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运动伤脑?我国学者最新研究,长期中高强度运动,或导致认知能力下降
孟德尔随机化(MR),是一种基于遗传变异的统计方法,是流行病学研究中评估病因推断的数据分析技巧,它通过引入工具变量来分析暴露因素和结局之间的因果关系,可以避免混杂因素对结果的影响,得出可信的因果关系。目前,孟德尔随机化的发文势头比当年的生信分析、Meta,可谓有过之而无不及。Pubmed检索发现,2024年,孟德尔随机化...
Nature子刊丨高热量饮食对LPS诱导肺炎大鼠的肠道菌群的影响
HE染色制备肠组织和肺组织切片;用ELISA(酶联免疫吸附测定)技术检测血清胃动素和胃泌素;血清炎症因子按Aimplex法处理;采用Western技术,检测样品的蛋白质含量,并绘制Western条带。2、肠道菌群检测及生信研究:采集肠道样本进行菌群分析(包括多样性和特定菌群的相对丰度),对样品中的微生物DNA序列进行检测,根据数据库对OTU...
浙大铁科学开拓者团队联合温医大最新发现!靶向铁死亡治疗肝病
同时,该研究发现新型铁螯合剂FerroTerminator1(FOT1)在多种MASH模型中能够有效逆转肝脏损伤,且与临床批准的铁螯合剂相比,FOT1的毒副作用并不明显,并结合多组学分析揭示了FOT1同时抑制肝脏铁积累和c-Myc-Acsl4引发的铁死亡(ferroptosis)机制。此外,MAFLD队列研究表明,血清铁蛋白水平可能作为FOT1治疗M...
PRGdb:植物R基因数据库
尽管组学和生信领域取得了进展,但数据探索性分析仍然是一项繁琐的任务,使用生物信息学工具研究PRGs对科学界的很大一部分仍然具有挑战性。数据库PRGdb就是为填补这一空白开发的,可以为研究植物抗病过程中涉及PRGs的基因提供参考。PRGdb数据库PRGdb简要介绍新版本的植物抗性基因数据库(PRGdb;httpprgdb/prgdb4...
《自然·癌症》:介导肝癌中肿瘤-胚胎重编程的“命门”被找到了!
借助NicheNet、CellChat等生信分析方法,研究者们进一步清晰描述了POSTN+CAFs、TAMs和ECs的相互作用网络,以及它们在HCC中与部分旁观细胞共同构成的肿瘤-胚胎重编程生态系统,而且POSTN+CAFs很可能就是这个生态系统的“枢纽”(Hub);空间组学分析也证实,发生肿瘤-胚胎重编程的POSTN+CAFs、TAMs和ECs在HCC中会“扎堆”(www.e993.com)2024年11月26日。
2024 ASCO精彩回顾,基因检测引领精准医学新浪潮|免疫|实体瘤|特异...
TSOMRD基于因美纳强大的WGS文库构建、生信分析和测序技术。主要包括检测过程分为两个主要步骤——分子指纹分析和ctDNA检测。分子指纹分析(fingerprinting):通过WGS分析肿瘤组织和匹配的正常样本DNA,生成样本特异性的体细胞变异列表。这一步骤为后续的ctDNA检测提供了个性化的变异指纹。
文献数据挖掘就得用生信?别入坑
文献数据挖掘就得用生信?别入坑今天小编从热点研究、文献挖掘、文献计量学分析、全球科研基金分析角度给大家分享几个生物医学AI大数据工具,可以快速帮大家找到相关领域文献,挖掘相关疾病潜在靶点、定位某领域最佳研究选题、分析历年研究热点变化趋势等。一、——快速筛选某领域必读文(citexs/Paperpicky)...
Pubmed GIST文献月评第七十四期(Jan 2023)
结果:生信分析发现M2-TAM相关markers及CXCL2在GIST转移灶中均高表达,且CXCL2与TAM在肿瘤组织共定位。体外细胞功能实验发现,M2-TAM分泌的CXCL2可促进GIST细胞的侵袭、迁移及EMT,抗CXCL2抗体能阻断CXCL2引起的促转移效应。此外,沉默GIST细胞中的CXCR2也可抑制CXCL2引起的促转移效应。体内动物实验进一步证实CXCL2促进GIST...
学术先声丨自研平台!病理AI结合多组学分析识别结肠癌免疫微环境分...
通过文献调研,研究者收集和整理了61个TME相关signature,其中涵盖肿瘤细胞功能状态(ex:血管生成、缺氧、内皮-间充质转化等)、免疫细胞浸润以及肿瘤基质评估等生信算法,建立了全面的生物学框架来解析CRC患者肿瘤组织的TME特征。一致性聚类分析结果揭示了CRC的TME异质性,根据经验累积分布函数(CDF)和delta区域图,作者确定了最...