第四代基因测序技术——纳米孔测序
马达蛋白:在纳米孔测序文库构建时,需要在接头上连接一种马达蛋白,用于将DNA或RNA分子推入纳米孔中。连接臂:用于锚定DNA或RNA链,防止其在溶液中飘动,并使其进入纳米孔中。将人工合成的多聚物膜浸没在离子溶液中,膜上布满了由解旋酶和蛋白孔两部分组成的跨膜通道蛋白纳米孔,在膜两侧施加不同电压形成电压差,由于...
测序中国
NatMethods|何爱彬/舒绍坤团队开发同时检测药物基因组靶点与表观基因组的单细胞方法scEpiChem2024-07-2313:49Cell|章冰/高强团队合作泛癌蛋白基因组学研究,揭示癌症治疗潜在新靶点2024-07-1915:11NatCommun|基于长读长测序高分辨率解析完整端粒序列,揭示端粒与衰老、癌症等的新关联...
蛋白质测序中常用的蛋白酶
一、胰蛋白酶(Trypsin)1、切割位点胰蛋白酶专一性地切割赖氨酸(K)和精氨酸(R)的羧基端。2、特点胰蛋白酶是最常用的蛋白酶之一,因为它切割的位点比较常见,生成的肽段长度适中,便于后续分析。3、应用广泛用于质谱分析和Edman降解等蛋白质测序方法。二、糖胺聚糖酶(Chymotrypsin)1、切割位点糖胺聚糖...
热点剖析:RNA 修饰-m7G 发生机制及研究方法
RIP-seq(RNA免疫共沉淀测序):i)原理:使用特异性抗体对m7G修饰的RNA进行免疫共沉淀,然后进行RNA测序。ii)应用:适用于研究m7G修饰与特定蛋白质的相互作用,分析修饰对RNA功能的影响。MeRIP-seq(甲基化RNA免疫共沉淀测序):i)原理:使用抗m7G抗体进行甲基化RNA的富集,然后进行高通量测序。
【单细胞测序系列】BUFF叠满的粘膜相关不变T细胞(MAIT)检测:多色...
通过流式方法实现检测多个细胞表面marker,会有较高的检测难度。而通过带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时细胞表面marker和全转录组检测,所以本文在BDRhapsody平台上使用寡聚偶联抗体(Abseq)结合单细胞mRNA测序(scRNAseq)比较了29个表面蛋白的表达水平和259个mRNA检测。有助于加深对蛋白质生物学的理解,...
号外| 陈鹏课题组与王初课题组合作开发蛋白质“扩增测序”新方法
在这项工作中,作者结合氨基酸特异的化学偶联反应、核酸定量扩增技术和计算机辅助的蛋白质指纹识别算法,开发了一种蛋白质“扩增测序”的新方法(AmproCode),为开发新一代的蛋白质测序方法提供了全新的思路(www.e993.com)2024年9月7日。蛋白质是生命功能的基石,单分子、单细胞水平的蛋白质测序技术能够为科学研究带来突破性的进展,并推动人类疾病...
最大规模蛋白组学研究为早诊提供参考
以多发性骨髓瘤为例,根据新诊断患者骨髓样本的单细胞测序数据,用于蛋白质预测模型的5种蛋白质中有4种在其浆细胞中有特异性表达,也就可理解为何这些蛋白质具有强大的预测能力。研究者指出,利用蛋白质组学建立的这种预测方法具有疾病筛查的潜力,从而有望通过早发现、早干预来改善疾病的预后。不过,这种方法还需要在更...
...methods》期刊封面 解码“生命天书” 成功破译蛋白质测序难题
withfunctionalizednanopore”的研究论文,阐明纳米孔单分子检测新策略,实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分,提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序方法(简称NEPS),为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,展示出生物传感器技术与人工智能算法结合的优异潜力,代表我国生物传感技术与蛋白组学工具的原始创新能力进入全球前沿...
解码“生命天书”成功破译蛋白质测序难题
functionalizednanopore”的研究论文,阐明纳米孔单分子检测新策略,实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分,提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序(简称NEPS)方法,为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,展示出生物传感器技术与人工智能算法结合的优异潜力,代表我国生物传感技术与蛋白质组学工具的原始创新能力进入全球前沿方阵...
如何判断多囊肾患者的基因变异?
3.PKHD1基因:ARPKD则与PKHD1基因突变有关。PKHD1基因编码纤维连接蛋白(Fibrocystin),这种蛋白质在肾脏和肝脏的囊肿形成中起关键作用。三、PKD基因检测的重要性PKD基因检测在疾病的诊断、管理和家族规划中具有重要意义,具体体现在以下几个方面:1.确诊:虽然PKD的诊断可以通过影像学检查(如超声波、CT扫描或MRI)来...