从头设计「超难」癌症抗体,大卫贝克团队AI生物计算方法的新应用
该团队探索了两种不同的蛋白质设计方法来设计Ras异构体特异性结合物(RIB)。第一种方法是将无序区域(IDR)的序列穿过来自logos(logos库A)的~800个蛋白质支架,这些支架具有特定的氨基酸识别口袋,这些口袋排列成结合一系列扩展构象中的不同序列。第二种方法是通过支架RFDiffusion从包含来自logos...
非洲猪瘟病毒DNA拓扑异构酶催化机制研究获新进展
研究人员利用多种实验手段,包括单颗粒冷冻电镜、X射线晶体学、生化实验等方式,首次解析了由非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶pP1192R结合核酸的多构象动态复合物结构,并验证了其体外酶活,结合原子力显微镜成像和分子对接,揭示了该蛋白结合DNAcrossover的倾向性以及潜在结合的小分子药物抑制剂。该研究提供了潜在...
利用电子顺磁共振技术测量分子构象方面取得新进展
利用电子顺磁共振技术测量分子构象方面取得新进展导读:国家纳米中心孙向南课题组利用电子顺磁共振技术,在同分结构异构体的分子构象与材料自旋寿命的构效关系研究方面取得新进展。分子半导体材料具有超长的室温自旋寿命,在实现室温高效自旋输运和调控方面具有极大潜力,其结构多样性、可设计性以及丰富的光电特性也为分子自旋电...
MS计算-Nature Materials:柔性多孔晶体的阻转异构行为
构象异构是一种立体异构,其中构象可以通过单键旋转来相互转换。作为一种特殊一种构象异构,阻转异构被定义为具有抑制的单键旋转,导致不可相互转换阻转异构体。研究人员在1922年通过实验发现分子中发现阻转异构体携带庞大的取代基。以前,分子阻转异构体在生物系统和药物发现中发挥了关键作用。然而,在具有无限框架的晶体...
她,国内首位 “世界最具潜力女科学家”,最新成果登上Nature...
该图包括所使用的肽序列(Pl-Leu、Pd-Leu、Pl-Ile和Pd-Ile)及其在通过纳米孔易位过程中相应的电流迹线的图示。给出了这些肽的当前阻断幅度(ΔIb/I3)和标准差(sd)的散点图和直方图,证明了立体异构体之间的明显区别。该图还显示了用于对立体异构体进行分类的机器学习算法(结合线性判别分析(LDA)...
学术大爆发!中国/华人学者一天发表35篇Nature Communications|...
7中国科学技术大学周文超、卞修武及安徽医科大学张爱丽共同通讯在NatureCommunications在线发表题为“StabilizationofPin1byUSP34promotesUbc9isomerizationandproteinsumoylationingliomastemcells”的研究论文,该研究发现USP34稳定Pin1促进胶质瘤干细胞中Ubc9异构化和蛋白sumoylation(www.e993.com)2024年9月8日。
CDE文章 | 基于疗效指标的药物临床试验现场核查关注点分析
多肽药物的工艺杂质一般包括氨基酸缺失肽、取代或插入肽、截断肽、异构体等;降解杂质一般包括乙酰化杂质、脱酰胺杂质、二硫键错配杂质、氧化杂质、消旋体、β??消除杂质、低聚物等,应基于对产品结构的理解、原辅料相容性研究、工艺研究和降解途径研究结果等对杂质谱进行全面的评估和研究。
...大学张晓宏教授团队&香港城市大学李振声教授团队:基于构象异构...
近日,苏州大学张晓宏教授、王凯副教授、香港城市大学李振声教授和苏州科技大学史益忠副教授合作,提出了一种基于构象异构实现单分子发光材料双热活化延迟荧光(TADF)性质的新型分子策略,并探究了具有双TADF性质的单分子发光材料在“自掺杂”有机发光二极管(OLED)和生物成像中的应用。结果表明,具有双TADF特性的单分子发光材料...
3'UTR是做什么的?|mRNA|UTR|异构体|蛋白质|元件|序列|基因|-健康界
由于3‘UTR缺失也会影响位于基因3’端的DNA调控元件,在实验中包括包含编码区和短或长3‘UTR异构体的带标签的cDNA构建物是有用的。这些结构的表达将使观察到的表型得以挽救,并确保表型确实是由3‘UTR引起的,而不是由DNA调控元件的缺失引起的。为了研究具有单一3‘UTR异构体的基因的3’UTR的调节作用,可以将...
医药行业小核酸药物专题报告:历经低谷,迎来快速发展
通过自身的三级结构与标靶如蛋白质、细胞、病毒等实现特异性结合,可以区分构象异构体、氨基酸突变等结构非常相似的分子。核酸适配体药物通过三种路径发挥作用:1)作为抑制剂抑制疾病相关靶标;2)作为激动剂激活目标受体;3)作为靶向分子载体递送其它药物。核酸适配体药物的合成筛选主要使用SELEX(systematicevolutionof...