Nature︱细胞内的“搬运工”:揭秘蛋白质定位调控的新策略

为了研究缺乏已知小分子结合位点的蛋白质,研究人员合成了双功能分子TRAM1,其能够与大肠杆菌二氢叶酸还原酶结构域(EcDHFR)和FKBP12F36V结构域结合,这些结构域因其与大多数哺乳动物蛋白的紧密的结合亲和力和正交性而被广泛使用。然后生成了mCherry融合EcDHFR和来自HIV-1REV蛋白的NES作为穿梭蛋白,并在HeLa细胞中稳...

...通过调节肠道菌群和代谢且直接抑制巨噬细胞M1极化从而缓解结肠炎

此外,如免疫印迹分析所示,DSS小鼠的结肠中IL-17受体衔接蛋白Act-1和IL-17RC的蛋白质水平显著降低(补充图1G),这两种蛋白是上皮细胞内IL-17/Act-1信号传导的关键参与者,对维持屏障功能和调节Occludin的表达和定位至关重要。葛根素有效地逆转了这些减少。最后,PAS染色,也称为杯状细胞染色,显示了上皮结构的显著丧失,...

科学家解析大肠杆菌关键酶代谢纤维结构,助力治疗细菌病原体疾病

大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶，是许多不同疾病的潜在药物靶点。而该团队通过分析表明：α-螺旋12是真核大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶的一个更具特征的特征。并表明：当将这种螺旋插入大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶，会使其像人类大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶一样在底物结合状态下形成纤维。此外，课题组还获得了具有共价结合的D...

【陈巍学基因】视频 131:Bridge RNA 做基因编辑

这样,通过对活下来的大肠杆菌做Nanopore长读长测序,就可以知道供体序列被插入到大肠杆菌基因组的哪些位置了。这是实验得到的,供体序列在大肠杆菌基因组中的插入结果。g图展示了在整个大肠杆菌基因组中插入的位置。绿色的三角,是与靶向的位置序列一致的插入点;蓝色的三角,是差一个碱基的插入点;黄色的三角...

科学家解析大肠杆菌关键酶代谢纤维结构,分辨率达到2.9埃,助力治疗...

“我们提供了分辨率达到2.9埃的高清结构图,解释了关于大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶的疑问,为开发针对这种酶的物种特异性的小分子抑制剂和激动剂、以及开发新型抗生素提供了思路。”上海科技大学刘冀珑教授表示。研究中,他和团队展示了大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶纤维、与大肠杆菌胞苷三磷酸、还原型辅酶Ⅰ和共价抑制剂...

汪劲:描述生物系统涌现行为的景观和流理论视角

在文章中,行为的涌现、熵与自由能相关的热力学,以及速率和路径的动力学,都得到定量论证,并讨论了层级化组织结构(www.e993.com)2024年11月20日。文章通过图示说明了理论在各个生物学领域的应用,涵盖蛋白质折叠、生物分子识别、特异性、生物分子演化和平衡系统设计、细胞周期、分化与发育、癌症、神经网络和脑功能、非平衡系统的演化、基因组结构动力学...

生物计算:超越图灵模型的细胞计算机 | 智能渐近线

将细胞计算机的计算能力与生物系统的潜力进行比较是很有趣的。在细胞中能够实现的一个相当大但合理的逻辑函数可能需要6到8个基因,而大肠杆菌细胞有4000多个基因。这表明我们只是刚刚开始解锁生物系统的计算能力。尽管如此,在生物细胞中设计和实现布尔逻辑函数如今已经成为常规过程。

这个“酿酒”细菌有望成为下一个“细胞工厂”—新闻—科学网

不过这种天然能产生乙醇的“罪魁祸首”却是科学家眼中的潜力股——有资质成为像酵母、大肠杆菌那样的底盘细胞,为人类制造大宗化学品。转录因子稳定细菌染色体三维构象适应环境胁迫。中国农科院沼科所供图这就是早在1928年被人们发现的运动发酵单胞菌。5月8日,农业农村部成都沼气科学研究所研究员何明雄团队在《核酸...

影像未来,见所未见|第一届化学成像前沿科技及应用高端论坛成功举办

为此,HaonanLin研究员开发了一种纵向高光谱受激拉曼散射(SRS)化学成像方法,能够提供单细胞的化学成分组成等信息,比如可直接观察大肠杆菌中的游离脂肪酸,进而分析活细胞中脂肪酸的链长和不饱和度。报告人:石玲燕加州大学圣地亚哥分校助理教授报告题目:Super-ResolutionMultimodalImagingofAlteredMetabolismin...

大肠杆菌拥有记忆力;取材大气,生产塑料;减少大脑胆固醇竟能控制...

大肠杆菌会利用细胞内的铁元素水平来存储环境信息,这个“铁忆”存储系统使它们能基于过往经验来优化行为选择。这对于人类控制细菌提供新的方向,特别是干预细菌耐药。研究人员从大气取材制得塑料薄膜和刚性件——可以像传统塑料一样被拉伸、弯曲和成型。这为减少碳排放背景下的塑料生产提供方法。