解读|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构,人们在AI模型的帮助下,洞悉蛋白质结构的上述密码后,产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的,包...
AI助力蛋白质研究:从结构预测到新应用,均获诺贝尔化学奖
蛋白质是生命活动主要承担者,其结构和功能研究是生命科学核心课题。传统蛋白质研究方法耗时费力,难以准确预测和设计复杂结构。随着AI技术发展,为解决这一难题提供新思路和方法。1.AI对蛋白质设计的贡献AI在蛋白质设计方面也发挥重要作用。传统设计方法依赖科学家经验和直觉,充满不确定性。AI可根据特定需求自动设计具有...
他们用AI破译蛋白质结构“密码”
精准预测蛋白质结构在蛋白质的世界里,氨基酸以长链的形式相连,折叠成复杂的三维结构,赋予蛋白质重要功能。自20世纪70年代以来,科学家一直致力于根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这是一项极其艰巨的任务。因为有些氨基酸和其他氨基酸相互作用,有些氨基酸则具有疏水性。而且氨基酸链形成了复杂的形状,使精准确定蛋白质结构...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
答案在于,蛋白质拥有丰富而复杂的空间结构,这些结构决定了蛋白质的功能。蛋白质以氨基酸为基本组成单位,氨基酸的不同排列(即序列)以及在此基础上的卷曲折叠,形成了特定的三维立体结构,进而执行不同的功能。人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上...
全球首创!分子之心许锦波团队开源新算法,攻克蛋白质侧链预测与...
蛋白质由数个氨基酸折叠而成,其结构分为主链和侧链(www.e993.com)2024年10月16日。蛋白质结构和功能的形成,很大程度上取决于侧链原子间的相互作用,因此,精准的蛋白质侧链预测(PSCP)是解决蛋白质结构预测和蛋白质设计难题的关键一环。应用到药物设计领域,科学家们便能更快、更准确地找到适合药物与受体的结合点位,甚至根据需要优化或设计结合点位;在...
2024年诺贝尔奖中的生命科学
蛋白质分子通过其结构表面上特定的部位与其他分子相互结合来发挥生物功能。通过计算方法预测出结合位点,并研究它们在物理、化学、生物和几何等方面的特征,找出具体的氨基酸残基和原子,分析它们对蛋白质-蛋白质分子间相互作用与识别的贡献,可以加深对蛋白质结构与功能关系的认识,有助于促进基于蛋白质结构的计算机辅助药物设...
诺奖解读 |马剑鹏:AI已绕不开,不能再不懂,宜从娃娃抓起
“在你身体的每个细胞内,数十亿个微型机器——蛋白质——正在努力工作。”有人甚至说,几乎生命的一切特征都跟蛋白质有关。的确,蛋白质是每个生物体中每个生物过程的基础,它是生命的基石。没有蛋白质,生命就无法存在。结构是如此重要,蛋白质复杂而多样的结构,对应了各种惊人的功能,从而促成了生命的丰富多彩。其...
有一种牛奶白无结构和田白玉-和田玉牛奶白是什么料
牛奶白无结构是指牛奶中所含有的蛋白质凝聚成粒状的情况。在正常情况下,牛奶中的蛋白质是以胶束的形式存在的,胶束是由脂质、乳糖和蛋白质相互作用形成的小颗粒。这些胶束可以保持牛奶的均匀性和乳白色,而不形成凝结。然而,当牛奶中的一些条件发生改变时,就会导致蛋白质凝结成团。一个典型的例子是,当牛奶暴露在高...
「AlphaFold 3」要来了?DeepMind推出新一代蛋白质结构预测工具,已...
第二大升级:预测相关配体的结构。所谓配体,是指其他不同分子与蛋白质结合,并导致蛋白质功能方式发生变化。配体在细胞信号传导中起着重要作用,细胞信号传导是细胞相互影响行为的关键生物过程。一种情况是,当配体附着或结合到蛋白质上时,组合结构称为“蛋白质-配体复合物”。研究人员历来使用一种称为“对接”的...