超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
该研究推出了AlphaFold3,这是一个强大的结构预测统一框架,涵盖了前所未有的广度和精确度,能够高准确性预测蛋白质与其他各种生物分子相互作用的结构。这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及...
为什么诺贝尔化学奖又被人工智能学者拿了:阿尔法折叠,蛋白质结构...
它能从蛋白质的一级结构,即氨基酸序列的组合,来预判1)蛋白质的二级结构,即蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构;2)三级结构,即在二级结构基础上多段进一步折叠盘绕后形成的特定空间结构;3)四级结构,即蛋白质-蛋白质复合形成的结构,是更为复杂的生物大分子。AlphaFold系列对蛋白质结构与功能的预测,有望对人类在...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
而这些长链在空间中是折叠成复杂的三维结构的,所以氨基酸的排列顺序其实就决定了蛋白质最终的三维结构,然而尽管科学家们知道蛋白质的氨基酸序列,但他们无法计算得知这些序列会如何折叠成特定的三维结构。由于蛋白质结构的复杂性,预测其折叠方式不仅需要巨大的计算能力,还需要对于这个物理化学过程有更为深刻的了解。尽管缺...
Nature Methods:基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动临床...
API功能:G2P3DAPI允许通过基因、转录本、蛋白质序列和结构的标识符,实现从基因变异到蛋白质结构的无缝映射,从而帮助研究者分析变异对蛋白质功能的影响。平台基于React.js前端和GoogleCloud后端架构,支持用户与广泛的数据资源交互。通过集成gnomAD(GenomeAggregationDatabase)、ClinVar和HGMD(HumanGeneMutationDat...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
从生命科学的角度来说,蛋白质是生命体内四种主要大分子之一(另外三种分别是核酸、多糖和脂质)。在生命体内,DNA作为生命信息的载体,负责遗传信息的存储。围绕它的研究、技术及应用,构成了20世纪人类生命科学领域最重大的进步之一。而关于它的故事,从20世纪50年代双螺旋结构的发现,到当下各种新兴医疗技术的诞生,人们已经...
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
蛋白-蛋白对接可视化软件pymol使用AMBER分子动力学模拟高斯加速分子动力学模拟模拟轨迹RG,RMSD,RMSF,二级结构变化,PCA分析MM-GB/PBSA方法计算结合自由能实践范例:蛋白和小分子配体的分子动力学模拟第二天机器学习与深度学习基本知识a)经典模型线性及非线性映射:线性回归、逻辑回归聚类:K-近邻聚类核方...
Nature Methods | 基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动...
变异类型分布:gnomAD数据库:大多数蛋白质编码变异是单核苷酸变异(SNV),占96.2%,其中错义突变(missense)占比最高,为62.9%。此外,无义突变(nonsense)、同义突变(synonymous)、移码突变(frameshift)和其他类型的变异占比较低。ClinVar数据库:主要变异类型也是SNV,错义突变占64.1%。无义突变、同义突变和移码突变的比例...
...中科院高福团队:m-AMSA抗非洲猪瘟病毒pP1192R双功能机制的结构...
pP1192R独特的抑制剂选择性和m-AMSA抑制pP1192R的双功能机制突出了病毒TopoII在毒物结合位点的特异性。本研究为开发靶向pp1192r的抗asfv策略提供了适用的信息。全长pP1192R在哺乳动物细胞中产生,随后纯化用于酶和结构分析。重组表达的pP1192R蛋白是均匀二聚体,分子量约为221kDa,通过凝胶过滤层析和分析性超离心...
2025天津医科大学全国硕士研究生入学统一考试《618生物化学与分子...
蛋白质分子的结构(一级、二级、高级结构的概念及形式)蛋白质一级结构的测定蛋白质的理化性质及蛋白质分离纯化蛋白质的含量测定和蛋白质纯度鉴定蛋白质的变性作用蛋白质结构与功能的关系考试要求了解氨基酸、肽的分类理解氨基酸的通式与结构理解蛋白质二级和三级结构的类型及特点,四级结构的概念及亚基...
2024重组胶原蛋白行业白皮书:从美业革新先锋到精准医疗动力源
我国功能性护肤品的活性成分以透明质酸和植物活性成分为主流,胶原蛋白的渗透率尚处于较低水平。其中重组胶原蛋白凭借其卓越的生物活性和生物相容性,以及更为灵活的加工性能在护肤品中崭露头角。鉴于护肤成分市场的周期性特征,透明质酸作为曾经的热门成分,现已步入成熟期,市场增长动力逐渐减弱。而重组胶原蛋白作为新兴...