不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生_腾讯新闻
它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情...
AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?
一个蛋白质如果因为各种原因而没有正确折叠,就有可能不会正常发挥其功能,从而引发疾病,阿尔兹海默病、帕金森等疾病都和蛋白质的错误折叠有关。此外,在药物设计上面,研究人员常常需要开发具有特定功能的蛋白质,而这需要对蛋白质折叠有深入理解。1970年代,美国生物学家、诺贝尔奖得主克里斯蒂安·安芬森(ChristianB.Anfi...
丰富的蛋白质结构域,与蛋白质组大小JoelAMalek之间是什么关系
蛋白质中的保守结构域在蛋白质相互作用、DNA结合、酶活性等重要的细胞过程中起着关键作用。由于最近发布的关于人类基因组中基因数量的预测少于之前的许多人的预测,蛋白质结构域之间的相互作用可能被证明是蛋白质组复杂性的核心。蛋白质结构域在许多物种中通常是保守的,因此,它们提供了一个有趣的数据集,用于分析基因...
使用深度学习来预测蛋白质功能——人工智能进军生物学领域的先锋
例如,广泛使用的蛋白质家族数据库Pfam,包含许多描述蛋白质结构域功能的高度详细的计算注释,例如珠蛋白和胰蛋白酶家族。虽然现有的方法已经成功地预测了数亿种蛋白质的功能,但还有更多的功能没有被研究到——例如,至少有三分之一微生物蛋白质的注释不可靠。随着公共数据库中蛋白质序列的数量和多样性继续快速增加,准确...
动态追踪蛋白质结构:深入了解氢氘交换质谱的原理与应用
三、探究蛋白质相互作用和配体结合蛋白质的相互作用和配体结合对于其功能发挥和药物设计至关重要(www.e993.com)2024年7月6日。氢氘交换质谱技术可以帮助科学家们研究蛋白质与配体或其他分子之间的相互作用。通过比较蛋白质与配体结合前后的氢氘交换情况,我们可以了解配体结合对蛋白质结构的影响以及相互作用的界面区域。这为药物设计和生物分子相互...
深圳湾实验室周耀旗:填补AlphaFold 2缺口,开启所有蛋白质结构的高...
解决同源序列不足的蛋白质结构预测的两种方法是:用新解析的基因组或宏基因组数据更新序列数据库,并提高同源搜索的灵敏度。这可能对某些蛋白质有效,但不能解决那些缺乏天然同源序列的蛋白质的问题。另外一种方法是,通过学习数据库中的其他进化序列,使用隐含进化信息的蛋白质语言模型。
圆二色光谱分析指导蛋白质结构与功能关系的研究
蛋白质的结构与其功能密切相关。圆二色光谱分析可以提供有关蛋白质结构的信息,从而帮助理解蛋白质的功能。例如,蛋白质的二级结构可以影响其与其他分子的相互作用,进而影响信号传导、酶活性和配体结合等功能。通过圆二色光谱分析,我们可以研究蛋白质结构与功能之间的关系,为深入理解蛋白质的生物学功能提供重要线索。
中国农业大学吴继红教授等:大米蛋白质与米饭食味品质关联性研究进展
综上所述,蛋白质通过与淀粉竞争吸水或抑制淀粉吸水,使得淀粉不能充分糊化,进而体现为高蛋白质含量的米饭黏度低、硬度大。通过调整大米各蛋白组分比例关系,或许能够实现淀粉糊化和米饭质构的调控优化,进而获得理想的食用品质。大米蛋白对米饭香气特征的影响米饭香气特征是决定消费者接收程度和食用愉悦性的关键因素,具有...
中国科学家建立了新的蛋白质从头设计方法
SCUBA采用一种新的统计学习策略,基于核密度估计(或近邻计数,NC)和神经网络拟合(NN)方法,从原始结构数据中得到神经网络形式的解析能量函数,能够高保真地反应实际蛋白质结构中不同结构变量间的高维相关关系,在不确定序列的前提下,连续、广泛地搜索主链结构空间,自动产生“高可设计性”主链。理论计算和实验证明,用SCUBA...