【技术交流】我国焦化场地地下水污染修复技术筛选方法及应用

主观赋权法以及综合赋权法.客观赋权法[17]虽然基于完善的数学理论,但忽略了决策者的主观信息.主观赋权法是由决策者(专家)根据经验进行主观判断从而对指标进行赋权的方法.但单个专家的判断结果未必客观,在实际应用时往往需要对多名专家进行调研,以此获得更为真实可用的数据[18],但如何综合多份数据...

Nat Methods | 链接基因变异与蛋白质序列和结构的强大生信工具:G2P

G2P具有两个模块:“基因/蛋白质查找”模块归纳了三个人类遗传变异数据库——基因组聚集数据库(gnomAD)、ClinVar和人类基因突变数据库(HGMD)的人类蛋白质变异,集合大量的人类蛋白质组资源,供用户探索转录本的遗传变异与蛋白质序列和结构的关系;“交互式映射”模块则为用户提供先进的数据分析工具和可视化工具,分析对...

科学家优化遗传变异筛选技术,推动疾病精准诊断

基因治疗的兴起使得寻找准确诊断更加关键,但由于生物数据库中非欧洲裔个体数据的不足,疑义变异的鉴定仍然存在困难。深度突变筛选,能够通过高通量功能测定生成对突变的功能评分。然而,深度突变筛选的高成本和复杂性限制了其广泛应用。已建立的饱和诱变方法如程序性等位基因系列(PALS)虽成本低,但是操作繁琐。此外,功能测...

...大学研究团队:高分子材料的智能制造平台——高分子材料基因...

文章特别强调了高分子材料的性能预估方法,包括性能代理量预测和机器学习性能预测。最后,讨论了高分子材料基因工程在先进复合材料、通信和集成电路等领域所亟需的高性能高分子材料创制方面的潜在工程应用前景。图高分子材料基因工程的挑战与前景。高分子数据库和基因、性能预测模型以及验证等问题仍有待通过跨学科研究来共同...

追问|科学家如何还原和挖掘海洋微生物基因数据?

在该研究构建的数据库中，研究团队对宏基因组数据进行了质量控制，并通过物种系统发育分析等方法提高分箱的准确性。他说，这样得来的MAGs能够代表海洋微生物的真实基因组，为理解微生物群落结构和功能提供了重要信息。基因组大小和免疫分布：基因视角下的海洋微生物群落通过对重构的基因组数据进行分析，该研究发现了一些...

Cell:马凯玥等开发高通量突变功能鉴定新方法

同时,基于上述生物技术方法的开发优化,研究团队采用SMuRF对FKRP及LARGE1的遗传突变进行功能研究(www.e993.com)2024年11月20日。与人类遗传变异数据库ClinVar及最大规模人类遗传变异体数据库gnomAD进行比较后,研究团队确认SMuRF打分与数据库中报道的变异临床分类和变异频率相符合。接着,研究团队通过整合8个患者队列发现SMuRF打分可以较好地反映FKRP相关疾病...

中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生

然而，基于序列聚类的方法存在一个问题，即聚类的结果会依赖于整个数据集，因此很难直接进行不同研究之间的比较。2013年，一种通过统计分析直接从测序数据中识别错误序列和正确序列的算法被提出，不再需要对序列的聚类，实现了不同数据集之间的直接比较。此外，为了整合不同的分析方法实现对16SrRNA基因扩增子测序数据的...

...综合症新机制,建立全基因组表观遗传学图谱,相关神经元数据库已...

使用时只需输入一个基因,就能探索表观基因组和蛋白质组数据库,从而揭示MECP2和RNA聚合酶II在选定基因的占位情况、染色质可及性、以及DNA甲基化状态。在这个网站上,刘毅还提供了一个详细的图表,里面列出了选定基因在正常神经元和雷特综合症神经元中的基因表达情况、以及分别与野生型MECP2和突变型...

代谢通路图绘制,Science/nature文章经典基因筛选思路!

5.MetMap的两种应用方案获认可,通路中虚线不用担忧,可为基因筛选提供思路;1.KEGG数据库最新情况分析截至到7月23日,KEGG在过去的一年内对数据库内的物质以及通路等均进行了更新,对于更新我们的重点主要放在植物相关通路。对KEGG官方网站上展示出来的更新记录进行分析,我们发现KEGG在过去一年内数据库内物质数量增加2...

PRGdb:植物R基因数据库

新版本的植物抗性基因数据库(PRGdb;httpprgdb/prgdb4/)为了跟上可用知识和数据数量的增长(蛋白质组测序、克隆基因、公开分析数据等)进行了扩展。数据库网站更新了预测工具,增加了更多的数据和新的部分。新的部分包含植物抗性转录组实验,提供额外的易于访问的实验信息。作为PRGdb背后植物抗性基因的自动标注和预...