更有效地解析和设计蛋白质

可以说蛋白质预测和蛋白质设计的方向是相反的。蛋白质预测是从一个自然界中已知蛋白的氨基酸序列,来预测这个蛋白质折叠的三维结构;蛋白质设计则是先设计出一个三维结构,通常希望这个三维结构具有某种功能,然后再去找与它可能匹配的氨基酸序列,再通过实验把这种蛋白质结构合成出来。三联生活周刊:有没有某种蛋白质因为结...

解读|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?

除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构，人们在AI模型的帮助下，洞悉蛋白质结构的上述密码后，产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的，...

人工智能科学家又获奖:2024年诺贝尔化学奖授予三位预测蛋白质结构...

一半授予美国华盛顿大学的大卫·贝克(DavidBaker)，以表彰其在计算蛋白质设计方面的贡献，另一半则共同授予英国伦敦人工智能公司谷歌DeepMind公司的丹米斯·哈萨比斯（DemisHassabis）和约翰·乔普（JohnM.Jumper），以表彰其在蛋白质结构预测方面的贡献。

2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项

蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通...

2024年诺贝尔化学奖:蛋白质设计与结构预测革新生物学范式

而AlphaFold2能够直接从蛋白质的氨基酸序列中预测蛋白质的3D结构,并且达到原子级精度,被认为解决了困扰人类50年历史的蛋白质折叠挑战,迅速推进了人类对基本生物过程的理解,并促进药物设计。2018年,DeepMind官宣了旗下AlphaFold。初亮相时,它在第13届“蛋白质结构预测奥运会”CASP比赛中,成功预测了43种蛋白质中...

2024年诺贝尔化学奖:开辟了从未见过的全新蛋白质结构世界

刚刚,瑞典皇家科学院决定将2024年诺贝尔化学奖的一半授予大卫·贝克(DavidBaker),以表彰他在“计算蛋白质设计”方面的贡献,并将另一半授予戴密斯·哈萨比斯(DemisHassabis)和约翰·M·詹伯(JohnM.Jumper),以表彰他们在“蛋白质结构预测”方面的贡献(www.e993.com)2024年11月3日。

不懂AI、不会编码?如何轻松拿捏AlphaFold准确预测蛋白结构

AlphaFold2(AF2)和RoseTTAFold代表了这些突破性的模型。它们首次提供了计算方法,能够在提供足够的序列信息的情况下生成与实验解决的结构几乎无法区分的蛋白质结构预测。具体来说,AF2是一个端到端神经网络,由两个主要模块组成。第一个模块处理有关输入氨基酸(AA)序列(查询)的信息,并根据多序列比对(MSA)...

AI凭啥又得奖?就凭它半小时干完了几年的活

比如说,这些分析软件在医药领域就有很多应用。很多药物的作用靶点都是人体内的蛋白质,分析了这些蛋白质的空间结构,就可以高效地筛选能与它结合的分子,进而从中找出具有潜力的新药。而了解了空间结构特征,也可以设计出相应的新型蛋白质,让它们成为新的药物、疫苗或是载体。

通过探究豇豆轻斑驳病毒,研究其基因组结构及其编码,有何特征?

酵母双杂交系统由于具有快速、直接分析已知蛋白互作等特点而应用广泛。在酵母双杂交系统中其作用的信号是在融合基因表达之后,在细胞内重新构建的转录因子作用而产生的,这就不需要对蛋白质的纯化,大大地减轻了实验繁琐步骤。其检测是在活的细胞体内进行的,在很大的程度上可以真实的反应细胞体内情况,其检测的比较灵敏...

光谱背后的蛋白故事:圆二色谱揭示的结构特征与功能关联

3.数据解析:通过解析圆二色谱谱图,确定蛋白质的二级结构成分和其他结构特征。三、蛋白质结构与功能关联的揭示1.蛋白质的二级结构与功能:蛋白质的二级结构对于其功能和相互作用至关重要,圆二色谱提供了直接观察和定量分析蛋白质二级结构的能力。2.蛋白质折叠状态和稳定性:圆二色谱可以揭示蛋白质的折叠状态和稳定...