重磅发布|中疾控艾滋病检测实验室质控指南:流式/PCR/基因测序仪质控

基因序列测定:一代Sanger测序、二代测序。序列比对和耐药位点判读:Sequencher5.0软件、LosAlamos国家实验室(LANL)HIV序列数据库GeneCutter工具、BioEdit软件、MEGA11软件等。作用意义用于补充试验的抗体确证检测,以及用于区分新近感染者和既往感染者的新近感染检测等。准确可靠的CD4+T淋巴细胞检测为...

真迈测序平台在WES测序结果准确性多平台横向对比中表现出色

该研究采用肿瘤标准品HD832和正常样本HG001,通过NovaSeq6000、NextSeq550、GenoLabM,FASTASeq300与SURFSeq5000测序平台,采用多款主流生信软件,比较SNP和InDel在各测序平台与分析软件下的表现情况,发现测序平台对于全外显子组测序(WES)的结果影响较小,而分析软件对WES结果的影响更大。此外,也强调了生物学重复对...

经典入门 | 高级转录组分析和R数据可视化 (2024.12)

转录组的测序分析也相对成熟,从RNA提取、构建文库、上机测序再到结果解析既可以自己完成,又可以在专业公司进行。概括来看转录组的分析流程比较简单,序列比对-转录本拼接(可选)-表达定量-差异基因-功能富集-定制分析。整个环节清晰流畅,可以作为最开始接触高通量测序学习最合适的技术之一。但重点和难点在于理解这些过...

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

对纳米孔测序的原理和特点,纳米孔测序(包括tNGS、mNGS和WGS)的全流程(包括样本采集与运输保存、检测过程、生物信息学分析、报告解读等环节)进行了规范,并对其中的关键问题给出了推荐意见,以期为纳米孔测序的规范化流程管理,临床危重症感染患者及肿瘤患者的

算力+存力:优化基因测序的关键所在

而这样的解决方案又分为两大类:一类基于CPU进行加速,如CPU+Sentieon软件。Sentieon是一款专门针对X86指令集开发的基因测序加速软件,自2015年发布以来已被全球超过1200家商业公司和科研机构使用,并多次获得国际生信大赛第一名。另一类基于GPU进行加速,如NvidiaGPU+Parabrics软件。Parabrics是基于GPU并行计算技术进行...

高分辨率空间组学国产技术平替,就找德运康瑞 SEERNA@ ISS产品解决...

SP3001、SP3002和SP3003三款试剂盒是原位测序实验必须使用的通用试剂盒,可以打包整套订购,靶标探针个性化定制和Panel类型选择根据研究目标和需求进行选购,我们提供最快2周时间的个性化探针定制和发货,设备运行软件和生信分析配套软件均可免费下载使用(www.e993.com)2024年11月3日。如果您对我们本次发布的产品或技术服务有兴趣,请联系德运康瑞获取更多...

BOE IPC·2024 智慧医工论坛精彩演讲内容实录_手机新浪网

阳性结果占了81%,这个比药品,比医疗器械阳性结果占的显然高。但是,我们可以发现单中心实验居多,不是标准临床实验,这个可以带来很多临床的偏差。它的偏差在什么地方?我们把偏差做一个分析,这是循证医学分析的系统,叫PROBAST,就是想分析一下这个研究靠不靠谱。发现最不靠谱的就是分析方法,就是AI的分析方法包括怎么...

青年博士Nature,Science双发,植物领域迎来史上“翻天覆地”的变化!

具体课程内容都可滑动查看课程一、机器学习微生物组学第一天1.微生物学基础知识回顾2.机器学习基本概念介绍a.什么是机器学习b.监督学习、无监督学习c.常用机器学习模型介绍3.混淆矩阵4.ROC曲线第二天R语言简介与实操1.R语言概述2.Rstudio软件与R包安装3.R语言语法及数据类型4.条件...

九合报告:不朽的计算——比特连接世界,词元生成未来

多智能体协作(MultiagentCollaboration):通过多个智能体之间的合作来提高任务执行效率和准确性的方法。在这种模式中,多个智能体分担任务,并通过相互交流和协作,共同完成复杂任务。2.大脑:从神经网络到LLM,作为大脑模型之一的深度学习(1)大脑是已知宇宙中最复杂的设备,深度学习是仿生产物...

专访四川大学生命科学学院曹洋:AI 时代的药物设计需要从理论到...

雷峰网:您觉得这款软件在同类型中的核心竞争力是什么?曹洋:从算法角度上讲,它的健壮性更好,能超快速度处理大规模数据。因为抗体从基因重排到体细胞超突变,其中的多样性非常大。若想在不同序列模式上进行准确界定,就需要从算法上做比较细致的优化。