你会用NCBI吗?丨如何查找各类数据库?
MeSH数据库存储的是美国国立医学图书馆用于检索PubMed文献所使用的受控词汇。MeSH术语提供了一个一致的检索方式使得我们对于一个概念对应多个术语的情况也能方便检索出来。httpsncbi.nlm.nih.gov/meshBookshelf数据库主要收集生物医学方面的书籍,这些书籍可直接通过在Entrez中的链接进行访问。httpsn...
大数据告诉你哪些基因参与Ⅱ型糖尿病的遗传
我们的新发现是所有科学家的“公共财产”,他们可以通过发表的论文、共享数据库(diagram-consortium)和门户网站(type2diabetesgenetics)来获取这些研究结果,还可以从信息数据库下载尽可能多的原始数据(如数据库dbGAP或EGA)。即使我们集中所有努力去发现新东西,对单个研究团队来说仍然有足够的研究空间,他...
加密“云”为个性化医疗铺平道路
例如美国国立卫生研究院的基因型和表型数据库(dbGaP)中的基因和医学数据便因为安全问题,而禁止使用这些数据的用户把数据储存到联网的计算机上。而同态加密则让这一问题得到解决,其方法是通过让科学家仅在云端储存在数学上打乱的(或称作为加密)形式的数据。这种方法包括在一台本地电脑上对数据进行加密,然后把打乱的数...
Nature: HeLa细胞争议圆满解决
最终,Lacks家族成员一致决定,他们同意公布这些基因组测序结果,不过这些数据必须保存在类似于NIH的dbGaP数据库这样的非公共数据库里,用户并不能随意进入数据库获取序列信息。在dbGaP数据库里收录的主要都是与性状或疾病相关的个体遗传差异信息。科研人员可以先提出申请,在承诺只用于生物医药研究工作,同时不会接触Lacks家族的...
海拉家族30年基因组数据之争尘埃落定
最后,该家族决定,他们希望数据在一个受限制的存储系统中可用,例如NIHdbGaP数据库。研究人员需要申请许可,以获取数据,并且要同意仅将数据用于生物医学研究。包括Lacks家族成员在内的一个委员会将处理这些要求,使用这些数据的论文也要承认HenriettaLacks和其后代的贡献。