国自然热点:铁死亡&DNA甲基化

细胞活力检测:常用的检测方法CCK-8和MTT;线粒体膜电位检测:通过流式的方法收集TMRE阳性细胞的比例来判断细胞是否发生铁死亡。分子水平检测:qPCR、WesternBlot检测细胞内相关因子的变化,关键明星分子:systemxc(SLC7A11和SLC3A2),GPX4,转铁蛋白,转铁蛋白受体1等。DNA甲基化常用检测方法甲基化特异性的PCR(met...

应斌武教授:肿瘤生物标志物及检测方法研究前沿

该研究团队招募接受PD-1/PD-L1抑制剂治疗的实体瘤患者进行随访研究,使用多重基因分型测定对18个基因的39个变异进行了基因分型,进行遗传变异与irAE以及无irAEs生存期之间的关联分析。结果发现,4种免疫遗传学变异与irAEs的发生有显著的相关性,其中,丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)rs3810610的C等位基因是一个风险预测...

cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量

DNMT能够与DNA结合并识别靶DNA序列,通常是CpG。一旦DNMT与靶DNA序列结合,它们就会将甲基从SAM供体转移到DNA中的胞嘧啶碱基。该过程涉及形成共价键,将甲基添加到胞嘧啶碱基的第五个碳原子上,产生5-mC。DNMT1(DNA甲基转移酶-1)作为维持DNMT,主要任务是在DNA复制和细胞分裂过程中维持DNA甲基化稳定性。DNMT1可以识别新...

DNA甲基化,作为植物分子生物学中一个重要机制,有着怎样的特点

编码EcoRIIDNA甲基转移酶的基因修饰了DNA序列CCWGG中的一个胞嘧啶,该序列包含一个CNG甲基化基序,这是植物DNA的特征。DNA甲基转移酶在复制后保持两个子DNA双链的甲基-cpg含量.甲基转移酶定位于染色体复制复合体,维持甲基化在复制后不到一分钟内发生。植物育种家非常关注的是,亲本植物中存在的甲基化模式是高度遗传...

Nat Genet | 利用饱和基因组编辑分析抑癌基因BAP1编码序列中99%的...

优化的SGE方法提高了实验质量研究团队开发了一种具有克隆衍生Cas9基因组整合的HAP1DNA连接酶4(LIG4)敲除(KO)系,并确认了其中BAP1的必要性(图1)、高Cas9活性和单倍体的稳健维持。研究团队还优化了质粒和转染协议,将HAP1细胞的转染效率从<5%提高到>60%。研究选择了五个时间点,以筛查BAP1的所有编码外显子:...

学习2024.V5版NCCN非小细胞肺癌指南,详解基因检测指导靶向治疗...

建议通过活检和/或血浆检测进行分子检测;同时或先后进行组织和血浆检测的组合是可接受的(www.e993.com)2024年11月22日。有证据表明,同时检测可缩短检测结果的时间,应根据临床情况考虑。一种方法的阴性结果(定义为无明确的驱动突变)提示可使用补充方法。建议对所有晚期或转移性非鳞状NSCLC(即腺癌、大细胞癌)和未另作规定的NSCLC患者进行EGFR、ALK、...

中国科学家首次克隆恒河猴活到成年!新技术可用人类辅助生殖

蒲慕明说，DNA甲基化是影响基因表达的重要发育过程，但在克隆胚胎中减少了，这导致胚胎发育不同。除此之外，母体基因印迹也消失了，这是发育过程中决定某些基因表达的关键步骤。论文中指出，研究人员发现了四个异常印记的基因，“它们可能在猴子SCNT胚胎的发育中起着关键作用”。为了改进恒河猴的克隆方法，他们增加了一...

RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析

免疫球蛋白(IG)或T细胞受体(TR)基因的克隆性是恶性淋巴瘤的标志,传统上通过EuroClonality/BIOMED-2多重PCR方法结合片段长度分析进行评估。最近的靶向NGS方法,可以深入了解单个克隆型序列的组成,有望更准确地评估克隆性,通过确立克隆关系,为了解和监测疾病提供更多机会。

HER2 变异形式有哪些?不同瘤种分别推荐何种检测方式?又如何判读?

不同的HER2变异检测方法各有不同。目前,免疫组织化学(IHC)法是检测HER2蛋白过表达的「金标准」,荧光原位杂交(FISH)法是检测HER2基因扩增的「金标准」,而二代测序(NGS)、Sanger测序、实时荧光定量PCR等则主要用于HER2突变检测,其中NGS技术不仅能够检测出几乎所有的HER2突变类型,而且能够检测HER...

乐土携手Sentieon推出一种高性能的低深度非UMI ctDNA分析流程

为了提高准确性并区分背景错误和真实体细胞变异,一些ctDNA检测方法在PCR扩增之前在模板DNA分子的末端引入了UniqueMolecularIdentifiers(UMIs)。这些带有独特标签的模板经历多次扩增和测序,使序列能够根据它们追踪回初始分子。然而,由于成本考虑,一些检测方法选择较低的测序深度,同时也不包含UMIs,特别是在肿瘤纯度相对较高...