如何应对缺失值带来的分布变化?探索填充缺失值的最佳插补算法
impnormpredict[is.na(X[,1]),1]<-predict(lmodelX1X2,newdata=as.data.frame(X[is.na(X[,1]),]))##(2)GaussianImputation:Thiswouldcorrespondto"norm.nob"inthemiceRpackage###1.EstimateRegression#lmodelX1X2<-lm(X1~X2,X=as.data.frame(X[!is.na(X...
Project Matrix:京东Spark ML线性模型的重构与优化实践
4.ProjectMatrix项目由来自2015年以来,Spark-ML就没有很大的改动,我们在具体使用中也真真切切地遇到了一些问题。随着使用地愈加深入,对于它的改造工作也愈加迫切。秉持“人人为我,我为人人”的开源理想,我们决定成立一个新的项目——ProjectMatrix,专门针对Spark-ML的线性模型训练进行重构与优化。很高兴我们的工...
R语言航班延误影响预测分析:lasso、决策树、朴素贝叶斯、QDA、LDA...
Lasso算法在数据挖掘、生物信息学、金融、图像处理等领域都有广泛的应用。xmat<-model.matrix(ARR\_DELAY\~.-DEP\_DELAY-DEP\_DEL15-ARR\_DEL15,dat建立lasso模型cv.lasso<-cv.glmn点击标题查阅往期内容01020304coef(cv.lasso根据lasso筛选出最优的变量Lasso(LeastAbsoluteShrink...
R语言中的生存分析Survival analysis晚期肺癌患者4例
如果存在字符变量,则必须使用model.matrix格式化来自crr的结果或当前crr不支持的输出。黑色素瘤数据中的竞争风险回归-因果分析审查所有没有引起关注的对象,在这种情况下是由于黑色素瘤死亡,并且照常使用coxph。因此,现在对因其他原因死亡的患者进行针对特定原因的风险评估方法以应对竞争风险。第4部分:高级...
数据代码分享|R语言lasso回归、贝叶斯分析员工满意度调查数据...
变量筛选xmat<-model.matrix(E2~Organisation+Year+Population+Sector+V1+V10+建立lasso模型cv.aso<-cvglnet(xmat,(at2.tain$E21:nrw(xmat)])nfolds=1绘制误差plot(cv.lasso)点击标题查阅往期内容01020304coef(cv.lasso,s="lambda.1se")...
Int J Surg:武汉协和医院麻醉姚尚龙教授与心外董念国教授团队合作...
(麻醉复苏教育部重点实验室)与华中科技大学同济医学院附属协和医院心脏外科合作,在体外循环术后肺损伤(CPB-ARDS)蛋白标志物精准预测领域的最新研究成果,题为“Earlyplasmaproteomicbiomarkersandpredictionmodelofacuterespiratorydistresssyndromeaftercardiopulmonarybypass:aprospectivenestedcohortstudy...
R包神器 | 系统发育和进化分析 - ape (一)
APE(AnalysisofPhylogeneticsandEvolution)是1个用R语言编写的用于分子进化和系统发育分析的免费软件包,提供了读写数据和操作系统发育树的实用函数,以及几种用于系统发育和进化分析的高级方法(e.g.比较和群体遗传方法)。APE利用了许多用于统计和图形的R函数,并为开发、实现进一步的进化过程分析的统计方法,...
生信入门 | 初探WGCNA分析|表型|聚类|样本|拓扑_网易订阅
这个R包是用于计算各种加权关联分析的功能集合,可用于网络构建、基因筛选、基因簇鉴定、拓扑特征计算、数据模拟和可视化等。实战演示#导入数据library(WGCNA)options(stringsAsFactors=FALSE)#指允许R语言程序最大线程运行allowWGCNAThreads()#设置工作目录路径,R脚本语言和文件夹在同一个目录下setwd("...")...
机器学习之确定最佳聚类数目的10种方法
m_clust<-Mclust(as.matrix(dataset),G=1:20)#聚类数目从1一直试到20summary(m_clust)GaussianfinitemixturemodelfittedbyEMalgorithmMclustEVE(ellipsoidal,equalvolumeandorientation)modelwith3components:log.likelihoodndfBICICL...