Nature子刊:哈兽研、生物物理所合作揭示非洲猪瘟病毒转录天然复合...

结合ASFVRNA聚合酶和M1249L蛋白复合物的结构解析和动力学分析,研究团队提出了在病毒整个生命周期中控制病毒基因转录的动态催化调节机制模型。这些研究结果不仅揭示了天然状态下ASFVvRNAP的结构特征,还发现了M1249L蛋白在病毒组装与转录中的双重功能,为未来ASFV的控制和治疗提供了新思路。图2:非洲猪瘟病毒生命周期中...

AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过...

这个数据集由5,979种已充分研究过的病毒RdRP(阳性样本)和229,434个非病毒RdRP(阴性样本)组成,基于Transformer框架与大模型表征技术,结合蛋白质序列和内在结构性特征,在准确性、效率和检测到的病毒多样性方面均优于传统方法。更重要的是,LucaProt不仅整合了序列数据,还结合了结构信息,这对于准确...

AI 发现 16 万种新 RNA 病毒成果登上《Cell》后,我们和阿里云算法...

在AIforScience领域,阿里云与中山大学、浙江大学等国内知名高校共同开展病毒学、药物学、生物学等方向的科研课题,在生命科学领域已发表核酸和蛋白质统一基础模型-LucaOne、RNA病毒发现-LucaProt、磷循环蛋白家族识别-LucaPCycle等研究成果,其中多项成果由贺勇主导参与。为探寻这次科研成果背后的AI逻辑,雷...

科学智能又一重要成果:中澳科学家用AI发现超过16万种新病毒

RNA病毒都有一个称为“RdRp”的核心蛋白，即病毒RNA复制酶。上述研究根据一个全新的深度学习模型“LucaProt”，基于Transformer框架（构建GPT等主流AI大模型的基础框架），通过向其输入蛋白质序列预测。训练好的模型可以用来识别病毒RdRp，并用它在大量基因组数据中查找这些未知病毒的类似蛋白序列。值得一提的是，该AI...

中国科学家团队发现大量全新RNA病毒

LucaProt虽然是一个专门为RNA病毒发现设计的模型,但它同时融合了对蛋白质序列和隐含结构信息识别的功能,也可用于蛋白质功能的鉴定。在论文中,研究团队开源了LucaProt模型,并通过在线网站分享给全球科学家。“这个框架正在逐步成为该领域的前沿工具,也开始被应用到其他类型的蛋白质鉴定和功能发现任务上。”阿里云生物计算...

SARS-CoV-2的隐形杀手!Cell Stem Cell | 揭示新冠病毒感染如何...

转自:生物谷在一项新的研究中,来自威尔康奈尔医学院的研究人员利用一种先进的模型系统,揭示了SARS-CoV-2冠状病毒诱发糖尿病以及加重已患糖尿病者并发症的机制(www.e993.com)2024年11月27日。他们发现,这种病毒暴露会激活免疫细胞,进而破坏产生胰岛素的胰腺细胞——β细胞。相关研究结果于2024年9月3日在线发表在CellStemCell期刊上,论文标题为...

「动态」聚焦胃肠道病毒感染悉生猪模型的科研“头脑风暴”

袁丽娟教授以胃肠道感染中宿主-病毒的相互作用为研究方向，主要进行胃肠道病毒感染特征、免疫机制以及病毒性腹泻干预策略研究，并基于其所建立的悉生猪模型对益生菌/益生元和肠道微生物群的病毒感染预防、治疗及疫苗进行深入研究。她是全球为数不多的开发和利用悉生猪模型研究人类胃肠道病毒感染及其疫苗诱导免疫反应的专家...

...| 剧烈运动可短期内提高执行功能;利用AI发现16万种新RNA病毒...

DuoAttention:提升大语言模型推理速度与效率的新突破指令微调的两面性:新研究揭示上下文依赖性的逆转现象KnoBo模型助力医学图像分析,准确率大幅提升上下文依赖行为如何导致大脑局部模块化的自然出现AI深度学习模型发现16万种新RNA病毒脑科学动态快速眼动睡眠的神经回路揭示帕金森病睡眠障碍原因...

mBio|清华大学基础医学院丁强团队建立虫媒黄病毒Powassan病毒细胞...

病毒复制子(replicon)是自主复制的病毒RNA,一般是在基因组中将负责病毒颗粒组装的结构蛋白基因删除,只包含执行病毒基因组复制功能的非结构蛋白基因。结构蛋白基因的缺失使其不会产生感染性病毒颗粒,可在BSL-2环境下操作[5]。为了构建POWV复制子细胞模型,丁强课题组宋晶伟博士构建一个包含分泌型荧光素酶(Gluc)报告基因...

用于腺相关病毒基因治疗的人源化小鼠模型

总之,该研究引入了一种多功能小鼠模型,可以在体内选择性地研究AAV的趋向性和生物学特性。结果证明,AAV载体在人肝嵌合TIRFA小鼠中静脉注射时,可以更容易地转导人肝细胞而不是鼠肝细胞,并且可用于评估其他人类细胞和靶组织。TIRFA小鼠克服了当前实验动物模型所带来的重大限制,并且应该能够预测肝脏定向AAV基因疗法...