上海交大周冰心博士:锚定稀缺生物数据挑战,图神经网络重塑蛋白质...
总结来说,每一个有结构的主体(比如一个蛋白质)都可以被表示成一个图,如下图所示:可以使用G表示图,v表示节点,ε表示边,Xv表示节点上的特征,邻接矩阵A表示节点连接情况,Xe表示边的特征。基于图的3个基本元素(节点、边、图),可以对图上的向量表征和预测任务进行分类,如下:*节点预测(node-le...
FSHW | 猴头菇中的生物活性化合物及其生物学特性
猴头菇可以减少Aβ-淀粉样蛋白前体蛋白的异常过表达,并作为β-分泌酶(也称为BACE1)的抑制剂,减少Aβ斑块的形成。此外,猴头菇及其活性成分可以通过提高胰岛素降解酶(IDE)的水平和活性来减少Aβ斑块的形成;IDE对Aβ具有直接降解作用,还可以通过抑制γ-分泌酶或降解Aβ-前体蛋白的细胞内结构来减少Aβ的产生。猴头菌...
人工智能的宏观影响:观点与启示
DaronAcemoglu则认为,这些未知的价值创造主要适用于科学研究,例如谷歌的DeepMind模型借助人工神经网络技术帮助生物学家破译蛋白质结构、帮助材料学家预测晶体结构。但是这些应用只是细分领域内的个别案例,10年内还看不到大规模应用人工智能促进基础科学研究的可能。因此,DaronAcemoglu没有考虑这些额外的价值创造。上述具体...
基于几何图学习的物理系统建模:从动态系统到复杂系统
在蛋白质建模任务中,有一种任务称之为定向进化。其本质是通过突变,探究蛋白亲和力的变化,如果亲和力增加,则保留这个突变,在该突变基础上继续突变,从而迭代改进蛋白质。已有工作采用序列输入的方式,用循环神经网络/大语言模型进行建模;此外还有通过卷积核卷积蛋白三维结构对特征进行汇总。存在两个挑战:1)未考虑不同层次...
Cell:不同界病毒的趋同免疫逃逸机制
盖结构域是一种结构特征,允许这些病毒酶捕获和降解宿主的免疫信号,否则由于其小尺寸和环状磷酸二酯骨架,这些免疫信号会抵抗降解。痘病毒cGAMP-PDE蛋白具有一个独特的盖结构域,该结构域起源于蛋白的N端,而噬菌体Acb1蛋白具有一种C端盖结构域。这种结构适应对于病毒克服宿主的免疫防御至关重要。
2024重组胶原蛋白行业白皮书:从美业革新先锋到精准医疗动力源
我国功能性护肤品的活性成分以透明质酸和植物活性成分为主流,胶原蛋白的渗透率尚处于较低水平(www.e993.com)2024年9月7日。其中重组胶原蛋白凭借其卓越的生物活性和生物相容性,以及更为灵活的加工性能在护肤品中崭露头角。鉴于护肤成分市场的周期性特征,透明质酸作为曾经的热门成分,现已步入成熟期,市场增长动力逐渐减弱。而重组胶原蛋白作为新兴...
健合集团BINC推动母婴健康发展,成立十年初心不改
健合集团“益生菌+”HMObiotics的创新研究和应用,其中的婴儿双歧杆菌R0033和两歧双歧杆菌R0071能够代谢实验中所有的HMO结构。此外,作为母乳中重要的免疫活性蛋白——乳铁蛋白,经临床验证有助于减少婴儿腹泻及呼吸道感染,促进免疫健康,益生菌+HMO+乳铁蛋白的创新组合经验证可协同发挥抗病原菌黏附的作用。
光谱背后的蛋白故事:圆二色谱揭示的结构特征与功能关联
3.数据解析:通过解析圆二色谱谱图,确定蛋白质的二级结构成分和其他结构特征。三、蛋白质结构与功能关联的揭示1.蛋白质的二级结构与功能:蛋白质的二级结构对于其功能和相互作用至关重要,圆二色谱提供了直接观察和定量分析蛋白质二级结构的能力。2.蛋白质折叠状态和稳定性:圆二色谱可以揭示蛋白质的折叠状态和稳定...
码隆科技CEO黄鼎隆作客委员讲堂:未来竞争是人机vs人机
事实上,黑洞在吸纳物质的同时,也会向外喷射物质,形成所谓的宇宙喷射。人类在地球上不同的地方建设了若干望远镜,形成一个超大望远镜,通过AI识别黑洞可能存在的特征,帮助人类找到黑洞所在的区域,并且通过AI将照片还原为更加完整的照片。此外,在生物学领域可以借助AI预测蛋白质的结构,在数学领域使用AI提出数学猜想,...
她,新晋「国家杰青」,专注生物材料研究!
结构蛋白是生物学中的重要组成部分。通常,它们会利用各种分子相互作用机制,将它们的分级组装成赋予受控功能特性的复杂形态结构。一个经典的例子是胶原蛋白,在这类蛋白中三螺旋分子被引导在长度尺度的层次上组织。在某些情况下,这些分层组件通过可逆的相互作用机制连接,以允许结构重新配置和自适应功能特性。如海参对胶原纤...