高性价比2区: 贵中医大基于蛋白质组学和生物信息学探究土茯苓治疗...
5.差异表达蛋白的鉴定根据蛋白质丰度水平的差异,通过t检验评估实验组和对照组之间差异的显著性。不同组之间的DEP根据倍数变化>1.2或<0.85和p<0.05进行鉴定。DEP具有两个或多个特异性肽片段。与正常对照组相比,模型组中鉴定出175个DEP(图5A)。与模型组相比,SGR处理后发现220个DEP(图5B)。模型组和SGR组共发现92...
《食品科学》:宁夏大学剧柠教授等:原料乳冷藏过程中差异表达蛋白...
本研究对4℃冷藏前期(d0vsd3)和冷藏后期(d3vsd6)的原料乳采用蛋白质组学方法进行分析,从微观角度探究原料乳品质劣变的原因。结果发现,不同冷藏阶段乳中蛋白质变化复杂,且生物学功能存在较大差异,冷藏过程中的蛋白质主要行使细胞进程和代谢过程这两种生物学功能。1)细胞进程。冷藏前期的差异蛋白主...
...就能由内而外的改变!Nature多组学研究:运动从基因表达到蛋白质...
以往研究已分别从转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学等各种“组学”平台证实,运动几乎可以影响人体内所有的器官系统[1],其强大的功效包括延缓衰老、增强免疫力、降低全因死亡以及癌症风险、减少心脏代谢和神经系统疾病等等。然而,迄今为止的研究通常仅在某个特定时刻覆盖一两个组学领域,并且倾向于侧重单一...
上海威奥|复发性流产患者胎盘绒毛组织中差异表达蛋白的蛋白质组学...
上海威奥|复发性流产患者胎盘绒毛组织中差异表达蛋白的蛋白质组学分析(2)2024-03-1915:05发布于:上海市返回搜狐,查看更多责任编辑:平台声明:该文观点仅代表作者本人,搜狐号系信息发布平台,搜狐仅提供信息存储空间服务。首赞+1阅读()内容举报大家都在看美升级制裁卢布应声下跌俄民众抢购美元高考结...
个体差异的源泉:解析单细胞蛋白质组学在生物药物开发中的关键性
1.单细胞蛋白质组学的基本原理:传统的蛋白质组学研究通常是在组织或细胞群体水平上进行的,而单细胞蛋白质组学则突破了这个限制,实现了对单个细胞中蛋白质的高通量分析。这项技术基于单细胞分离和质谱分析技术,可以检测并定量单个细胞中的蛋白质。通过单细胞蛋白质组学,我们可以揭示细胞之间和细胞内的蛋白质差异,理...
透视生命的单细胞世界:理解单细胞蛋白质组学对生物药物的影响
单细胞蛋白组学是蛋白质组学领域的一项重要技术进展,它使我们能够透过显微镜窥探生命的微观世界(www.e993.com)2024年10月7日。生物药物的研发需要对细胞内蛋白质表达进行准确评估,而传统的蛋白质组学方法常常掩盖了细胞间和细胞内的异质性。单细胞蛋白组学的出现填补了这一空白,为我们提供了更详细、更全面的细胞蛋白质表达信息。本文将带领读者深入了...
科普|蛋白质组学 TopDown:“Proteoform”一词的前世今生
而随着质谱法在蛋白质组学中的应用,Top-Down、Bottom-Up方法的开发,研究者们已经可以提供蛋白质的精确组成,然而如何使用合适的术语描述蛋白质的型体差异的问题久未解决。在文献中可以找到下列词汇:"proteinforms","proteinisoforms","proteinspecies","proteinvariants"以及蛋白质的"modforms"。这些词都存...
4D蛋白质组学解析:从静态到动态的生物大数据分析
1.静态蛋白质组学分析:静态蛋白质组学是传统的蛋白质组学研究的一部分,它通过比较不同条件下蛋白质的表达差异来揭示生物系统的特点。这包括对细胞或组织中蛋白质表达水平的定量和质谱分析。静态蛋白质组学研究可以帮助我们理解蛋白质的组成和功能,发现与疾病相关的蛋白质标志物。2.动态蛋白质组学分析:与...
Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...
首先,我们从IMG/M的26931个宏基因组数据集中剔除了所有与IMG数据库中超过10万个参考基因组或Pfam匹配的基因,从而确定了新的蛋白质空间。接下来,我们将剩余的序列聚类为蛋白质家族,探索它们在分类学和生物群落中的分布,并在可能的情况下预测它们的三级(三维)结构。
...室王永成和傅旭东团队实现深度单细胞转录组与蛋白质组分析新突破
化学系方群教授团队与浙江大学良渚实验室王永成团队和傅旭东团队合作,基于微流控纳升级超微量样品操作技术、深度单细胞蛋白质组分析技术和单细胞转录组测序技术,发展了单细胞同时转录组和蛋白质组(Single-cellsimultaneoustranscriptomeandproteome,scSTAP)分析技术,首次实现针对同一单细胞个体转录组和蛋白质组深度联合...