青年博士Nature,Science双发,植物领域迎来史上“翻天覆地”的变化!
(2)回归算法:从线性回归、Logistic回归与Cox回归讲起;(3)PLS-DA算法:PCA降维后没有差异的数据还有救吗?(4)VIPscore的意义及选择;(5)分类算法:决策树,随机森林和贝叶斯网络模型;C2一组代谢组学数据的分类算法实现的R演练(1)数据解读;(2)演练与操作;C3无监督式机器学习在...
2023年David Baker团队连发5篇Nature和Science论文,开启AI蛋白质...
4.1实现k-means聚类和PCA降维:通过Python或R语言编写代码实现k-means聚类和PCA降维,并通过实际数据集练习这些技术。4.2使用t-SNE进行数据可视化:练习如何使用t-SNE技术对高维数据进行可视化表示。5.微生物群落相关性的网络分析实操5.1使用R包构建微生物关联网络:通过R语言的SpiecEasi包实践SparCc网络的构建。
再创新高!生命科学领域最新赛道,必将突破历史科研难题!
(4)分类算法:支持向量机,随机森林C4一组代谢组学数据的分类算法实现的R演练(1)数据解读;(2)演练与操作;第四天D1代谢组学数据清洗与R语言进阶(1)代谢组学中的t、fold-change和响应值;(2)数据清洗流程;(3)R语言tidyverse(4)R语言正则表达式;(5)代谢组学数据过滤;(6)代谢...
IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践
其中最具代表性的非聚类算法之一是DADA2,它是用R语言创建的。这使得R语言(Ihaka和Gentleman,1996)在扩增子测序的原始数据处理中占据了重要地位。与许多可用于微生物群落测序数据分析的上游步骤的软件相比,下游的分析步骤严重依赖于R语言和各种软件包。这些分析主要包括:1)多样性分析;2)差异分析;3)相关性和网络分析...
这篇中文文章可发几分SCI:基于肠道菌群和系统药理学探讨藏药十五...
基于Deblur算法对序列进行序列降噪和嵌合体去除,生成ASV特征表和特征序列。使用基于朴素贝叶斯算法的分类器对SILVA数据库进行物种分类数据集的构建,并使用该数据集对ASV特征序列进行物种注释。使用QIIME2对特征序列进行多重比对,并使用其内置的FastTree插件构建进化树。最后进行群落组成分析、α多样性...
视频| 论文最爱的变分自编码器( VAE),不了解一下?
在另一个教程中,第三部分,你将会使用你的探索性结果来预测一首歌曲的发布时间,更有趣的是,预测一首歌是否会基于它的歌词登入Billboard排行榜(www.e993.com)2024年9月17日。你将会使用机器学习工具,比如决策树(rPart和C50),K近邻(class)和朴素贝叶斯(e1071)来产生可接受文本的分类器。
Nature文献速读!多位生物医学领域“大牛”研究方法流出,学会这些...
代谢组学是通过比较对照组和实验组,以寻找代谢谱差异的研究方法,近年来,代谢组学在疾病诊断,病理研究,新药开发,药物毒理学,动植物、微生物,营养学等医学与人类健康和疾病密切相关的领域有着广泛的应用,在复杂数据中,人工智能算法用于生物标志物挖掘的组合是解决问题和实施健康科学新技术的常用方法。利用机器学习作为从...