【陈巍学基因】视频130:发现和确认 TLR9 通路在记忆形成过程中的...
1、注射GFP基因的病毒作为对照的组,和注射有Cre重组酶的病毒,对Tlr9基因进行敲除的组;2、CFC后96小时处死的小鼠,和不经CFC直接处死的小鼠。把上面两种处理排列组合,得到4组处理方式的小鼠。作者从这4组小鼠身上收集了海马体的细胞核,做成单细胞核测序文库,进行高通量测序。其中第4...
从头设计蛋白的“上帝之手 ”David Baker,极大地推动了蛋白质结构...
蛋白质仅靠20种氨基酸的排列组合,就形成了生物学上不可思议的多样性和高效性,支撑起了整个生物界。既然算法可以从蛋白的序列预测出结构了,那反过来是不是可以通过功能来设计对应的结构,再用逆向算法把结构推导回序列呢?这种方式被科学家称为蛋白质的“从头设计”(Denovodesign),也就是在没有模板参照的情况下设...
华大集团尹烨:AI会变成人类医生的好帮手
DNA才是真正的自然语义处理,特别适合用类似的算法来算。它包括A、T、C、G四种碱基,算上RNA再加个U,也就5个;但它们的排列组合却形成了30亿个碱基对。比如,我们俩之间只有千分之五的差别,但很明显我们很多的性状并不一样。识别基因语言里面的名词、形容词、动词、助词,甚至省略号以及中间大段的留白,就是我们学...
人工智能写作的最终效果取决于人
人工智能的算法规则和数智修辞使其擅长纯粹的形式,拟人化的语义和对文字的排列组合规则,决定它还将作为人类思维的高级模仿者,依然在人类的写作范式之内提供知识或浅显的快感,充其量是人类文学写作的一种平行样式和补充,不会改变人类文学写作的本质,也无法产生颠覆、取代的效果。人工智能缺乏通用性、灵活性、可解释性和...
十年,绘一张中华鲟“生命地图”_澎湃号·政务_澎湃新闻-The Paper
一对DNA碱基,长度约为0.34纳米,大概是发丝直径的十万分之一,却以精确的排列组合,记录下亿万年来,中华鲟对一系列重大地球气候变迁的回应。100个碱基,累积成一条DNA基础片段,而成千上万个片段累积成一条染色体。用10年“解码”亿万年的沧海桑田,他们将中华鲟的坚韧脾性如“基因”融入研究中,组装完成首个拥有20亿...
历经十年,他们为中华鲟绘就“生命地图”!
一对DNA碱基,长度约为0.34纳米,大概是发丝直径的十万分之一,却以精确的排列组合,记录下亿万年来,中华鲟对一系列重大地球气候变迁的回应(www.e993.com)2024年10月17日。100个碱基,累积成一条DNA基础片段,而成千上万个片段累积成一条染色体。用10年“解码”亿万年的沧海桑田,他们将中华鲟的坚韧脾性如“基因”融入研究中,组装完成首个拥有20亿...
数坤科技亮相RSNA2023,向世界传递中国AI之声
人类的体内有10万种以上的蛋白质,它们都是由20种氨基酸排列组合产生的。数十到数百的氨基酸集合成为拥有各种立体结构的蛋白质,这些蛋白质在它们的“坑洼”处和特定的物质相结合,而发挥其各种各样固有的机能。这也就是说,只要拿到了每一种蛋白质的结构,就能得知它的功能。
姻缘算法:聪明人的21条爱情公式
寥寥数语,绘出一个结构完美、逻辑缜密、精确量化的模型,并且重温了排列组合,为计算爱情概率奠定了基础。根据上面的“大数定律”,我们需要足够的样本量;根据上面的“费米估算法”,我们需要减少“筛网”和“筛孔”的限制。美国有位美女,计划快速找到老公,她的做法就是放大“筛孔”,只要有约会机会,都不拒绝。当...
没有新药用?老药的排列组合也能治疗肿瘤
维罗非尼和阿西替尼可以有效减弱三种BRAF基因突变的结直肠癌细胞系的生长,但是在BRAF基因未突变的细胞系里,这些药物单独使用是无效的。比较三种药物的组合情况,维罗非尼和吡维氯铵联合,在大多数BRAF基因没有突变的肠癌细胞系里有活性;维罗非尼和阿西替尼组合,在BRAF基因没有突变的肠癌细胞里无活性。
PNAS | 宋宝兴博士开发针对农作物等复杂基因组的序列比对工具
1)很多亲缘关系较近的农作物和野生物种之间存在全基因组复制和染色体重新排列组合等差异。“多对多”或者“一对一”的基因组比对策略不符合已有的全基因组复制研究结果。2)基因组中很多保守的重要功能元件较短,比如转录因子结合位点的核心motif只有6-7bp。使用K-mer的启发式算法会丢失掉这部分序列。