汪劲:描述生物系统涌现行为的景观和流理论视角

在实际的药物发现设计中,亲和力和特异性的准确量化,是分子紧密结合和避免副作用所必需的。蛋白质折叠和分子结合的底层驱动力都是疏水和静电相互作用[15,21,22]。类似于蛋白质折叠,底层的结合能景观自然应该有一个漏斗朝向天然结合状态。漏斗状的结合能景观提供了一个量化结合特异性的标准:与潜在的能量景观粗糙度...

Phytomedicine | CETSA和TPP策略用于天然产物的靶点鉴定和药物...

基于tmt的MS蛋白质组学分析后,2D-tpp结果可以显示在由NP浓度轴和温度轴组成的2D热图中,这为目标蛋白提供了热稳定性和药物亲和力信息。二维TPP(2D-TPP)用于天然产物的靶点识别2D-TPP被设计为TPP-TR和TPP-CCR策略的组合,其中细胞或细胞裂解物用一系列浓度的药物处理,每种浓度的药物在不同的温度下进行热激发。

药物-靶标亲和力预测,上科大团队开发了一种Transformer编码器和...

然而,初始输入数据,特别是蛋白质和小分子的数据描述,显著影响模型的性能。在最新的研究中,上海科技大学的研究团队提出了一种用于预测药物-蛋白质相互作用中的共价(键合)和非共价(非键合)结合亲和力的新模型,称为指纹编码器DTA(TEFDTA)。图示:TEFDTA框架。(来源:论文)TEFDTA从两个现有模型DeepDTA和Tr...

11种非典型抗精神病药与NMS的纠葛

帕利哌酮与利培酮具有相似的药效学特征,但对多巴胺受体的亲和力较低,对五羟色胺拮抗剂活性较高。帕利哌酮诱导的NMS多发于之前使用其他抗精神病药物治疗,且近期伴有剂量增大或交叉滴定的患者。临床特征:具有典型的临床特征,包括精神状态改变、肌肉僵直、出汗、高热、震颤和其他锥体外系症状。9、佐替平文献中有几例...

...致幻剂抗抑郁新机制!与致幻作用无关,且受体亲和力是现有药物...

总的来说,研究发现致幻剂LSD和PSI可以通过与TrkB的高亲和力结合来促进神经可塑性以及与可塑性相关的行为效应。需要注意的是,致幻剂并不是直接的TrkB激动剂,而是通过增强细胞内部已经存在的信号来影响TrkB的活性。这种变构作用与其他抗抑郁药物类似。研究为设计高亲和力且没有致幻活性的TrkB配体开辟了道路。

50%入围命中率,用AI筛选药物上科大“冬旦之间”团队的办法是...

“在很多领域,尤其是生物医药领域,数据极为缺乏(www.e993.com)2024年11月19日。在这种情况下,AI很难发挥其全部潜力。此时,物理模型变得非常重要,物理模型通常基于理论或者经验,对科学问题进行降维描述,从而有效规避了数据匮乏带来的限制。””“目前,结合AI和物理模型是药物设计领域一个重要的应用策略。这种方法介于纯粹的AI和传统的计算机辅助药物...

减肥增肌研究与激活素药物:下一个重磅呼之欲出?| 新靶点的故事

对此,他提出了以调节回路为平台的药物靶点研究,认为基于路径的临床分类法的一个优点是它为疾病描述提供了机制基础。当通路的多个元素受到影响时,这些测定的结果变得更容易解释。单个蛋白质的细微变化可能低于检测阈值,但可以通过包含多个通路成分的复杂计算方法进行放大。菲什曼根据这种"新语法",以调节回路为导向对诺华生...

Nature子刊丨候选药物的药理学表征,提高疗效减少失败率

GPCRs的结构变换，如偏向性信号和变构调节，对药物作用机制具有深远影响。为了更精准地理解这些复杂机制，新检测方法和结构生物学的突破，如冷冻电子显微镜（冷冻电镜）技术，为科学家们提供了前所未有的分析工具。这些进步不仅加深了我们对药物与GPCRs相互作用的理解，也为新药开发提供了更为坚实的科学基础，从而有望...

减肥增肌研究与激活素药物:下一个重磅呼之欲出?礼来和来凯医药...

对此,他提出了以调节回路为平台的药物靶点研究,认为基于路径的临床分类法的一个优点是它为疾病描述提供了机制基础。当通路的多个元素受到影响时,这些测定的结果变得更容易解释。单个蛋白质的细微变化可能低于检测阈值,但可以通过包含多个通路成分的复杂计算方法进行放大。菲什曼根据这种"新语法",以调节回路为导向对诺...

Dr. X|结构的奥秘——基于冷冻电镜的单抗药物开发新方法

该技术能够在近原子分辨率下观测生物大分子的结构，特别是可视化的抗原-抗体结合模式，令抗体药物亲和力成熟、成药性改造、表位研究、作用机制的解析及工程化改造等应用更加有的放矢。冷冻电镜正以前所未有的方式改变结构生物学领域，帮助科学家实现一个又一个重大发现，为人类健康的探索助力。参考文献1https...