SNP基因分型
SNP全称SingleNucleotidePolymorphism,即单核苷酸多态性,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说...
iMeta | 上海市食药检院/美吉生物-??MIST: 可交互微生物鉴定和...
随着NGS技术的发展,下游生物信息学分析具有挑战性,需要开发更多的数据挖掘软件和系统。我们开发了一个用于微生物分类和鉴定的系统。它利用扩增子测序数据有效地分析不可培养微生物,基于WGS数据可准确地进行基因分型并完成ARG和VFG注释,此外平台还实现了基于SNP的菌株溯源分析。结果系统概述该系统由三个分析流程组成...
生物信息学、生信计算必备网址大全
耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室主要致力于生物信息学的研究,其研究领域包括基因组序列,大分子结构和表达基因数据,比较基因组学,基因表达分析,大分子几何学等。该网站还提供研究、工作、演讲、论文等方面的信息。用于比较基因组学的生物信息学工具:httppga.lbl.gov/Workshop/webTools.htm用于比较基因组学的生物...
Primer Premier 6.25 Mac版 生物信息学研究工具
PrimerPremier6.25Mac破解版是一款生物信息学软件,主要用于分子生物学和基因组学研究。它具有多种功能,包括引物设计、序列分析、PCR优化、限制性酶切位点分析等。该软件可以帮助用户设计高效的引物和探针,优化PCR反应条件,快速分析序列特征和限制性酶切位点等,为分子生物学实验提供便利。PrimerPremier的搜索算法...
猛犸基金会X华大智造 | 联合发布高校《生物信息学实验》教育解决...
DNA条形码是指生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段,是利用生物体DNA中一段保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术。DNA条形码不仅用于物种鉴定,同时也帮助生物学家进一步了解生态系统内发生的相互作用。在《中国药典》增补本中,中药材DNA条形码分子鉴定被列入指导原则。该指导...
SNP(Single Nucleotide Polymorphism)综述
SNP虽然列于基因体学的范畴内,但若能结合多重学科,将可发展个体化医学,也就是针对个人基因特质的医药方式(www.e993.com)2024年10月10日。除了人类基因组的DNA序列数据以外,尚需药物遗传学、临床药理学、毒理学、生物信息学、蛋白质体学、生物信息学等的参与。蛋白质体学的研究目标,是确定所有的机体内蛋白质及蛋白质间的相互关系,可望对个体化...
简化基因组测序2b-RAD探究蛤的寄生虫抗性及繁殖问题
2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33bp的标签,这些标签经过富集后用于高通量测序,通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。2b-RAD技术流程技术特点...
瑞士南部的拉金霍恩山山峰发现失踪30年登山客
该公司生物信息学主任艾伦·格雷塔克称,研究古人类DNA很有挑战性,因为古人类的DNA高度降解,通常会与来自细菌的DNA混合,所以从木乃伊身上留下的人类DNA数量可能非常少。但由于绝大多数DNA是在所有人类之间共享的,因此科学家不需要整个基因组来预测一个人的身体特征,只需要分析基因组中某些特定位点,即所谓的单核苷酸多态...
同源重组修复缺陷(HRD)临床检测与应用专家共识
基于全基因组的突变谱系分析可完整反映肿瘤细胞内源性与外源性的突变进程,且每个突变进程包含了DNA损伤、修复以及复制等各组件,通过生物信息学技术还可以得到与其对应的突变谱系特征。单碱基突变特征3(singlebasesubstitutionSignature3,SBSSignature3)已被证实与乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌等肿瘤的BRCA突变、BRC...
【修正版】Ka/Ks比值:核酸分子进化的指标(初级篇)
Ka/Ks分析是生物信息学中最常见的分析之一,它在研究核酸分子进化方面有重要应用,如果你还不知道的话——咳咳!注意听讲了!(敲黑板)打开网易新闻查看精彩图片01“什么是Ka/Ks?”在遗传学中,Ka/Ks表示的是两个蛋白编码基因的非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks)之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作...