...MetaSVs:结合长、短reads用于宏基因组结构变异分析和可视化流程
在这里,我们建立了一个整合了Nanopore长reads和Illumina短reads的MetaSVs流程来分析微生物基因组中的SVs,并进一步确定可以反映代谢差异的差异SVs。我们的流程为研究人员提供了在不需要特定技术专长的情况下轻松获得微生物基因组中的SVs和相关代谢通路,这对于对宏基因组中的SVs感兴趣但缺乏复杂生物信息学知识的研究人员特别...
Phytomedicine | CETSA和TPP策略用于天然产物的靶点鉴定和药物...
(2)热蛋白质组分析(TPP,又称MS-CETSA),利用基于ms的定量蛋白质组学或双向差异凝胶电泳(2DDIGE)对蛋白质进行鉴定和定量,从而获得生理相关环境下全蛋白质组的蛋白质稳定性图谱。TPP和改良的TPP方法对于基于表型的药物发现衍生的生物活性化合物的靶点鉴定非常理想。(3)高通量(HT)-CETSA,将CETSA与AlphaScreen、报告...
托普云农“高通量植物表型采集分析平台”荣获CISILE 2024 “自主...
而托普云农自主研发的高通量植物表型采集分析平台通过智能化、自动化设计,营造了一个高度便捷化的操作体验:植物传送、图像采集、数据分析全流程自动化,大大简化人工操作;用户界面简洁友好,快速呈现分析结果,支持一键导出和历史图像调阅,进一步降低使用门槛;平台配备必要的安全装置和数据保护措施,确保了操作安全性和数据安全...
透明血管型Castleman病免疫表型特征分析
在11例FL中,在肿瘤性滤泡中,CD21表达的FDC网与BCL2的阳性区域基本一致。HVCD组与其他两组疾病的差异有统计学意义(P<0.05)。结论:HVCD具有独特的免疫表型特征。生发中心BCL2的阴性面积明显小于CD3的阴性面积。生发中心BCL2的阴性区域明显小于CD21表达的FDC网。HVCD的这两个免疫表型特征在诊断和鉴别诊断中非常重...
人类表型组学:为破解生命密码提供全新思路——“聚焦前沿科学问题...
由于进化历程和生活环境不同,人群表型存在巨大差异。测量成本较高、采样要求不同、标准尚未统一等问题,也成为数据库间比对和表型组间关联分析的障碍。“我们要建立表型组数据汇交和分析平台,更好保障表型组学研究持续开展。”田梅认为,表型与生活环境、生活方式密切相关,开展各种人群在多个地点、多种环境影响下的数据比较...
人类表型组学:为破解生命密码提供全新思路
由于进化历程和生活环境不同,人群表型存在巨大差异(www.e993.com)2024年10月16日。测量成本较高、采样要求不同、标准尚未统一等问题,也成为数据库间比对和表型组间关联分析的障碍。“我们要建立表型组数据汇交和分析平台,更好保障表型组学研究持续开展。”田梅认为,表型与生活环境、生活方式密切相关,开展各种人群在多个地点、多种环境影响下的数据比较...
Nature Genetics | 肝硬化遗传机制的新突破:跨群体遗传分析揭示...
肝硬化作为一种复杂疾病,其发病机制涉及多种因素。该研究虽然尝试通过PheWAS探索遗传变异与其他健康状况的关联,但表型的定义和测量可能存在差异,影响了对遗传变异作用机制的全面理解。潜在的研究方向基因和环境因素的交互作用分析(AnalysisofGene-EnvironmentInteractions)...
“国际人类表型组2.0”启动 探寻生命健康奥秘
上海国际人类表型组研究院副院长、复旦大学人类表型组研究院执行院长田梅举了个形象的例子:如果有一对双胞胎,一个从小在赤道的低海拔地区长大,一个在高纬度的高海拔地区长大,他们会有完全不一样的表型,不仅外表会产生差异,他们的蛋白、代谢和器官功能也会发生不同变化。这就是环境因素对人的表型的影响,而这些...
多样性展现:质谱流式细胞技术解析细胞表型
首先,质谱流式细胞技术具有强大的细胞分类能力。它可以有效识别并统计特定的细胞群体,包括譬如免疫系统中的T细胞、B细胞等效应细胞。其次,该技术提供精确的蛋白质表型解析。对比其他传统表型解析手段,质谱流式细胞技术能在单个细胞层面提供更精确、更全面的分析,帮我们揭示生命的底层秘密。
壁面剪切应力评价优秀女子冰球运动员左心室节段性血流动力学特征
从IVPG组间差异分析中可以看出,优秀女子冰球运动员在快速射血期的LV心尖三腔心切面IVPG显著高于健康对照组(图3B),快速射血期ApL的WSS则表现为优秀女子冰球运动员显著高于普通运动员(图4B)。相较于健康对照组,优秀女子冰球运动员在快速射血期较高的IVPG是心脏的心肌收缩性能提升的具体表现(LaCombeetal.,2023...