乳酸化助力肿瘤研究!Nature/PNAS等顶刊"新宠"——乳酸化修饰在...
1.筛选重要的乳酸化调控位点:使用乳酸化蛋白质组学技术对样本中的蛋白质乳酸化位点进行定性定量检测,寻找实验组和对照组之间的差异乳酸化;中科新生命提供奥斯卡DIA乳酸化组产品,Astral质谱仪加持,检出位点突破19000;2.乳酸化位点的功能研究:可将赖氨酸(K)突变为精氨酸(R),构建功能缺失性突变。目前尚无模拟乳酸...
科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测
研究者首先在K562和Kasumi-1细胞系中同时对多达5种激活或抑制性组蛋白修饰(H3K27ac、H3K4me3、H3K4me1、H3K36me3和H3K27me3)进行检测,证明了uCoTarget实验的真实性、可靠性和稳定性。为了揭示转录因子和组蛋白修饰在造血干祖细胞产生过程中细胞命运决定的协同或异步作用,研究者结合体外分化模型,利用uCoTarget同时捕...
组蛋白的主要修饰类型:探索糖型鉴定在研究中的应用与前景
糖型鉴定是一种用于分析组蛋白修饰的方法。它通过检测组蛋白上的糖基化修饰来了解其结构和功能。糖型鉴定可以帮助研究人员深入了解组蛋白修饰的作用机制,并为药物研发和治疗提供新的思路。未来,随着糖型鉴定技术的不断发展,我们有望揭示更多组蛋白修饰的奥秘,并为生物药物领域的研究和应用带来新的突破。组蛋白的修饰...
人早期胚胎发育的表观遗传调控(染色质组蛋白修饰+DNA甲基化
发育过程中组蛋白修饰图谱绘制落后于其他表观遗传标记,主要是因为组蛋白分析方法通常需要数千~数百万个细胞,因此与可用胚胎细胞数量匹配。同时也已经开发出需要更少样本的方法,例如low-input染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、CUT&RUN和CUT&Tag,并已被用于生成第一个人类胚胎和其他物种的组蛋白修饰图。卵母细胞和早期...
中科大研究破译植物组蛋白特有修饰位点 调节拟南芥开花时间
如果组蛋白修饰包含了生物发育过程的信息,那么动、植物中或许存在组蛋白上特异的修饰位点,并调控着各自特有的生长发育进程。研究发现拟南芥的磷酸激酶MUT9P-LIKE-KINASE(MLK4)能够磷酸化组蛋白H2A第95位丝氨酸,该丝氨酸位点仅存在于部分藻类、以及陆生植物的苔藓、蕨类、祼子植物和被子植物中,而在酵母、果蝇、或哺乳...
多组学大数据与医学发展 | 科技导报|高通量|转录组|遗传学|生物学...
蛋白质的大规模研究主要通过质谱法、基于亲和力的蛋白质组检测、液相蛋白质芯片检测(www.e993.com)2024年7月25日。其中,质谱法被视为精确蛋白质检测和发现的金标准,而基于亲和力的蛋白质组检测可能是更具成本效益和可扩展性的定量选择。基于亲和力蛋白质组检测方法主要分为2类:基于抗体亲和的方法,以Olink公司为代表;基于适体亲和的方法,以SomaLogic...
...Cell | 何川团队开发单碱基分辨度的6mA修饰二代测序方法:DR-6...
同时,在所有文库的建立时还加入了携带一系列已知6mA修饰水平的人工合成短DNA(spike-inprobes),用于对基因组DNA上6mA修饰位点进行从错配率(mismatchratio)到修饰水平的标定(calibration)和换算。由于这种6mA检测方法不需要额外对6mA或者A进行任何处理或转变,直接用Bst2.0DNA聚合酶对基因组DNA进行“读取”即可,...
动脉粥样硬化中的DNA甲基化和组蛋白修饰及其表观遗传治疗视角
此外,炎症分子通路(如Toll样受体(TLR)、NF-κB和JAK/STAT信号通路)与表观遗传修饰相关(图1)。因此,更好地理解表观遗传在动脉粥样硬化发病机制中的作用具有巨大的潜在转化价值。图1:表观遗传修饰和TLR、NF-κB、JAK/STAT信号通路相关。TLRs由DNA甲基化、组蛋白修饰等调控,最终导致TLRs表达变化。TLR基因启动子区...
如何利用质谱技术解析组蛋白修饰的动态变化?
质谱定量组蛋白修饰的方法主要包括定量蛋白组学和定量磷酸化蛋白组学。定量蛋白组学可以通过比较不同样品中...
组蛋白修饰与肿瘤表观遗传
如果体内的组蛋白出现了异常,可能会在细胞内部大量堆积,从而引起细胞失去活性,也容易导致基因发生突变,进而增加肿瘤的风险。因此,如果有家族遗传史或直系亲属有肿瘤患者,个人一定要定期到医院进行检查,可以做血液检查、影像学检查等,能够明确是否存在肿瘤。患者确诊以后,可以通过手术切除病灶的方式进行治疗。如果存在恶变...