Nat Commun | 卡罗琳斯卡医学院团队发表人类植入前胚胎发育的非...

sncRNA通常短于200个核苷酸,主要类别包括miRNA、转移RNA(tRNA)、piwi相互作用RNA(piRNA)、小干扰RNA(siRNA)、核糖体RNA(rRNA)和小核仁RNA(snoRNA)。已知这些sncRNAs中的每一种都通过调节细胞周期、干细胞维持和分化在生殖和发育中发挥重要作用。此次获得诺贝尔奖的miRNA由于在物种和细胞环境中功能的相对保守性而被深入...

...张金伟团队揭示长非编码RNA MALAT1成熟和mascRNA生成的结构机制

tRNA和mascRNA的臂肘结构均由D-loop和T-loop结构互补镶嵌产生,是tRNA独有的表面结构特征11-14。体外和细胞内实验一致表明mascRNA的臂肘结构对RNaseP的招募至关重要,由于臂肘区域与RNAsePRNA通过直接的p-p堆叠以实现结构对接和RNA-RNA互作。相比RNAseP,ELAC2则表现出一种较宽松的RNA底物特异性。mascRNA...

Nature Genetics | 序列特征与药物疗效的巧妙结合:无义突变治疗的...

研究显示,当移除某一特定序列特征时,模型性能的下降程度可以反映出该特征对预测的影响。例如,移除+1核苷酸(紧邻PTC后的位置)会导致模型的r??下降最大,表明这一位点对药物诱导的贯通至关重要。药物特异性模型系数的相关性(图e):通过颜色编码展示了不同药物模型系数之间的相关性,发现某些药物(如Clitocine和DAP)的...

...大学任国栋课题组利用PBOX-sRNA-seq揭示植物小RNA末端修饰新特征

小RNA测序(sRNA-seq)是高通量表征和分析各类小RNA的重要手段。但常规sRNA-seq中大量的测序数据(很多时候超过40%)来自结构型RNA(包括rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA)以及其它RNA的降解片段,不仅降低了目标sRNA的比例,还影响了实验的批次间可重复性,有时甚至导致文库构建失败。因此,常规sRNA-seq对于样品和建库技术的要求通常...

研究揭示谷氨酸tRNA片段在大脑衰老和阿尔茨海默病中的关键作用

线粒体基本结构1线粒体外膜2膜间隙3嵴内间隙4嵴外间隙5内层6基质7线粒体嵴8线粒体内膜9内界膜10嵴膜11线粒体DNA12基质颗粒13核糖体14ATP合酶15孔蛋白中国科学技术大学(UniversityofScienceandTechnologyofChina,USTC)刘强教授团队的一项研究发现衰老大脑的谷氨酸能神经元细...

Blood | 施均/初雅婧/袁卫平发现线粒体tRNA假尿嘧啶化控制红细胞...

假尿嘧啶是tRNA、rRNA和mRNA中最丰富的RNA修饰(www.e993.com)2024年11月15日。它在RNA生物学中起着至关重要的作用,影响蛋白翻译、mRNA前体加工和各种细胞功能等过程。假尿嘧啶化是指由假尿嘧啶合成酶(PUSs)催化将尿嘧啶(U)转化为假尿嘧啶(Ψ)的过程。异常的假尿嘧啶化与几种人类疾病有关,例如,在干细胞承诺、白血病发生和胶质母细胞瘤中,PU...

Nature Genetics:序列特征与药物疗效的巧妙结合:无义突变治疗的未来

研究还发现,前导序列的碱基结构也对药物反应产生了不同的影响。例如,以A为末尾碱基的上游序列在多种药物下表现出较高的贯通率,尤其是在DAP、G418、SRI等药物处理下,平均贯通率比其他碱基类型提高了1.1-1.3倍。上下游序列与药物的交互作用研究表明,PTC周围的序列特征不仅影响药物效果,还可能与药物机制之间存在交互...

??乙肝相关慢加急性肝衰竭循环微生物组的特征分析

乙肝相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)是慢乙肝急性加重引起的危重症,其特征是多器官衰竭和短期高病死率。系统性炎症(SI)是推动ACLF发生和进展的关键因素。一方面,肝实质/非实质细胞的死亡和细胞外基质的崩解导致损伤相关模式分子(DAMPs)的释放,通过Toll样受体或其他受体激活先天免疫细胞。此外,移位的细菌或真菌及其释放的...

中山大学揭示苏氨酸代谢驱动肿瘤异常tRNA修饰和蛋白翻译

这种修饰定位于反密码子干环的第37位,只存在于解码ANN密码子的tRNA物种中。修饰的tRNA物种被锁定在一个三维结构中,该结构定义了密码子的翻译效率。t6A生物合成受损可引起常染色体隐性疾病,即以神经系统发育缺陷为特征的Galloway-Mowat综合征。尽管神经系统需要t6A,但t6A在脑癌中的作用仍不清楚。

事关大脑衰老 中国科大新研究取得重大进展

设计靶向该tRNA片段的反义寡核苷酸，并注射到衰老小鼠的大脑内，可以通过恢复谷氨酸能神经元中线粒体的蛋白翻译，内嵴结构，以及脑谷氨酸水平，显著减轻衰老小鼠学习记忆障碍。这些研究结果进一步支持谷氨酸tRNA片段是加速大脑衰老的重要风险因子，这也为减缓脑衰老相关的学习记忆功能障碍提供了新的治疗靶点。这项研究揭示了...