模拟“提绳打水”,破解多肽纳米孔测序瓶颈
“核酸的纳米孔识别位点和酶的反应位点,有一个固定的约14—15个碱基的错位,这就形成了一个测序窗口,可以利用这个不受酶反应限制的窗口,实现测序。”黄硕说。纳米孔错位测序技术能否应用在多肽测序领域?在此次研究中,黄硕课题组将多肽和DNA嵌合成一条链条,嵌合链的DNA部分为“牵引链”,在检测过程中,DNA测序酶与D...
华大发布新型纳米孔基因测序仪,长短读长牵手捅破市场天花板
简单来讲,二代测序是将长的DNA碎片化,然后固定在不同材质表面做DNA扩增,从而放大信号强度,并使用不同荧光基团标记4种碱基,通过荧光信号来确定碱基序列。而纳米孔测序仪的工作原理,是由马达蛋白牵引单链DNA通过纳米尺寸的孔,记录不同碱基通过监测电流信号的变化,就可以确定过孔碱基的序列。在二代测序技术的开发...
合作Codexis,可合成400nt单链寡核苷酸,这家企业如何创新酶促DNA...
FES??是一种两步酶促DNA合成工艺,通过使用水溶性无毒试剂,以及最小化合成后纯化和处理等步骤,可以按需提供高纯度、序列特定的DNA。值得一提的是,FES??无需使用模板,即可扩展至更长的DNA序列。研发出全球首台全自动测序仪的ABI前高管联合创业Molecular由两位DNA测序行业专家——J.WilliamEfcavitch和CurtBecke...
Nature | 一种检测单链DNA突变的新方法:单分子测序
在这种方法应用中:1),增加了每条链的测序通过次数(DNA的中位大小为1.7kb,测序中位数是32);2)在文库准备过程中,通过ssDNA断口链接或者使用NanoSeqA-tailing方法进行末端加尾,或者使用无需加尾的方法,以去除实验过程中的非特异性信号;3)改进了计算机分析算法,以去除计算分析中带来的非特异...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
建库之后,单独的cDNA分子在流动槽中构建测序簇,使用3’阻断的荧光标记的核苷酸进行边合成边测序。在每一轮测序中,高速摄像机拍照捕获当前激发的荧光,来判断当前是哪个核苷酸合成进来,测序长度在50-500bp。ThePacificBiosciencesworkflow(中):建库之后,每个分子与固定在纳米孔底部的聚合酶结合。然后是边合成边测...
行研|分子诊断系列:Sanger测序基因分析仪更广阔市场蓄势待发
第三代基因测序技术也叫从头测序技术,即单分子实时DNA测序(www.e993.com)2024年10月18日。DNA测序时,不需要经过PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序。单分子实时荧光测序技术,应用了边合成边测序的思想,并以SMRT芯片为测序载体,芯片上有很多小孔,每个孔中均有DNA聚合酶。测序基本原理是:DNA聚合酶和模板结合,4色荧光标记4种碱基(即...
朱听课题组Nature Chemistry:镜像蛋白质测序
2024年1月18日,朱听课题组在NatureChemistry上发表论文Mirror-imagetrypsindigestionandsequencingofD-proteins(利用镜像胰蛋白酶实现镜像蛋白质的降解与测序)。研究者全化学合成了镜像胰蛋白酶,并利用该镜像蛋白酶降解、测序了多种镜像蛋白质,包括镜像核糖体蛋白质L25、镜像DNA聚合酶Dpo4及其Y12S突变体,并开发...
cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量
DNA去甲基化:除DNMT外,DNA去甲基化酶(如TET(10-11易位))也是DNA甲基化动态平衡的关键组成部分。TET酶可以从DNA中去除甲基,将5-mC转化为5hmC(5-羟甲基胞嘧啶),并参与DNA去甲基化过程。AID(activation-inducedcytidinedeaminase,活化诱导的胞嘧啶脱氨酶)和AB(Apobec)是脱氨酶,通常与DNA碱基脱氨和脱氧核糖修饰...
“寒冬”不冷,2023年国产基因测序仪企业融资超10亿!
普译生物生物成立于2021年,公司基于生物纳米孔DNA测序原理,以自主研发的纳米孔测序化学和解析的多种新型膜蛋白纳米孔原子水平的结构为基础,结合核酸化学、蛋白质工程、人工膜构建与表征、半导体集成电路芯片设计、深度学习及基因组学等技术,开发以生物纳米孔为基础的新一代核酸及其他生物聚合物测序仪与配套试剂耗材。目前...
生物制造产业周报(2024.8.23-8.29)
该平台由一款台式新型酶法合成仪器SyntaxSystem、试剂盒和管理软件组成。其中,SyntaxSystem是一种完全集成的自动化DNA打印机,可同时合成96个可直接用于基因组学和分子生物学研究的DNA寡核苷酸。据了解,SyntaxSystem是世界上第一台采用EDS技术的台式DNA打印机。