第四代基因测序技术——纳米孔测序
相比于其他传统测序方法,纳米孔测序真正意义上做到了动态实时测序,可边测序边输出结果,用户可以在测序早期了解样本的质量和状态,也可以在获得足够的数据后停止测序。同时,纳米孔测序技术测序所需的时长也远低于其他测序方法,可以节约操作时间,降低测序成本。设备简单便携目前较为常用的MinION测序仪,重量大约100克,长度...
【单细胞测序系列】BUFF叠满的粘膜相关不变T细胞(MAIT)检测:多色...
通过流式方法实现检测多个细胞表面marker,会有较高的检测难度。而通过带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时细胞表面marker和全转录组检测,所以本文在BDRhapsody平台上使用寡聚偶联抗体(Abseq)结合单细胞mRNA测序(scRNAseq)比较了29个表面蛋白的表达水平和259个mRNA检测。有助于加深对蛋白质生物学的理解,并...
蛋白质测序中常用的蛋白酶
一、胰蛋白酶(Trypsin)1、切割位点胰蛋白酶专一性地切割赖氨酸(K)和精氨酸(R)的羧基端。2、特点胰蛋白酶是最常用的蛋白酶之一,因为它切割的位点比较常见,生成的肽段长度适中,便于后续分析。3、应用广泛用于质谱分析和Edman降解等蛋白质测序方法。二、糖胺聚糖酶(Chymotrypsin)1、切割位点糖胺聚糖...
【单细胞测序系列】转录+蛋白组protein-RNA single-cell analysis...
1、流式分选的各亚类T细胞,在AbSeq测序后用AbSeqCD25和CD127做散点图呈现与流式细胞术一样的分布,说明AbSeq具备蛋白质测量的高灵敏度。2、幼稚和记忆标志物CD45RA和CD45RO只能在蛋白水平检测。CD4+T细胞功能分化的主要鉴别方式是获得对抗原反应的记忆表型,典型的特征是幼稚细胞上CD45RA和记忆细胞上CD45RO的...
首张人类蛋白质组测序草图绘成
科技日报北京10月20日电(记者刘霞)据物理学家组织网19日报道,在人类基因组图谱(人类生命的基因“蓝图”)发布20年后,国际人类蛋白质组组织宣布,他们绘制出了人类蛋白质组首张测序草图,有望帮助科学家更好地理解生命并治疗疾病。研究发表于最新一期《自然·通讯》杂志
热点剖析:RNA 修饰-m7G 发生机制及研究方法
i)原理:使用特异性抗体对m7G修饰的RNA进行免疫共沉淀,然后进行RNA测序(www.e993.com)2024年9月7日。ii)应用:适用于研究m7G修饰与特定蛋白质的相互作用,分析修饰对RNA功能的影响。MeRIP-seq(甲基化RNA免疫共沉淀测序):i)原理:使用抗m7G抗体进行甲基化RNA的富集,然后进行高通量测序。
...器团队合作开发不依赖于亚硫酸氢盐RNA m??C单碱基测序检测方法
目前RNAm5C修饰检测主要依赖于亚硫酸氢盐测序(bisulfitesequencing,BS-seq),在BS-seq中未修饰的胞嘧啶(C)被转变为尿嘧啶(U),而m5C保持不变,因此通过检测未转变C即可实现对于m5C修饰的鉴定。虽然BS-seq操作简单便捷,并且可以实现单碱基分辨率m5C修饰的定量检测,但是其存在三个主要不足之处:1)间接检测m5C,依赖于...
国自然思路:组学分析+单细胞测序探究肝-脑轴调控的认知功能障碍
作者通过转录组学分析、单细胞测序、蛋白质组学分析等手段发现外周apoE3对大脑发挥有益作用,而外周apoE4通过多种途径增加AD患病风险。作者阐明了脑血管功能的潜在apoE亚型依赖机制,未来还将探索具有特定apoE基因型(如apoE2/3和apoE3/3)的青年人血浆对apoE4模型小鼠认知功能的治疗潜力。
...methods》期刊封面 解码“生命天书” 成功破译蛋白质测序难题
团队发表了题为“Real-timedetectionof20aminoacidsanddiscriminationofpathologicallyrelevantpeptideswithfunctionalizednanopore”的研究论文,阐明纳米孔单分子检测新策略,实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分,提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序方法(简称NEPS),为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,...
号外| 陈鹏课题组与王初课题组合作开发蛋白质“扩增测序”新方法
在这项工作中,作者结合氨基酸特异的化学偶联反应、核酸定量扩增技术和计算机辅助的蛋白质指纹识别算法,开发了一种蛋白质“扩增测序”的新方法(AmproCode),为开发新一代的蛋白质测序方法提供了全新的思路。蛋白质是生命功能的基石,单分子、单细胞水平的蛋白质测序技术能够为科学研究带来突破性的进展,并推动人类疾病...