专家共识丨动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...
微生物高通量测序(High-throughputSequencing,HTS)方法主要包括全基因组测序、宏基因组测序、靶向测序。其中,宏基因组高通量测序技术不依赖于传统的微生物培养,无需特异性扩增,直接对临床样品中的核酸进行高通量测序,通过与数据库进行比对分析,根据比对到的序列信息来判断样品包含的病原微生物种类,能够快速、客观地检...
贝瑞基因:目前公司已建立涵盖建库测序、动植物基因组 De novo、动...
公司回答表示,投资者您好,目前公司已建立涵盖建库测序、动植物基因组Denovo、动植物基因组重测序、人基因组重测序、转录调控、单细胞转录组、空间转录组、空间蛋白组、微生物组学等几十种科研服务细分产品类型,深耕于肿瘤研究、遗传病研究、动植物研究、微生物研究和单细胞研究等多个科研领域,感谢您的关注。点击进...
Commun Biol | 循迹基因组差异,中国医学科学院宋经元团队研发植物...
该方法通过全基因组分析从目标植物的全基因组中筛选物种特异性靶标序列,结合基因组编辑系统来检测这些序列,实现了植物物种的准确鉴定。研究团队以经济价值高且入药易被混伪的植物番红花(Crocussativus)为研究对象分两步建立时珍法,生信分析方面基于番红花基因组(文章链接:httpssciencedirect/science/artic...
...中国药科大学李萍/陆续团队通过8种地锦草亚属植物的质体基因组...
其次,通过HPLC实验,初步鉴定出化学成分差异较大的部分物种。接着,将鉴定准确的植物进行质体基因组测序与比较分析,从ndhF序列中的Indel缺失序列开发了两对位点特异性引物(BD-ndhF和W-ndhF),建立了相应的qPCR和PCR位点特异性鉴别体系,成功将地锦草、斑地锦与其他混伪品区分。本研究创新的将传统鉴定方法与分子鉴定相结合...
...一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算方法
第一种方法是将测序读数精确地映射到一组已知的、有注释的参考基因组序列上,以提供已知生物、基因和潜在功能的快速概览。MG-RAST就是擅长这类分析的系统之一。在第二种方法中,将大量读数从头组装为contigs/scaffolds,可以为了解以前未被描述的生物体及其基因构成提供宝贵的信息。最近在组装和分选工具方面取得的技术进步...
辰山植物园药用植物与健康组发表黄芩T2T gap-free基因组
黄芩(图1A)拥有丰富的黄酮类化合物,具有良好的药物活性,作为药用植物在我国已有数千年使用历史(www.e993.com)2024年11月10日。高质量的基因组将为黄芩分子生物学及代谢生物学提供重要信息,然而,目前已报道的黄芩基因组仍存在大量的间隙(gap)和碱基错误,影响了后续基因功能的研究。本研究结合PacbioHiFi、ONTultra-long和Hi-C等测序技术...
全读长时代到来!华大成全球唯一拥有三种不同技术路径测序仪的机构
在科研领域,CycloneSEQ已经成功完成上千个物种的单菌组装图,并实现了多个动植物染色体级别参考基因组图谱的构建,其中包括首次完成鬃狮蜥Z染色体的完整解析,发现大量的转座单元和频繁重组区域,提示了这个物种潜在的性别决定机制。面对极端GC含量基因组等技术挑战,CycloneSEQ也能实现环状基因组的完整组装。作为深海测序仪系统...
用于生产源自中国传统药用植物的萜类化合物的酵母合成生物学
序列数据的组装和注释能够揭示测序物种的主要代谢途径以及大多数已知的次生代谢途径。然而,植物往往对同一生化反应具有多种相似的酶。特别是在次生代谢方面,众多相似或高度同源的酶促进了植物代谢产物的多样性。多组学数据有助于识别关键基因在倍半萜生物合成途径中的作用。大麻(Cannabissativa)的基因组和组织特异性表达...
【云飞杂记】真菌传之测序
扩增子测序就是通过对基因组目的区域进行PCR扩增,将目标区域DNA扩增富集后进行高通量测序的研究策略。真菌扩增子测序主要包括18SrDNA、ITS1、ITS2。20世纪80年代末,佩斯在老朋友乌斯的基础上发展出了新方法。通过提取微生物DNA并测序,研究出其遗传组成和群落功能。从此,人类有了一套完整理解地球生命的研究方法,可...
Nature | 转座酶辅助下的高效植物基因组整合技术—TATSI
植物转基因技术已经被广泛用于基础研究和作物改良,传统的转基因整合发生在基因组中的位置被认为是随机事件,可能引起意外的突变或存在位置效应,所以实现特异性靶位点的基因组整合需求急迫1,2。目前有多种方法可以实现特定位置的转基因插入,如同源重组技术(HR),但是HR在植物中的效率低下,一直未有较大突破3;可...