我国科学家提出一种新的DNA信息存储编解码方案
中国青年报客户端讯(中青报·中青网记者胡春艳通讯员赵晖)近日,天津大学合成生物学研究团队与天津市环湖医院合作提出了一种创新的DNA信息存储编解码方案——“DNAPalette”。通过体外存储实验,该方案成功将患者疾病全周期的脑部核磁共振影像数据编码至DNA,并无损解码,实现影像数据的三维重建和病理诊断,为医...
实验心得之Lipo系列质粒DNA转染试剂
三、操作简便简便的实验过程无疑是很多研究者所喜闻乐见的,一款操作简单并且使用方便的转染试剂可节省很多实验中琐碎的步骤以及成本。在检索一些脂质体类成分的质粒转染试剂时,不难发现,有很多研究者提到自己的转染经验,都建议在转染开始前换成无血清培养基,再在转染后4-6小时更换为含血清的培养基,一是因为血清...
性价比超高的质粒DNA转染试剂
首先要考量其转染性能,这是最重要的一方面;其次还要考虑到实验的操作简便性,最好无换液之苦并且不需要购买额外的培养基;最后,对于实验者来说,性价比也是十分重要的衡量标准。能满足以上条件的质粒DNA转染试剂,同时,无论是对于经验不足的“小白”还是转染实验的“高手”;无论是易转的细胞系还是难转的细胞系,都有...
Nature Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互...
DeepPBS框架捕捉到了蛋白质家族特定的结合模式,通过分析p53-DNA接口中的残基重要性,研究人员验证了DeepPBS的预测结果与实验数据的一致性。模拟预测的蛋白质-DNA复合体的应用DeepPBS还应用于合成设计的蛋白质-DNA复合体,预测了特定DNA序列的结合特异性,并与实验结果进行比较,验证了DeepPBS的预测...
长沙市实验中学学生的这堂实验课,是在大学完成的!
自己动手得到完美实验结果在金新洲、刘江涛两位老师的悉心指导下,同学们分成两组开始进行实验,大家小心翼翼地操作,试剂的配制、样本的加入、仪器的设置……每一个步骤都全神贯注。配置好的液体被送入PCR仪器内,开始了奇妙的“变身”:高温下,DNA片段解开双螺旋结构;低温时,引物与它们紧密结合;中温环境中,...
上海交大团队设计智能DNA纳米反应器,实现更精准的肿瘤治疗
在实验验证这一阶段,课题组先是合成了核酸生物材料,然后开展了成像效果和治疗效果的模拟实验(www.e993.com)2024年11月8日。在设计方案得到初步验证之后,他们针对所打造的体系进行多次优化和改进。后来,课题组又多次调整设计方案,通过尝试不同的DNA结构、材料组合和操作条件,提高了iDNR的性能和选择性。在体外实验验证成功之后,他们又开始...
2024合成生物学竞赛常规赛队伍专题之ZJU-China团队
LoxP是一种34碱基对的DNA序列,包括两端两个13碱基对的反向重复序列和中间8碱基对的非对称核心序列。这种序列安排使得Cre酶能精确地识别并结合到这些位点上。在Cre-LoxP系统的操作中,Cre酶可以介导两个或多个LoxP位点之间的重组,具体的重组结果取决于LoxP位点的相对位置和方向。例如,如果两个LoxP位点在同一方向上,Cre...
“自然”和“人工”的边界:关于人工智能与合成生物学的讨论
合成生物学并不局限于对DNA或RNA的操作,或者从头开始构建DNA并植入自然环境中,比如上面提到的Synthia的例子中所示。合成生物学也涉及从零开始构建活体系统。对这个主题的研究一直专注于完全自下而上的方法,但仍未显示出可实现或显著的结果。例如,合成生物学离拥有足够相似于活体细胞的合成细胞仍然很远,这些细胞并不能自...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
在单端测序中,每个cDNA片段的一个末端(3′或5′)用于产生测序reads,而双端测序中每个片段产生两个测序reads(一个3′和一个5′)。在需要测序尽可能多核苷酸的实验中,首选long-readpaired-end测序。在DGE分析中,用户只需要计算比对到转录本的reads数即可,故不需要对转录本片段的每个碱基都进行测序。例如,将“短...
分子生物学实验室设计方案
核酸提取仪:用于提取核酸,实验室设计时应考虑操作台的防振措施。合成仪:用于cDNA的合成,实验室装修时应确保其操作便捷。6.3扩增反应混合物配制和扩增区功能:进行DNA或cDNA扩增。压力要求:相对于邻近区为负压,以防止气溶胶扩散。设备配置:PCR仪:用于扩增DNA或cDNA,实验室建设时应考虑其供电稳定性。