国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...
宏基因组高通量测序整个流程通常分为湿实验和干实验两部分[10]。湿实验流程是指从样品处理到测序数据产生的整个过程,需要在标准的实验室完成,一般包括:样品前处理、核酸提取、文库制备、测序;干实验流程是指对测序数据进行生物信息学分析及结果审核和出具报告的过程。宏基因组高通量测序湿实验的每一个环节都要严格控制...
专家共识丨动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...
宏基因组高通量测序整个流程通常分为湿实验和干实验两部分。湿实验流程是指从样品处理到测序数据产生的整个过程,需要在标准的实验室完成,一般包括:样品前处理、核酸提取、文库制备、测序;干实验流程是指对测序数据进行生物信息学分析及结果审核和出具报告的过程。宏基因组高通量测序湿实验的每一个环节都要严格控制气溶...
MALDI-TOF MS鉴定病原微生物临床应用专家共识
直接靶板微滴生长法则是基于微量肉汤稀释法的原理,直接在靶板上将病原微生物与折点浓度的抗菌药物一起孵育,通过谱图的鉴定分数来评估病原菌生长情况,从而判断菌株的耐药性/敏感性。3.进行微生物分型:(1)聚类分析。通过制造商提供的科研分析软件,可以选择聚类算法对同种不同株的谱图进行种水平以下的分析和比较,...
凯莱英医药集团(天津)股份有限公司
合成生物技术研发中心(CSBT,CenterofSyntheticBiologyTechnology)依靠强大的研发能力,经过十余年技术沉淀,已建立成熟的从分子生物学(重组表达)开始的一站式合成生物服务能力,报告期内,进一步深化完善酶工程技术平台技术能力,实现从基因合成、测序到AI辅助酶进化能力的全面提升;完成寡肽生物合成技术平台建设;完成寡核苷...
江苏首家医院开展本地化新冠病毒全基因组测序和分型检测
为了更好地服务临床和感控工作,东南大学附属中大医院医学检验科测序实验室积极探索低耗高效的新冠病毒变种、亚变种分析方法,目前在江苏医院中首家建立了本地化新冠病毒全基因组测序和分型方法,可为正在感染阶段的新冠病毒感染者提供本地化新冠病毒全基因组测序和分型检测。
苏珍萍 朱庆义:气单胞菌属致病性与实验室分子诊断新技术临床应用
(1)多位点系统发育分析检测毒力因子:采用多位点序列分型(Multilocussequencetyping,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过PCR扩增多个管家基因内部片段,测定其序列,分析菌株的变异,从而进行分型,具有操作简单,快速,用于多种细菌的流行病学监测和进化研究,成为细菌分子流行病学研究的一种重要方法(www.e993.com)2024年10月19日。Roger等...
真菌检验图文全总结,读懂真菌检验报告不再难!
黑曲霉:分生孢子梗长,小分生孢子表面粗糙;新型隐球菌:大小变异甚大,球形或橄榄球性,在墨汁黑背景下呈清晰的晕圈;晕圈内可见菌体细胞。▌真菌的菌落特征念珠菌:临床常见的念珠菌有5个类别,见图1。图1来源:叶枫教授“真菌实验室检测进展”报告截图...
医药行业病毒载体专题报告:CGT关键原料,关注外包生产
3.1.3AAV载体改造策略:分型发现、设计及修饰为了将野生型AAV变成适合体内基因递送的重组型AAV载体,研究人员对其进行了一系列的遗传改造。重组型AAV载体的病毒衣壳依然沿用野生型AAV的序列与构造,如完全剔除了rep基因和cap基因,仅仅保留有了负责引导病毒载体基因组复制和包装的ITRs序列。
专家共识丨呼吸系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读
宏基因组二代测序(mNGS)已被广泛应用于感染性疾病的病原检测。然而,呼吸系统感染具有特殊性:病原组成复杂、标本类型选择多样、存在感染与定植、不同标本类型结果解读原则不尽相同等。为规范临床送检适应证,选择合适的送检标本以及恰当地解读报告,特组织专家对上述问题进行讨论并撰写专家共识,以期为呼吸系统感染中mNGS技术...
公卫·科普 | 高通量测序技术——打开病原体诊断的“钥匙”
mNGS检测流程可分为样本处理、核酸提取、文库制备、模板制备和测序、数据分析以及报告出具几个步骤(图3)。开展过程中需要在实验的关键步骤设定质控点和合适的对照来尽量减少假阳性和假阴性检测结果的发生,这些都对开展mNGS检测服务的公司提出了很高的要求。随着mNGS在临床范围内的应用日渐增多,外送的方案由于时间周期较长...