2024年诺奖技术再升级,AlphaFold3来了!超越蛋白质结构,全面预测...
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...
2024诺贝尔化学奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
答案在于,蛋白质拥有丰富而复杂的空间结构,这些结构决定了蛋白质的功能。蛋白质以氨基酸为基本组成单位,氨基酸的不同排列(即序列)以及在此基础上的卷曲折叠,形成了特定的三维立体结构,进而执行不同的功能。人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上...
超越AlphaFold3,OpenAI投资的AI生物初创,分子结构预测新SOTA
蛋白单体预测方面,研究人员将Chai-1与AF2.3比较,发现Chai-1在有完整MSA信息时优于AF2.3,在无MSA信息时表现略差。核酸结构预测方面,不依赖核酸MSA时,使用界面Cα-LDDT评估,Chai-1在这些复合物上的表现与RosettaFold2NA相似。同时,还使用9个CASP15RNA靶标测量C1′原...
2024年诺贝尔奖中的生命科学
蛋白质分子的功能不仅仅与由基因翻译形成的氨基酸序列有关,还取决于它的特定三维结构,因而要揭示蛋白质分子的生物学功能,首先要确定其空间结构。相对于蛋白质单体,实验上解析蛋白质-蛋白质复合物结构要困难得多。目前PDB(ProteinDataBank)数据库中收录的蛋白质单体结构超过4万个,蛋白质-蛋白质复合物结构的数量超过...
Science最新封面 | 用突破性技术建模蛋白复合物
RFAA表明,可以训练单个神经网络来精确建模包含多种非蛋白质成分的各种通用生物分子组装体;可以对蛋白质-小分子复合物进行高精度预测;它还可以为具有两个或多个非蛋白质分子的蛋白质复合物生成准确的模型(www.e993.com)2024年10月18日。预测和设计结果表明,RFAA已经了解了蛋白质-小分子复合物的详细特征,应该可以用于蛋白质-小分子复合物的建模,特别...
分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
1、确定两种蛋白是否有相互作用,一般在后面接WB实验;2、确定两个蛋白的结合的结构域或者位点,一般结合片段截短或者突变实验;??相关资料03Biacore??原理Biacore技术是一种基于表面等离子共振(SPR)原理检测生物分子相互作用的技术,可以用来检测蛋白和蛋白,蛋白和核酸,蛋白和小分子,抗原和抗体等之间的相互作...
「AlphaFold 3」要来了?DeepMind推出新一代蛋白质结构预测工具,已...
更进一步说,蛋白质和小分子复合物的结构预测,应该是结合了AI和CADD两种方法,即分别基于数据库和物理原理,第三大升级:预测核酸、以及翻译后修饰结构。核酸是关键遗传信息的携带者,并破译翻译后修饰--即蛋白质诞生后发生的化学变化。例如,在CasLambda与crRNA以及DNA结合的结构中,CasLambda共享CRISPR-...
追问|蛋白质结构预测模型再升级,解锁新功能直接作用药物设计
常珊:最直接的应用是相互作用复合物结构预测。药物需要通过与体内的靶标,也就是蛋白质等生物大分子相互作用,因此,准确预测相互作用是药物研发的基础。首先,传统的药物筛选需要有明确的靶标,并确定靶标表面与药物小分子或配体小分子结合的部位,而新模型可以直接预测合适的靶标结合位置,即不需要事先指定结合配体的口...
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
AI蛋白质预测和蛋白质设计可以大大加速新药研发进程。通过预测蛋白质的结构和功能,研究人员可以更准确地确定药物与蛋白质之间的相互作用,从而设计出更有效的小分子药物和生物药。还可以通过预测蛋白质与特定分子的相互作用来检测疾病标志物,这对在疾病的早期发现、诊断和预后评估方面具有重要价值。