(www.e993.com)2024年11月3日。C、结合云计算与大数据分析，降低基因测序数据解读与挖掘的门槛，实现高效便捷的基因信息挖掘，助力学术界与工业界的人员进行成果转化。

Sci Adv:单细胞RNA测序和空间转录组学绘制金鱼端脑细胞类型图谱

实验设计结果1空间分辨率的金鱼端脑细胞类型图谱单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够完全基于全基因组基因表达谱(转录组)来比较不同物种间特定组织细胞类型的分子相似性和差异。而空间转录组(ST)可以保留mRNA分子在组织中的位置信息,并实现基因谱的空间定位。本研究结合这两种技术,生成了金鱼端脑的空间注释细胞类型图谱(...

Nature:王凌华团队等通过单细胞和空间转录组揭示肺腺癌最早的细胞...

通过对比在不同取样时间点的单细胞RNA测序数据,他们发现小鼠KACs的出现在Kras突变型肿瘤出现之前。此外,研究者还对来自小鼠模型的肺癌样本进行了空间转录组测序分析。空间转录组测序数据也呈现出和人肺腺癌样本的空间转录组数据相似的特征,即小鼠肿瘤组织和肿瘤周围邻近组织中存在高水平的KACs特征基因的表达。

新格元生物邀请您参加2023“第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单...

作为2023收官之作,“第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间组学研讨会”将在传承前三届及长三角和西南单细胞论坛成功经验的基础上,继往开来,开拓创新。增加单细胞和空间组学最新研究及应用,涉及转录组、蛋白组和代谢组等最新技术前沿;届时领域内知名研究者、技术专家、应用专家,将围绕临床应用和药物开发方面的...

贝瑞基因2024年半年度董事会经营评述

植物基因组Denovo、动植物基因组重测序、人基因组重测序、转录调控、单细胞转录组、空间转录组、空间蛋白组、微生物组学等几十种科研服务细分产品类型,深耕于肿瘤研究、遗传病研究、动植物研究、微生物研究和单细胞研究等多个科研领域,并基于特有的数据库资源及云计算平台,为生命科学研究提供全面、精准、安心的分析...