AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
当不同的氨基酸连成一串的时候,它们会脱水形成肽链,也就是蛋白质的一级结构;而这样的一级结构是不稳定的,受到疏水作用、氢键和范德华力等影响,肽链最终会折叠成一个非常复杂而稳定的三维结构。图1是一个蛋白质折叠前后对比的例子。图1:蛋白质折叠示意图丨图源:wiki蛋白质折叠成何种结构决定了它将具有何种功能,...
人工智能终结了蛋白质研究吗?一文读懂蛋白质折叠的前世今生
上:从左往右依次为SARS-COV-2刺突蛋白、新冠疫苗靶点;5-羟色胺受体、管控情绪与消化;血红蛋白、输送血液中的氧气;细胞因子、调节免疫防御。下:从左往右依次为胶原蛋白、让组织成型;萤火虫萤光素酶、发光;抗体、鉴别外来物质;胰岛素、调节血糖;淀粉酶、消化淀粉;瘦素、控制食欲。图源:RCSBPDB当谷歌的公关部门向...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情...
基于深度学习的蛋白质远程同源性检测和结构比对
据介绍,利用生物技术中的序列-结构-功能关系需要改进排列与先前注释的蛋白质序列相似性低的蛋白质的方法。研究人员开发了两种深度学习方法来解决这一差距,TM-Vec和DeepBLAST。TMVec允许在大型序列数据库中搜索结构-结构相似性。它被训练为直接从序列对中准确预测TM得分作为结构相似性的度量,而不需要中间计算或结构的...
AI Agent自主设计全新蛋白质登Nature!机器人可自己做实验,无需...
就像一个能自己做实验的机器人科学家。它能通过自主学习自行进行蛋白质设计,同时在实验室里自动进行测试。AIAgent,已经可以不需要人类帮助,就能自行设计和测试全新的蛋白质了!这个AI能够自主学习蛋白质结构与功能关系。而且在糖苷水解酶领域创造出的新蛋白质,比原始蛋白质更稳定。
...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...
本课程围绕蛋白设计基础与前沿工作展开讲述,从蛋白结构的预测与优化到蛋白的从头设计进行深度教学,本课程主要面向有编程基础的学员,对基础知识进行详细讲解,并且会结合前沿文献讲解相关技术的应用(www.e993.com)2024年7月24日。帮助学员们,通过本次培训学员将了解蛋白质设计的底层逻辑与基本规则,并掌握蛋白质设计中的常见蛋白质设计算法的实际操作,具...
从罕见病研究到批量转化数十亿美元项目,我和同学是如何做到的?
同样的道理,这位2013年就开始拥抱人工智能的生物学家认为:当红的蛋白质结构预测工具AlphaFold并不会令真正的结构生物学担忧,因为结构功能之间关系的背后有很多生物学的东西,不是简单预测个结构就能完成的事情,而且大量的结构解析能够推动产业化的应用。目睹了技术的进步只用了十多年的时间把约100亿美元才测得人类...
浅谈胶原蛋白对于抗衰的作用与应用
对于直接注射和刺激合成这两大类方式,其实一般是有年龄划分的。年龄较小的求美者细胞活力、细胞合成胶原的能力更强,其实更适合通过刺激的方式促进胶原蛋白的生长。而对于年龄较大的求美者,胶原蛋白合成能力没有那么强了,则更适合采用外源补充的方式。其次,医美项目需要在专业医生的指导下进行,以确保安全性和有效性...
AI Agent自主设计全新蛋白质登Nature!威斯康星大学让机器人科学家...
就像一个能自己做实验的机器人科学家。它能通过自主学习自行进行蛋白质设计,同时在实验室里自动进行测试。AIAgent,已经可以不需要人类帮助,就能自行设计和测试全新的蛋白质了!这个AI能够自主学习蛋白质结构与功能关系。而且在糖苷水解酶领域创造出的新蛋白质,比原始蛋白质更稳定。
新药研发(六)| 先导化合物下篇:药物设计之苗头化合物的改造
6.数据可靠性原则:应有可靠的生物活性数据,这些数据应来自于可信的实验方法和实验室。这有助于确保模型的准确性和可靠性。2.2基于结构的药物设计(SBDD)SBDD(Structure-baseddrugdesign)是通过了解药物与靶点(如蛋白质)之间的相互作用,设计出具有高亲和力和选择性的药物分子,细分为两种策略分别是“基于受体的药...