QB | 人类健康表型相关的微生物组分类单元与宿主表示学习研究

在以往的研究中,OTU丰度向量往往直接被用于代表微生物群落进行下一步的机器学习建模,其中每一个OTU都被当做完全等价的特征,忽略了其本身的生物学内涵。一些研究基于OTU丰度谱构建共出现网络,试图理解OTU背后的生物功能,但由于OTU丰度谱的稀疏性和共出现关系的相关性门槛,导致实际能利用共出现网络进行研究的OTU比例往往...

专家论坛|王伽伯/肖小河:中草药相关肝损伤的表型特征及毒理机制

固有型肝毒性主要指“大毒”和“有毒”中草药的肝毒性,中药固有型肝毒性的代表药物有:含皂苷类毒性成分的商陆、黄药子等;含生物碱类如吡咯里西啶生物碱的千里光、菊三七等;含萜类化合物的雷公藤、川楝子等;含有糖苷类的牛蒡子、苦参;苍耳子中的植物毒性蛋白、蓖麻精中的蓖麻毒素和相思子中的相思豆毒蛋白等均可...

Trends Genet | 表型进化的分子基础:超越常见的疑点

(iv)表型可塑性:发育可塑性被认为是表型新颖性和多样性的主要途径之一。相同的基因型可以通过多种机制产生不同的表型,以响应环境提示,包括温度依赖性选择性剪接、光和激素诱导的蛋白质亚细胞重新分布以及细胞谱系特异性DNA甲基化。然而,个体水平上的这些可塑性反应如何与种群或物种之间的表型变异同化仍然知之甚少。相信...

【Cell】华大徐讯团队:时空组学在生物学和医学的应用

其中包括:(1)多组学信息—全面理解遗传变异的影响,有效整合遗传疾病中各种组学数据,如基因组变异、表观遗传信号、具有空间多组学特征的翻译后修饰等,仍然是一个挑战;(2)监测时间信息—疾病的发生和发展是一个动态和演变的过程,因此,疾病发生、进展和治疗过程中的时间信息,对于全面理解疾病和制定相应的治疗策略,...

组织生物学:寻找新范式

在复杂的后生动物中,包括脊椎动物,上皮-间充质单元作为主要的支持关系被扩大。其中间充质细胞进一步分化为中胚层细胞类型,具有更特殊的支持功能,这几乎是脊椎动物组织的普遍特征,它们构成了一个最小的组织单元:基质细胞,毛细血管内皮细胞和组织驻留的巨噬细胞(图5a)。基质细胞主要由成纤维细胞组成,负责结构支撑。组织...

从菌株之间的相互作用,解析控制着微生物群落的生态进化动态

基因组数据表明，同一物种的基因型变异，即菌株，共存，并且在天然微生物群落中丰富，然而，目前尚不清楚菌株在生态上是否等效，以及它们在什么特征遗传距离上可能表现出不同的相互作用和动态(www.e993.com)2024年11月3日。我们通过在实验室中跟踪猪笼草Sarraceniapurpurea的10个分类学多样化的微生物群落来解决这个问题，超过300代，使用宏基因组测序，...

吴家睿:21世纪生物医学的三个主要发展趋势|2022科学发展报告

这些活动的开展需要整合不同的学科，包括数学、计算机科学、数据分析、生物学，以及临床医学、伦理和社会实践”。▋一、生命复杂系统的构成：从分子到细胞再到组织器官的相互作用网络系统生物学最重要的特性之一就是关注生物体内各种元件之间的相互作用。最初的系统生物学研究主要是针对分子层面的相互作用网络，如基因转录...

万字综述:如何重新定义精神病学?

在本节中,我们关注精神障碍的本质,为后续的关键概念辩论提供基础。精神障碍的本质又引发了一系列附属问题,我们将逐一讨论:有什么理由证明某种特定的生物或行为状态构成了障碍?精神病学分类反映了精神病理学的自然特征,还是反映了我们的临床和社会兴趣?精神障碍是不是应该被看作是跨个体的普遍实体,还是应该视为每个人独...

药康生物2023年年度董事会经营评述

1.行业的发展阶段、基本特点、主要技术门槛公司主要从事实验动物小鼠模型的研发、生产、销售及相关技术服务,满足生命科学基础研究和生物医药开发过程中的小鼠模型相关产品及服务需求,根据《上市公司行业分类指引》(2012年修订),公司所处行业为“研究和试验发展(M73)”,根据《战略性新兴产业分类(2018)》,公司所处行业属...

江苏集萃药康生物科技股份有限公司2023年年度报告摘要

1.行业的发展阶段、基本特点、主要技术门槛公司主要从事实验动物小鼠模型的研发、生产、销售及相关技术服务,满足生命科学基础研究和生物医药开发过程中的小鼠模型相关产品及服务需求,根据《上市公司行业分类指引》(2012年修订),公司所处行业为“研究和试验发展(M73)”,根据《战略性新兴产业分类(2018)》,公司所处行业...