2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...
本研究发现,SGR干预4周可有效降低高血压大鼠的收缩压和舒张压,显著降低TC、TG和LDL-C水平,提高HDL-C水平。本研究使用蛋白质组学和生物信息学来筛选与特异性免疫细胞浸润相关的关键高血压靶点。结果表明,SGR干预高血压的92个靶点涉及5个信号通路。先前的一些研究报道了脂肪酸降解、β-丙氨酸代谢、代谢信号通路...
代谢组学、单细胞蛋白组学……ASMS2024上这些质谱新技术值得关注
ECD特别适合用于研究大分子蛋白质、易损修饰和异构体残基——仅使用传统的碰撞诱导解离(CID)方法难以明确表征这些分析物。结合6545XT本身就有的完整蛋白质分析能力,ExD池还适用于对较大的和高电荷的蛋白质(如抗体)以及小一些的亚基(如肽)执行“toptomiddledown”表征,由此生成的丰富谱图信息可使用ExDViewe...
蛋白组学如何筛选差异蛋白:关键步骤和技术选择
一、蛋白质样本准备蛋白质样本准备是差异蛋白组学研究的重要一环。关键的步骤包括样本收集、蛋白质提取和预处理。样本的选择要考虑研究目的和样本的来源,例如组织样本、血清或细胞培养上清液等。蛋白质提取方法的选择要考虑到样本的复杂性和蛋白质丰度范围。预处理步骤如去除低丰度蛋白、富集特定类型蛋白等,可以提高差异...
FSHW | 用无标记蛋白质组学方法研究驴和牛初乳乳清蛋白的差异表达
利用蛋白质组学方法对驴酪蛋白进行了研究,包括一维和二维电泳、考马斯亮蓝或特定多克隆抗体染色以及结构质谱分析,最终观察到κ酪蛋白的11个组分,β和αS1-酪蛋白的6个磷酸化组分,以及αS2-酪蛋白的3个主要磷酸化组分。使用基于无标签的比较蛋白质组学方法从德州驴乳中鉴定了216种乳清蛋白,其中19种在高产乳样品中...
如何利用血液蛋白质组学解析生物多样性的蛋白质表达?
2.通过比较同一物种在不同环境下的血液蛋白质组同一物种在不同环境下的血液蛋白质组也可能存在显著的差异。例如,人类在高海拔和低海拔环境下的血液蛋白质组可能存在显著的差异,这些差异可能与人体对环境适应的能力有关。四、结论:血液蛋白质组学的未来应用血液蛋白质组学的研究为我们理解生物多样性的蛋白质表达...
蛋白质组学药物发现成果|μMap光催化临近标记支持小分子结合位点...
表型筛选主要是在细胞或动物水平开展实验,因此蛋白靶点以及蛋白-配体结合模式一开始就是未知的,如何在确定活性分子后快速地找到其作用通路、靶点、结合位点、结合模式(正构/别构)一直以来都是众多研究员所关心的问题(www.e993.com)2024年7月10日。常规的蛋白质组学差异性分析能够帮助我们快速确认作用通路、发现潜在靶点,但却缺少更精细的结构信息。
宁夏大学刘敦华教授等:枸杞果实生长发育过程中寡糖代谢的蛋白组学
通过iTRAQ定量蛋白组学技术,从生物过程、分子功能和细胞组成3个方面分析在GO数据库中所筛选到的差异蛋白,进而做更准确的功能注释。如图2所示,通过GO功能注释,分别筛选出枸杞生长过程中5个时期与寡糖合成代谢相关的差异蛋白共461种。随着果实的不断发育成熟,与寡糖合成相关的蛋白质在数量和丰度均有显著变化,上调...
中国蛋白组学向何处去?
第一阶段:未知蛋白标志物筛选(biomarkerdiscovery)。这个阶段目的就是从样本中发展潜在的蛋白质标志物,常用的方法是不需要标记的非靶向质谱蛋白组学(DIA)。特点是要在尽可能多的样本中(1000个以上)尽可能地筛选更多的蛋白(比如5000种)。第二阶段:标志物验证(biomarkervalidation)。第一阶段可能从5000个蛋白...
中科院1区if8.8:综合代谢-蛋白质组学研究黄芩不同生长阶段的变化
表1通过对差异积累代谢物和丰度差异蛋白质的综合分析获得的关键途径打开网易新闻查看精彩图片通过对代谢组学和蛋白质组学分析,我们表征了关键代谢途径的差异调节,包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸、苯丙素、类黄酮、黄酮和黄酮醇、异黄酮和花青素生物合成。这些结果有助于阐明黄芩生长发育的复杂调控机制。
从静态到动态:4D蛋白质组学在生物药物研发中的应用
1.1蛋白质表达差异的鉴定:静态蛋白质组学通过比较不同条件下的蛋白质组成,可以帮助研究人员鉴定药物处理组和对照组之间蛋白质表达的差异。这有助于找到与药物疗效相关的潜在生物标志物,从而指导药物研发和治疗策略的优化。1.2药物靶点的发现和验证:静态蛋白质组学可用于筛选和验证药物的作用靶点,帮助确定药物与...