细胞电穿孔导入 DNA 的动态特征
整个转录与表达的动态过程是一个复杂而精细的调控网络,电穿孔技术可能会对这个网络产生影响,从而改变细胞的基因表达谱和功能。四、影响细胞电穿孔导入DNA动态特征的因素(一)电场参数电场强度电场强度是影响细胞电穿孔导入DNA效率的重要因素之一。较高的电场强度可以增加细胞膜的电穿孔程度,形成更多更大的...
浙江大学周丹团队:多模态框架改进了对替代组织的特异性基因表达的...
MTM是一个基于深度学习的统一多任务学习框架,支持从任何可用组织中,预测组织特异性基因表达。团队假设,一种整合了更全面的调控特征、先验生物学知识和替代组织中基因之间的连接信息的多模态方法,可以显著提高难以接近的组织(包括疾病相关组织)的预测性能。研究进展02MOTPEC缩小了外周血和中枢组织之间的差距通过使用M...
...关节炎滑膜组织基因表达调控图谱揭示关节炎风险位点的功能特征
成功鉴定了5381个独立顺式表达数量性状位点(cis-eQTL),通过分析滑膜组织基因表达的调控规律,揭示了滑膜基因表达调控具有的组织特异性,这是以往通过其它替代组织(血液,肌肉等)的eQTL数据无法反映的。该研究还通过整合关节炎GWAS与eQTL分析,鉴定出84个关节炎易感位点调控的靶基因,这些基因显著地富集在与免疫调控相关的功...
不止决定性别,XY染色体还广泛调控常染色体的基因表达
1、不活跃的X染色体和Y染色体能够调控体细胞中数千个常染色体的基因的表达;2、不活跃的X染色体和Y染色体通过共享机制调控常染色体的基因表达——由X染色体和Y染色体编码的同源转录因子ZFX和ZFY调控。论文链接:httpscell/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(23)00306-3原标题:《挑战对性染色体的...
Cell重磅发现:新型DNA调控元件——促进子,促进增强子对基因表达的...
我们的DNA中,表达蛋白质的编码基因只占2%,其余98%的DNA是非编码的,但它们中包含着调控元件,它们能够影响附近的基因表达,从而控制细胞的各个方面。增强子(Enhancer)就是DNA中的一种调控元件,它们位于基因之间,在不同的时间和水平上以不同的组合来开关基因。尽管在40多年前就发现了增强子,但其工作原理仍然没有完全...
...的普遍认知:不止决定性别,XY染色体还广泛调控常染色体的基因表达
该研究团队之前在不同性染色体构成的人的细胞中发现,38%的X连锁基因的表达随着额外的不活跃的X染色体拷贝而改变,而几乎所有的Y连锁基因的表达随着额外的Y染色体拷贝而增加,这些不活跃的X染色体和Y染色体驱动的变化具有显著的模块化特征(www.e993.com)2024年10月19日。通过纳入等位基因特异性分析,研究团队确定了X染色体上基因表达变化是由两方面的联合...
科普|中药可以调控人体基因吗?
因此,从现有的研究来看,中药不仅在加工炮制后仍含有丰富的miRNA,而且这些miRNA能够通过口服后被吸收入血,发挥基因调控作用。有研究表明甘草中的miRNA对人免疫细胞基因表达具有明显的调节作用;在新冠病毒流行期间,有研究团队发现金银花汤剂中的miR2911能够抑制病毒复制,加速感染患者转阴等。中药miRNA跨界发挥作用的主要原因...
Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的...
03通过基因组范围的CRISPR筛选,鉴定出通过该RNA结构开关调控基因表达的反式因子。04此外,研究发现无义介导的mRNA降解以构象特异性方式作用于该元素。05该研究扩展了我们对RNA开关在基因调控中的理解,为未来全面表征不同细胞类型和生物体中的RNA开关奠定了基础。
通过对拟南芥基因表达的研究,揭示其他各类生物体的生存进化规律
最新研究报告表明,在大肠杆菌和花生酵母中,基因表达“噪声”大小与“可塑性”呈正相关,也就是说,基因表达水平的变异是由突变或环境变化引起的。这种基因表达水平中的“噪声”与“可塑性”的相关性,体现了部分基因组的调节策略和功能特性。比如说,在大肠杆菌和酵母菌里,一些启动子结构、平均特异表达水平和功能...
《科学》:巨噬细胞的极限拉扯!科学家在巨噬细胞中找到一对调控巨...
更重要的是,在CShi肿瘤里,浸润有更多的B细胞、T细胞、树突状细胞,且多种类型免疫细胞中的抗肿瘤以及免疫调节相关的信号通路(如JAK-STAT等)表达上调。与之相对,CSlo肿瘤具有与肿瘤生长相关的基因表达特征,新血管生成、缺氧环境适应、代谢调控等相关通路上调。