第二届医学基因组系列交流会圆满举办,基因组学与AI技术新焦点
研究显示,通过分析2,000多种血浆蛋白丰度,研究人员已能识别与5,000多种罕见基因与蛋白质的关联。如今,遗传病、罕见病的诊断效率已显著提升,面对部分新的基因、特殊的结构变异、重复序列以及潜在剪接异常等因素导致的漏检问题,多组学技术,包括RNA、蛋白质组学和甲基化研究,正成为全外显子组和全基因组测序的重要...
【Nature Reviews】二级药理学的最新进展、及新药安全性影响综述
尽管公司之间在检测类型、浓度响应的使用等方面存在方法差异,但大多数接受调查的公司在先导化合物生成和/或先导化合物优化阶段都使用二级药理学分析小分子药物发现。大多数筛选的靶标(总共763个)被确定为野生型人类蛋白目标。尽管这个数字超过了Santos等人报道的市售药物靶向的667种人类蛋白质。它仅代表约4,...
Cell Metab | 喜讯!四川大学华西医院李涛等团队发现乙酸能改善...
组学方法:短链脂肪酸靶向代谢组检测,高通量靶向代谢组学分析,16SrRNA基因测序分析,血液蛋白质组学分析等;其他方法:ELISA,抗生素治疗,Westernblotting,qRT-PCR等;研究结果1.SF损害葡萄糖代谢和认知功能为了研究SF(Sleepfragmentation,碎片化睡眠,以睡眠结构紊乱为特征)对认知和代谢的影响,研究人员在成年雄性C5...
个体差异的源泉:解析单细胞蛋白质组学在生物药物开发中的关键性
单细胞蛋白质组学的技术方法主要包括质谱分析和细胞分离。在质谱分析方面,目前主要使用质谱仪联用液相色谱技术(LC-MS)进行蛋白质的检测和定量。这项技术能够高效地鉴定和定量单个细胞中的蛋白质,从而揭示个体差异的源泉。而在细胞分离方面,流式细胞术和微流控技术等方法可以实现对单个细胞的快速、准确分离,为后续的蛋...
TMT定量蛋白质组学:从多样本比较到差异蛋白筛选的关键步骤
三、TMT定量蛋白质组学的数据分析方法TMT定量蛋白质组学的数据分析包括质谱数据解析、差异蛋白筛选和功能注释等步骤。在质谱数据解析中,需要将质谱谱图与数据库中的蛋白质序列进行匹配,以确定每个肽段的鉴定和定量结果。差异蛋白筛选是TMT定量蛋白质组学的核心分析步骤,可以通过比较不同样本间的蛋白质表达水平,找出差...
...一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算方法
利用基于大规模并行图的聚类方法,我们将这些蛋白质归入了106,198个超过100个成员的新序列群,比利用相同方法从参考基因组聚类得到的蛋白质家族数量翻了一番(www.e993.com)2024年9月16日。我们根据这些家族的分类学、栖息地、地理分布和基因邻近分布对其进行了注释,并在有足够序列多样性的情况下预测了蛋白质的三维模型,揭示了新的结构。总之,...
中科院2区if5-昆明医科&锦州医科: 4D-DIA定量蛋白质组学揭示小檗...
BBR给药后8周,对各组视网膜进行光学相干断层扫描(OTC)照片和苏木精-伊红染色,然后收集视网膜进行4D-DIA定量蛋白质组学检测。此外,分别进行了差异蛋白分析、基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)途径、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以及分子对接。在实验部分,采用蛋白质印迹(WB)和免疫荧光染色来确认...
汇集结构质谱尖兵,开拓蛋白质结构生物学的新天地——第十四届质谱...
在12月12-15日即将召开的“第十四届质谱网络会(iCMS2023)”同期,特别新增了“结构质谱新方法”主题专场,来自全国的顶尖科学家团队将汇聚一堂,围绕氢/重氢交换质谱、化学交联质谱、原位质谱等前沿技术,报告他们在蛋白质结构生物学研究中的最新进展。本次主题会议的召开,恰逢结构质谱技术发展的重要机遇,必将推动该领域...
高强度间歇性运动前后高水平女子足球运动员尿液代谢组学特征研究
传统生物化学方法通常侧重于分析特定代谢物或代谢途径,聚焦于预先设定目标的变化趋势,无法揭示未知代谢物的变化情况。相比之下,代谢组学方法具有高通量性和高灵敏度,能够同时检测数百到数千种代谢物,对代谢物的浓度范围敏感且可捕捉微小的代谢变化,包括小分子代谢物、脂质、蛋白质代谢产物等,实现全方位了解生物体内的...
定量蛋白质组:揭示蛋白质组的量级与动态变化
一、定量蛋白质组学的原理定量蛋白质组学旨在测量不同样本中蛋白质的数量,并比较它们之间的表达差异。为了实现准确的定量,我们需要选择适当的定量方法和技术。常用的定量方法包括质谱定量、免疫检测和基因表达分析等。其中,质谱定量是最常用和广泛应用的技术之一,通过质谱仪器测量蛋白质片段的信号强度,来推断蛋白质...