...张乐团队探索帕金森病大脑的细胞图谱: 单细胞转录组学和蛋白质...
为进一步检测帕金森病大脑与健康对照之间蛋白质丰度差异,研究人员采用了无标记定量质谱技术,对来自相同供体、相同脑区和组织的蛋白质组变化进行分析。通过整合蛋白质组和单核转录组数据,研究人员在帕金森病的人脑蛋白质组数据集中识别出14个模块,其中,兴奋性神经元特异性标记基因在与突触相关的模块M1、M2和M11中富集,并...
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
蛋白质是作物实现各种生物学功能的主要执行者,构建全景定量蛋白质图谱在阐释植物生长发育、逆境响应及代谢调控等方面具有重要意义。论文通讯作者、中国农业科学院生物技术研究所研究员梁哲告诉记者,科研人员利用质谱等技术,量化了水稻主要组织中超过15000个基因的蛋白质水平,鉴定了8964个蛋白质,并为另外7077个蛋白编码基因...
质谱技术揭秘蛋白质:从结构到功能的深度解析
操作质谱仪需要掌握仪器的参数设置和操作流程。3.数据采集和解析:通过质谱仪采集数据,并使用专业的数据分析软件进行解析。数据解析包括质谱图谱的解释、质谱峰的归属和蛋白质鉴定等。质谱技术是一种重要的工具,为蛋白质研究提供了深入解析的能力。通过质谱技术,我们可以分析蛋白质的结构、组成、修饰和功能,从而推动生...
Nat Commun | 结合机器学习与血浆蛋白质组质谱分析可提前7年预测...
该研究包括三个阶段:第0阶段,通过非靶向质谱法推断蛋白质组学组成,识别潜在的生物标志物;第I阶段,将来自发现阶段的候选蛋白通过靶向质谱多反应监测(MRM)方法,应用于更大的样本队列中;第II阶段,对靶向MRM方法进行改进并分析更多样本,以评估靶向蛋白质panel的临床可行性。蛋白质组学发现阶段(第0阶段)研究团队随机...
...| 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测
ACE技术通过显著提高质谱细胞术的灵敏度,为单细胞水平上低丰度蛋白质组分的分析提供了强有力的工具。这不仅拓展了质谱细胞术在生命科学研究中的应用潜力,还为相关疾病的研究和诊断提供了重要的技术支持。通过高灵敏度的多参数分析,ACE技术使得在单细胞层面上绘制低丰度蛋白质组分的图谱成为可能,为科学研究提供了新的视...
CNS「新星」:深度解析蛋白组学技术及其在热门研究领域的应用
2.糖蛋白组分析技术解析3.糖蛋白组分析应用案例二、空间可视化蛋白组学助力解析组织微环境与异质性1.高深度空间可视化蛋白组学平台与优势2.在组织微环境与异质性研究中的作用3.肿瘤靶向药开发中的应用三、「单细胞」空间蛋白组学研究进展1.空间蛋白组学技术原理及流程...
C S C|类原肠胚发育的动态蛋白表达图谱及细胞类型异质性解析
1.小鼠胚胎干细胞(mESCs)向类原肠胚分化的不同时间点蛋白质组学分析为了评估类原肠胚形成过程中的蛋白质组动力学,研究对未分化的mESCs到120h的类原肠胚的五个不同时间点(0h、48h、72h、96h和120h)样本进行蛋白质组学分析(图1A),共鉴定到5079种蛋白质,并揭示了分化过程中不同的蛋白质表达模式。此...
...Res丨王红霞团队系统解析乳腺癌血清外泌体图谱 & 发现治疗新靶点
项目团队系统解析了乳腺癌患者血清细胞外囊泡蛋白质组学图谱,共鉴定了9,699种蛋白质,大大扩展了对肿瘤患者EVs分子标记物的了解;发现乳腺癌EVs蛋白特征与健康人群不同,携带更多分子用于信号传递,表现出免疫反应、代谢和转移相关的特异性特征,反映了EVs在乳腺癌发生发展过程中的功能和分子异质性。基于此,构建了特异性...
进展|糖型解析层面的抗体middle-down质谱分析
与热应力持续时间无关,单个糖型(G0F、G1F和G2F)的middle-down脱酰胺评估没有显著差异(图4)。Asp325突变体的插入实验证实了middle-down策略评估单个糖型脱酰胺水平差异的能力。由于未修饰的Asn325单抗和Asp325单抗之间的糖型相对丰度的差异,与总加标量(10%)相比,蛋白型(糖型%×脱酰胺%)混合的比例不同...
使用非数据依赖采集法实现氢/氘交换质谱数据自动化分析
图9.DNA-PKcs+AZD7648的自动化HDX分析流程结果。总的来说,该研究开发了AutoHX软件,通过自动化数据分析和基于DIA的HX-MS2工作流程,显著提高了氢/氘交换质谱技术在蛋白质结构和药物结合分析中的效率与应用范围,使得这一领域技术更加易于使用并可供更广泛的科研社区应用。该工作的亮点,从实验设计上:考虑到了目前HDX...