2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
第一步:贝克依赖于他们开发的Rosetta蛋白质结构预测算法,可以预测氨基酸序列在形成蛋白质时可能采取的三维结构。第二步:利用这个工具,他们针对随机生成的一系列氨基酸序列进行结构预测,这些序列都是在自然界中未被观察到的。如果预测结果显示出合理的蛋白质结构,那么这条氨基酸序列就会被保留下来,反之则抛弃该序列。第...
中国科大iGEM代表队再创佳绩
中国科大软件队(USTC-sofware)项目是基于机器学习模型对蛋白质属性预测搭建了一个集合平台,如今机器学习在各个领域都有着显着的成果,并且在合成生物学领域也做出了极大贡献,例如能精准预测蛋白质三级结构的Alphafold2。但现在还缺乏一个用户友好且将这些模型整合在一起的工具。CAT(ConvenientandAccurateTool)集...
2025天津医科大学全国硕士研究生入学统一考试《618生物化学与分子...
1.蛋白质化学考试内容氨基酸的分类,20种常见氨基酸的简写符号氨基酸的酸碱化学性质和氨基酸的化学反应氨基酸混合物的分析分离蛋白质的化学组成和分类肽和肽段的结构及物化性质蛋白质分子的结构(一级、二级、高级结构的概念及形式)蛋白质一级结构的测定蛋白质的理化性质及蛋白质分离纯化蛋白质的含量测定和...
Nature Methods | 超过AlphaFold2精度,蛋白质互作结构预测新工具
定量的基准和双盲测试结果都表明,使用了DeepMSA2的结构预测算法DMFold可以构建远超AlphaFold2精度的蛋白质-蛋白质相互作用结构预测。二、方法简介DeepMSA2算法包括DeepMSA2-Monomer单体MSA构建算法和DeepMSA2-Multimer复合物MSA构建算法。对于蛋白质单体MSA构建(图4),该方法利用三个基于不同搜索策略构建的并行模块(dMSA...
分子量分布测定方法在化学交联质谱中的选择与应用
化学交联质谱结合分子量分布测定方法,为蛋白质结构研究提供重要数据。通过测定蛋白质的交联产物,可以推断蛋白质的二级和三级结构信息。4.2聚合物分析在聚合物领域,化学交联质谱是测定聚合物分子量分布的重要手段。这对于聚合物的合成和应用具有重要意义。
...Cell:AlphaFold2助力冷冻电镜,从精子中发现影响其运动的全新蛋白
在这项研究中,研究团队通过原位冷冻电子断层扫描电镜(cryo-ET)和亚断层扫描实现了小鼠和人类精子中轴丝微管结构平均高达6.0-??分辨率的重建(www.e993.com)2024年10月17日。这一高分辨率的蛋白质三级结构使研究团队能够无偏倚地将精子特异性与21615个AlphFold2预测的小鼠蛋白质组蛋白结构模型相匹配。从中发现了Tektin5、CCDC105和SPACA9是全...
诺禾致源2023年年度董事会经营评述
(实验功能模块、检测模块、数据分析模块、中控调度模块等),不同功能模块合理组合,实现五个多组学前处理实验流程(Labe-free、DIA、TMT三种蛋白定量样品和非靶向、类靶向两种代谢样品)的自动化、标准化作业;将蛋白酶解、脱盐、冻干、定量、标记、分馏、定量以及代谢样本萃取纯化等全流程整合一体,实现样本处理至质谱上机的...
最能跑AI推理的CPU!对话资深技术专家,内部架构硬核解读
在跑DeepMindAlphaFold2蛋白质结构预测模型时,基于AMX-BF16AI加速,至强CPU能实现比GPU更高的端到端推理性能。AlphaFold2模型的特点是参数非常高,GPU放不下,且只能放在主存里,会造成CPU和GPU频繁的交互,所以采用CPU要比GPU快很多,甚至达到几倍的提升。GPU的缓存不够,而通过重度优化CPU之后,将业务切分,并把CPU的...
华大基因2023年年度董事会经营评述
除列表中产品外,通过先进的测序与分析平台,公司多组学大数据服务还可提供非编码RNA、目标区域测序、表观基因组、基因分型、蛋白类产品、代谢类产品、免疫组库测序、基因组学数据库等产品。通过上述技术手段的集合,多组学大数据服务形成了一整套可贯穿的“组学”研究方法,可以为生物学研究提供全面系统的研究方案与生态链...
...比Meta ESMFold参数小! 许锦波团队完成蛋白质结构预测三级进化
单序列蛋白质结构预测将是行业发展的必然趋势,也是分子之心发展路线中的既定规划,”许锦波表示,分子之心团队已经在预测蛋白质结构方面实现了“三级进化”:从AI+共进化信息+序列谱开始,到仅使用AI+序列谱,再到纯AI方法,“分子之心将使用基于AI的单序列蛋白质结构预测方法,进一步扩大人类在蛋白质结构预测领域的探索...