浙大细胞“黑客”技术登上《科学》:改写氨基酸“代码”,创造全新...

当非天然氨基酸可以高效地进入蛋白质一级结构,这意味着蛋白质分子的设计获得了一个崭新的维度,可以更自由地引入特定功能的氨基酸,以生物合成的方法创造出带有非天然氨基酸的药物,这将是药物设计的新突破。同时,这项技术为研究蛋白质修饰提供新的“生物元件”和工具。因为蛋白质的性质和功能不仅取决于其结构,还和蛋白...

...竞赛常规赛队伍专题之HELLO-ZJU团队丨AI+自动化技术改造蛋白质...

乙酰苯丙氨酸(pAcF)是一种重要的非天然氨基酸,将它插入到蛋白中能够实现在蛋白质特定位点上的化学分子偶联及修饰,对于制造高效的抗体偶联药物、双特异性抗体等具有重要的意义。然而,即使基因密码子扩展(GCE)技术应用已经比较广泛,利用该方法向蛋白质中引入pAcF的效率仍然不高。这主要是因为用来向蛋白质中插入这种成分的...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

1902年诺贝尔化学奖获奖者、德国化学家费舍尔(HermannEmilFischer)在20世纪的第一个十年中,率先提出氨基酸之间的肽键相连接形成蛋白质的论点,为蛋白质结构研究开启先河。然而直到半个世纪后的1959年,英国生物学家马克斯·佩鲁茨(MaxPerutz)和约翰·肯德鲁(JohnC.Kendrew)使用当时新兴的X射线晶体衍射技术,分别对血...

D-氨基酸多肽的医药学价值

这些肽和蛋白通过由非核糖体肽合成酶(NRPS)介导的游离D-氨基酸的直接偶合而合成,或者通过L-多肽前体进行D-修饰——也称为翻译后L-氨基酸差向异构化(posttranslationalepimerization)——而生成。前一种机制是原核生物所特有的,而后一种机制发生在原核细胞和真核细胞中。存在于天然生物结构中的D-氨基酸最...

David Baker:可预测所有生物分子,生成具有高级结构的蛋白质

蛋白质是生命活动的物质基础,也是细胞内部的主要功能分子。公开资料显示,AlphaFold是DeepMind推出的蛋白结构预测工具;RoseTTAFold是DavidBaker实验室推出用于预测蛋白质结构的深度神经网络,RFdiffusion则是该实验室推出用于从头构建全新蛋白质的生成式AI工具。这些工具专注于蛋白质的氨基酸构建模块,而非捕获蛋白质...

国内Nature,Cell三连发:翻译后修饰研究如何花式发顶刊

单磷酸腺苷酸化修饰(AMPylation)是一种广泛存在于原核和真核生物中的蛋白质翻译后修饰,在腺苷酸化酶的催化下,使用单磷酸腺苷基团(AMP)修饰蛋白质的氨基酸侧链(www.e993.com)2024年11月16日。本文报道了使用三磷酸腺苷(ATP)作为配体和宿主肌动蛋白作为激活剂,嗜肺军团杆菌的效应蛋白LnaB对PR-Ub上的磷酸核糖基的磷酰基进行AMPylation,从而生成ADPR-...

谁能获得今年的诺贝尔奖?

生理学或医学奖、化学奖中备受瞩目的“种子选手”,涉及领域包括:环鸟苷酸-腺苷酸合酶(cGAS)-干扰素基因刺激因子(STING)通路的发现;CAR-T细胞疗法;人工智能(AI)加速科学;新一代测序(NGS)技术;蛋白质折叠机制;自由基与抗氧化剂在人体疾病中的重要作用。

【高转十强】康化新药:合成服务“新引擎”,制药转化新速度

虽然天然氨基酸便宜易得,但种类不多,因此合成非天然手性氨基酸便成为一道“必答题”。在生命体中,尽管辅因子或化学修饰的方法大大拓展了20种天然氨基酸构成的蛋白质所能承担的功能,但其仍存在着一定的局限性。非天然氨基酸的发现与利用,大大增强了人类深入理解、精确调控甚至理性设计生命体的能力。基于多年非天然氨基酸...

全球发布 | 《重组III型三螺旋胶原蛋白白皮书》(中英双语版)内附...

III型胶原蛋白在细胞内作为前胶原被合成。24个氨基酸长度的信号肽被切除后形成前胶原链。3条α链形成一个同源三聚体,即III型前胶原分子。通过羧基端(C)和氨基端(N)蛋白酶去除非两端的大球形域,形成III型胶原蛋白。此外,还会发生几种共翻译和翻译后修饰。

AI+蛋白质、生成生物学……这些明星创始人竟师出同门!

在适应症选择方面,主要布局在遗传代谢病,有PKU苯丙酮尿症LBP、H氨酸代谢病LBP、M氨基酸代谢病LBP三条在研管线。北京大学王初团队北京大学化学与分子工程学院王初教授的课题组同样人才济济。作为北京大学第一个化学蛋白质组学研究课题组,该团队以蛋白质组学研究为基础,但又比它更深一层。