Nat. Methods. 速递:考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型
将上述两图结合,可得到一个层次异质性网络,节点为蛋白质、细胞类型、组织类型,边为不同类型节点之间的关系(如蛋白互作关系,细胞配受体关系,组织层次等)。2)预训练(图1c-d):采用对比学习的思路,对图进行自监督预训练,采用层次消息传递的方式对节点进行消息聚合,有边的节点之间增加特征表示相似性,无边的节点...
杭州博拓生物科技股份有限公司
3、异地股东可以信函或传真方式登记,信函或传真以抵达公司的时间为准,在来信或传真上须写明股东姓名、股东账户、联系地址、邮编、联系电话,并需附上述1、2款所列的证明材料复印件,出席会议时需携带原件,信函上请注明“股东大会”字样;公司不接受电话方式办理登记。(二)会议登记时间2024年9月13日(上午10:00...
...王文秀副教授等:南美白对虾热风干制过程蛋白质与品质变化关系...
蛋白质二级结构主要包含α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲,其中α-螺旋与1651~1660cm-1之间的峰有关,表征蛋白质分子的规整性。干制会使虾的蛋白质二级结构发生变化,因此酰胺I区的峰形会随之变化。如表3所示。新鲜对虾的α-螺旋相对含量为32.31%,干制至终点12h时,其相对含量为18.37%,下降了43.14...
Transformer大杀器进入蛋白质组学,一文梳理LLM如何助力生命科学...
基序和结构域的各种组合与重复构建了更加复杂的结构,从而决定蛋白质的生物功能,类似于人类语言中句子传达的含义。除了结构层次的相似性,蛋白质和人类语言还有另一个关键的相似点——「信息完整性」。这意味着从信息论的角度来看,蛋白质的信息(例如其结构)完全包含在其序列中。虽然由于环境和与其他分子的相互作用,...
追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
研究团队利用SickKids纳米生物医学成像设施的先进成像技术,捕捉了数十万张高分辨率图像,揭示了突触功能的新细节。他们使用了一种名为SidK的细菌效应蛋白,从大鼠脑中分离出突触小泡(SV),并通过单颗粒电子冷冻显微镜技术(Cryo-EM),获得了SV膜内囊泡型ATP酶(V-ATPase)的高分辨率结构图像。
昊帆生物2023年年度董事会经营评述
同时,公司基于客户需求与差异化的竞争策略,依托在多肽合成试剂行业的优势地位,开发了具有较强技术壁垒与良好市场前景的通用型分子砌块和蛋白质试剂产品,形成了以多肽合成试剂为主,通用型分子砌块和蛋白质试剂为辅的产品体系(www.e993.com)2024年9月7日。此外,公司紧跟全球药物研发方向,贴近国内外CRO、CDMO公司的市场需求,在合成技术门槛更高的脂质...
吴家睿:21世纪生物医学的三个主要发展趋势|2022科学发展报告
有研究者对影响mRNA表达水平与蛋白质表达水平的关系进行了系统的总结,认为二者间的数量关系是非线性的,受到细胞内外环境变化、细胞稳态和状态变化,以及mRNA胞内时空分布等各种因素的影响,“转录水平本身在许多情况下不足以用来预测蛋白质表达水平以及解释基因型与表型的关系。因此,在不同层次获取与基因表达水平相关...
追问daily | OpenAI首席科学家离职;没有内心声音的人言语记忆能力...
蛋白质相互作用是治疗ALS的潜在途径“迷你大脑”,促进阿尔茨海默氏症的治疗█AI行业动态谷歌反击:ProjectAstra对标GPT-4o、Veo对抗Sora,另有新版Gemini登场超级计算机Aurora突破百亿亿次运算障碍OpenAI首席科学家IlyaSutskever离职█AI研发动态BrainLM:利用生成式人工智能揭示大脑活动与疾病的关系...
Nature子刊:腾讯AI Lab提出蛋白质相互作用研究AI模型
此前,业内学者大多关注PPI的外部层次(交互作用组学)或内部层次(蛋白质组学),并未考虑PPI本身的层次结构。HIGH-PPI模型受到生物学家研究方法的启发,使用两个图神经网络(GNN),从两个视角分别进行学习。通过具体案例和统计实验,研究发现在端到端模型中,两个层次之间存在相互增益关系,缺失任一层次...
Meta 让 150 亿参数语言模型学会从头设计「全新」蛋白质,LeCun...
结果显示,二者并无匹配关系,自然序列和语言模型生成的预测结构不同。Sercu表示,可以单独使用ESM2蛋白质语言模型对蛋白质结构进行设计。研究团队通过实验测试了228种蛋白质,成功率为67%!Sercu认为,仅在序列上训练的蛋白质语言模型可以学习连接序列和结构的深层模式,并且可以用于从头设计蛋白质,超出了自然探索...