上海交通大学医学院多组学测序分析比选公告

上海交通大学医学院多组学测序分析比选公告上海沪港建设咨询有限公司受上海交通大学医学院委托,根据《中华人民共和国政府采购法》等有关规定,现对上海交通大学医学院多组学测序分析进行其他招标,欢迎合格的供应商前来投标。项目名称:上海交通大学医学院多组学测序分析项目编号:F2024284(采购代理机构内部编号:24-工20...

行研|分子诊断系列:Sanger测序基因分析仪更广阔市场蓄势待发

第一代基因测序法即Sanger法测序，1977年Sanger引入ddNTP（双脱氧核苷三磷酸），发明了著名的双脱氧链终止法，又称“Sanger法”，于1980年与另外两名科学家共享诺贝尔化学奖。双脱氧链终止法有效控制了化学降解法中化学毒素和同位素的危害。根据核苷酸在某一固定的点开始，随机在某一个特定碱基处终止，且在每个碱基后面...

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

综合使用cDNA制备方法和直接RNA测序,结合多种平台的数据,LRGASP项目全面评估了各种实验方法和分析工具在不同挑战中的表现,提供了对当前实践的深入洞察和未来改进的建议。该研究的重要性在于它不仅为研究人员提供了长读长RNA测序技术在转录组分析中的实际应用指南,还为开发更高效的转录本检测和定量方法提供了有价值的参...

...找到揭秘微生物“生命暗物质”新方法【附基因测序行业现状分析】

自第一代DNA测序技术(Sanger法)问世以来,市场上已经出现了四代基因测序方法,但第三代和第四代技术仍处于起步阶段,尚未完全投入商用。自2005年以来,第二代基因测序技术引领行业快速发展,因其高通量、低成本和短测序时间等优势,至今仍在全球测序市场中占据主导地位。基因测序技术壁垒较高基因测序和细胞基因治疗(CGT)...

...等:1株牦牛乳源产细菌素融合魏斯氏菌ZW21全基因组测序及序列分析

本研究对W.confusaZW21的全基因组测序分析丰富了W.confusa的生物信息学数据库,后续可通过代谢组学的方法深入研究该菌株分泌大肠菌素及乳球菌素的代谢通路,探索其产生机制及其对致病菌的抑菌机理,并进一步对W.confusaZW21所产细菌素的安全性进行评估,为推进该菌株在食品保鲜及防腐方面的应用研究提供理论依据。

RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析

9例患者接受了≥1次重复活检,共分析了122个组织活检样本(www.e993.com)2024年11月18日。通过3个病例强调了该诊断方法的益处,并讨论了未来的意义。提出了一种诊断流程,其他医院也可将WES和RNAseq纳入常规淋巴瘤诊断中。本研究表明了将现代测序技术整合到儿童淋巴瘤常规诊断中的可行性,并讨论了机会。

...Cell | 王永成/樊龙江团队合作开发微生物组单细胞转录组测序技术

该研究建立了基于随机引物的高通量单细胞RNA测序技术及其数据分析方法,首次实现了复杂微生物组样本的高通量单细胞转录组测序与分析。通过对人类肠道菌群单细胞转录组测序与分析,揭示了人类肠道菌群的异质性,结合针对性的计算分析方法,实现了复杂微生物群落中的微生物注释和细菌-噬菌体转录活性分析,为人类微生物组研究提供...

Nature | 蛋白质测序技术突破:PASTOR单分子水平精准解读蛋白质...

01研究者开发了基于纳米孔技术的蛋白质分析平台PASTOR,可实现对长达数百个氨基酸的完整蛋白质链进行测序。02PASTOR技术能够识别单个氨基酸的突变以及蛋白质链上的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化。03为此,研究者开发了多次重读策略,通过引入滑动序列来允许蛋白质多次通过纳米孔,提高测序的准确性和信噪比。

【单细胞测序系列】转录+蛋白组protein-RNA single-cell analysis...

仅做mRNA测序分析,mTreg的CD86,CD80的mRNA没有显著表达10.活化TREG的CD80和CD86在mRNA水平没有表达,但在蛋白水平有显著变化(流式辅助验证)体外激活Treg流式细胞术验证单细胞蛋白组中发现的CD80、CD86在Treg活化分化上起关键作用。11.新群体的发现:循环CCR9+T细胞子集...

科学家打造空间转录组分析新工具,无需使用单细胞数据作为参考,能...

01美国哥伦比亚大学和美国斯隆—凯特林癌症研究所的研究人员开发出一款名为Starfysh的空间转录组分析工具,可在跨病人样本的前提下分析组织中基因表达的空间异质性。02与其他空间转录组方法相比,Starfysh无需使用单细胞数据作为参考,具有较好的灵活性,为分析罕见、难以匹配单细胞测序的数据提供了新方法。