STM丨汪秀星/张弩合作揭示非经典开放阅读框编码肽段MPEP促GBM恶性...
短开放阅读框(ORF)是真核DNA的共同特征。最新研究进展提示人类基因组中短ORF具有翻译潜力。许多可翻译的短ORF已被鉴定在具有已知编码DNA序列(CDS)的mRNA转录本的5'非翻译区(5'-UTR)或3'非翻译区(3'-UTR)内,甚至在以前被认为是非编码的RNA转录本中。mRNA翻译稳态的精细调控对于维持正常组织和预防肿...
铁死亡新调节因子!南京医科大学发文:胃癌治疗的强大策略
有趣的是,越来越多的研究表明,长非编码RNA(lncRNAs)和环状RNA(circRNAs)的上下文中包含许多未注释的非经典开放阅读框(ORFs),其中任何一个都可能编码新的功能蛋白质或肽。研究人员通过综合分析Riboseq数据和质谱数据,对lncRNAs和蛋白质编码基因上游或下游区域的553个非经典ORF进行了实验研究。在之前的研究中,研究人员通...
Cell:从人体微生物组中挖掘全新抗菌肽,有望解决抗生素耐药性难题
该研究通过计算筛选,从人体微生物组(包括皮肤微生物、口腔微生物、肠道微生物)中挖掘候选抗菌肽,共鉴定出323个由小开放阅读框编码的潜在抗菌肽,其中合成的78个候选抗菌肽中有55个(70.5%)在体外具有抗菌活性,来自肠道细菌普雷沃氏菌Prevotellacopri编码的prevotellin-2具有与常用抗生素多粘菌素B相当的抗菌活性。尽...
【云飞杂记】真菌传之基因组
基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。通过对酿酒酵母的完整基因组测序,发现在12068kb的全基因组序列中有5885个编码专一性蛋白质的开放阅读框。这意味着在酵母基因组中平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因,即整个基因组有72%的核苷酸顺序由开放阅读框组成。这说明...
Journal of Virology|PKM2 通过 AMPK-mTOR 通路诱导线粒体自噬...
CSFV是一种包膜RNA病毒,单链RNA基因组约为12.3kb。一个大的开放阅读框编码一种独特的多蛋白,该多蛋白经过翻译和加工以产生四种结构蛋白(C、Erns、E1和E2)和八种非结构蛋白(Npro、p7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B)。其中,NS2、NS3和NS5A是病毒复制所必需的。
外星生物学?细菌RNA编码新的基因,突破中心法则认知|翻译|rna|dna|...
重复序列上编码蛋白合成的片段称为开放阅读框(OpenReadingFrames,ORF)(www.e993.com)2024年12月20日。这段ORF非常特殊,因为它仅有起始密码子,缺少终止密码子。理论上,这个序列可以编码一个无限长的蛋白质。因此,研究团队将该序列命名为“neo”,意为“永无止境的开放阅读框”(never-endingopenreadingframe)。
全球与中国全长ORF(开放阅读框)克隆市场发展前景与投报告2022
本文重点分析在全球及中国有重要角色的企业,分析这些企业全长ORF(开放阅读框)克隆产品的市场规模、市场份额、市场定位、产品类型以及发展规划等。主要企业包括:ThermoFisherScientificGeneCopoeiaDharmaconBioCatGmbHSourceBioScienceKabushikiKaisha(KK)...
Nat Biotechnol:提供对翻译开放阅读框的标准化注释
在过去的几年里,人类基因组中发现了数千个非常小的开放阅读框(openreadingframe,ORF)。这些DNA序列可能包含构建蛋白的指令。这项新研究的几位作者之前已经发现了ORF,并在科学杂志上对它们进行了描述:vanHeesch与MDC教授NorbertHübner和UweOhler一起描述了人类心脏中的新的微型蛋白(mini-protein),并在2019年...
非典型开放阅读框编码癌细胞存活所必需的功能蛋白
美国哈佛和麻省理工学院ToddR.Golub研究团队的最新研究揭示了非典型开放阅读框(ORF)编码癌细胞存活所必需的功能蛋白。这一研究成果于2021年1月29日发表在国际学术期刊《自然-生物技术》上。研究人员运用实验方法检测了从非典型ORF数据集中选择的553个候选阅读框。其中,去除57种ORF会导致人类癌细胞系生存能力缺陷。
Nature:董欣年/项耶子揭示动态调控翻译起始的新元件
真核生物的mRNA通常由5'端前导序列(5'LS或5'UTR),开放阅读框(ORF),和3'端下游非编码区(3'UTR)组成。翻译起始时,携带核糖体小亚基的翻译起始复合物从mRNA的5'帽子结构开始,阅读5'端前导序列,当识别到开放阅读框的起始密码子后,招募核糖体大亚基,起始功能蛋白质的编码1。有趣的是,大约64%的人类...