Angewandte(IF=16.1)丨基于荧光肽偶联探针的通用蛋白分析平台
通过细胞共聚焦显微镜观察,研究PCPs在活细胞中对目标蛋白质的特异性成像。7、空间蛋白质组学分析:利用多个PCPs对不同的细胞亚型进行成像,并分析其荧光响应,以识别不同细胞亚型的特征。研究结果????1.PCPs具有优异的光物理性质PCPs在溶液中表现出明显的荧光发射,并且其荧光强度随着甘油浓度的增加而显著...
蛋白质基因组学特征或增加前列腺癌进展风险
该项多组学分析自美国军队卫生系统纳入57例非洲血统和55例欧洲血统的、有平等机会接受治疗的前列腺癌患者组织标本构成了一个队列,使用全基因组深度测序技术、基于蛋白质组学和磷酸蛋白质组学的定量质谱技术进行分析。结果显示,在基因组谱、差异化的蛋白质组谱和磷酸蛋白质组谱中,发现了血统相关的体细胞突变特征,包括...
Gut Microbes(IF=12.2)| 多组学分析揭示UC相关抑郁焦虑机制
2、研究队列:来自江苏省中医院240人,年龄18-65岁;两个阶段:招募129名活动性UC患者(第一阶段69名,第二阶段60名);三组:UC组,MDD(无IBD但有抑郁和焦虑患者)组,HC(健康对照)组3、研究方法:①微生物分析:收集并制作粪便样本,提取DNA,测序;②代谢组学分析:收集并预处理空腹血清样本,质谱分析;③蛋白组学分析;...
如何看懂蛋白质组学图结果?全面解读质谱成分
通过比对质谱图中的峰和注释信息,我们可以尝试鉴定样品中存在的蛋白质。这可以帮助我们了解样品的蛋白质组成。4.2差异分析通过比较不同样品的质谱图,我们可以发现样品之间的差异。这可以帮助我们了解不同条件下蛋白质的表达变化,从而揭示生物体内的生理过程。4.3功能分析通过对质谱图中的蛋白质进行功能注释,我们...
...刘敦华教授等:枸杞果实生长发育过程中寡糖代谢的蛋白组学分析
通过iTRAQ定量蛋白组学技术,从生物过程、分子功能和细胞组成3个方面分析在GO数据库中所筛选到的差异蛋白,进而做更准确的功能注释。如图2所示,通过GO功能注释,分别筛选出枸杞生长过程中5个时期与寡糖合成代谢相关的差异蛋白共461种。随着果实的不断发育成熟,与寡糖合成相关的蛋白质在数量和丰度均有显著变化,上调...
研究人员开发出定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具
DEP2集成肽段至蛋白重定量算法、缺失值填充方法,可用于分析肽段层面和蛋白组层面的定量蛋白质组、修饰蛋白质组数据(www.e993.com)2024年7月24日。同时,DEP2捆绑了以模块化搭建的shiny应用,可以无代码方式同时处理多个蛋白质组学数据。DEP2兼容多类型上游结果,为研究人员处理蛋白质组数据提供了便利。该R包已开源发布在httpsgithub/mild...
高分辨质谱仪Orbitrap Astral在蛋白质组学中的应用
(1)OrbitrapAstralMS可实现窄窗口DIA,隔离宽度与DDA分析相当。(2)全覆盖蛋白质组的短梯度极致探究,过去酵母蛋白质组1h极致结果是4000个蛋白,而Astral高分辨质谱8min梯度即可得到4100个蛋白,上机梯度15min以后可达到4500个蛋白。人293T细胞在Astral高分辨质谱1h上样量2μg时可达到9879个蛋白,且即使是上样...
中科院1区if8.8:综合代谢-蛋白质组学研究黄芩不同生长阶段的变化
根据GO富集分析结果,可将具有丰度差异的蛋白质分为三组(生物过程、细胞组成和分子功能)(图2B)。我们通过对枯芩和子芩的GO注释,共发现有746个上调和1069个下调的蛋白,其中13个被分配到生物过程组(主要是代谢过程、细胞过程、生物调节、对刺激的反应和定位)、2个被分配到细胞成分组(细胞解剖实体和含蛋白复合物),以...
沈柏用、陈赛娟、方海、印彤团队首次将临床蛋白组学用于胰腺癌...
在研究过程中,该团队还自主研发并创建了交互式网站PD[AC]2(httpgenetictargets/pdac2),以指导用户在线学习临床蛋白组数据整合分析技术。通过该网站提供的原始数据、代码和资源,研究者们可以重现文章中的所有分析结果,参考研究的思路和方法,深入掌握临床组学整合分析的基本方法,真正实现科研数据和代码资源的...
蛋白质组学前沿技术-蛋白冠蛋白质组学
康林上海百趣生物蛋白质组学产品总监。在蛋白质组学领域拥有近10年工作经验,服务过近百家医院,高校、研究所等科研单位,在蛋白质组学方案设计、实验流程、数据分析及蛋白质组学数据库应用等方向有丰富的项目经验,协助客户发表多篇蛋白质组学高分文章。